為了揭示原始小球藻AP2基因家族編碼蛋白的理化特性、分子功能和遺傳進化特征,該文對原始小球藻AP2基因家族的蛋白成員進行了詳細的生物信息學預測和分析,并利用PrtoParam、Pfam 3. 20、Protscale等在線工具分析了原始小球藻AP2家族所包含的8個蛋白成員。結果表明:該家族成員含有的氨基酸數(shù)為247 （XP₀11395646.1）到715 （XP₀11401904.1）,理論等電點最大為9.39 （XP₀11396011.1）、最小為5.81 （XP₀11398158.1）;家族中各個成員所含有的保守結構域的位置和數(shù)量都各不相同;所有蛋白成員均無信號肽,均不包含跨膜螺旋,不具有跨膜區(qū)域;蛋白成員中最大親水性值為-3. 222（XP₀11398158.1）,最大疏水性值為2.333 （XP₀11401904.1）,且所有成員的平均親疏水性值均小于0;成員中有多個磷酸化位點值遠超標準值0.5,最大磷酸化位點值為0.998;該基因家族的蛋白成員二... 

【文章來源】：廣西植物. 2020,40(12)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：16 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 AP2轉錄因子基因的蛋白成員的一級結構和理化性質分析
        1.2.2 氨基酸的保守結構域、跨膜結構及信號肽分析
        1.2.3 氨基酸的親疏水性和磷酸化位點預測分析
        1.2.4 編碼蛋白的二級結構和三級結構預測分析
        1.2.5 保守基序分析
        1.2.6 同源性分析及進化樹分析
2 結果與分析
    2.1 AP2轉錄因子基因成員的一級結構和理化性質分析
    2.2 氨基酸保守結構域、信號肽和跨膜域結構分析
    2.3 氨基酸親疏水性預測分析
    2.4 磷酸化位點分析
    2.5 原始小球藻AP2轉錄因子編碼蛋白的二級結構和三級結構預測分析
    2.6 保守基序MEME分析
    2.7 同源性比對及進化樹分析
3 討論


【參考文獻】：
期刊論文
[1]薔薇科植物DELLA蛋白的生物信息學分析[J]. 宋偉,李鼎立,王然,原永兵,劉成連,馬春暉.  中國農學通報. 2013(19)
[2]玉米轉錄因子結構與功能研究進展[J]. 莫曉婷,趙軍,范云六,王磊.  中國農業(yè)科技導報. 2013(03)
[3]玉米LIM結構域蛋白基因家族分析[J]. 張海燕,李佐同,趙長江,楊克軍,王玉鳳,胡雪微,趙瑩.  玉米科學. 2013(03)
[4]“異養(yǎng)-脅迫”分段培養(yǎng)對原始小球藻生物量和油脂含量影響研究[J]. 汪桂林,桂小華,鄧偉,趙志良,姚杰,閆云君.  中國生物工程雜志. 2013(03)
[5]小麥F-box蛋白基因的電子克隆和生物信息學分析[J]. 王俊生,李俐俐,楊歡,譚光軒,殷貴鴻.  河南農業(yè)科學. 2013(02)
[6]植物AP2/ERF類轉錄因子研究進展[J]. 張計育,王慶菊,郭忠仁.  遺傳. 2012(07)
[7]一種基于Quartet Puzzling和鄰接法的進化樹構建算法[J]. 李建伏,郭茂祖,劉揚.  計算機研究與發(fā)展. 2008(11)

博士論文
[1]原始小球藻產油條件及油脂合成代謝調控的研究[D]. 桂小華.華中科技大學 2017

碩士論文
[1]中國櫻桃AP2/ERF轉錄因子在花芽休眠解除過程的表達與作用研究[D]. 王月.浙江師范大學 2017
[2]甘藍型油菜AP2亞家族轉錄因子及植物中WRI1的基因組學分析[D]. 王莉莉.西北農林科技大學 2016
[3]小蘭嶼蝴蝶蘭AP2/ERF基因家族生物信息學分析[D]. 朱光哲.中國林業(yè)科學研究院 2016
[4]煙草碳酸酐酶基因的克隆及其生物信息學分析[D]. 楊朗.四川農業(yè)大學 2015
[5]原始小球藻分段培養(yǎng)條件優(yōu)化及高附加值產物提取工藝研究[D]. 汪桂林.華中科技大學 2013
[6]紅火蟻毒素致敏原soli1、soli4基因的克隆及表達[D]. 夏巧玉.西南大學 2007



本文編號：3152953