為了揭示原始小球藻AP2基因家族編碼蛋白的理化特性、分子功能和遺傳進(jìn)化特征,該文對(duì)原始小球藻AP2基因家族的蛋白成員進(jìn)行了詳細(xì)的生物信息學(xué)預(yù)測(cè)和分析,并利用PrtoParam、Pfam 3. 20、Protscale等在線工具分析了原始小球藻AP2家族所包含的8個(gè)蛋白成員。結(jié)果表明:該家族成員含有的氨基酸數(shù)為247 （XP₀11395646.1）到715 （XP₀11401904.1）,理論等電點(diǎn)最大為9.39 （XP₀11396011.1）、最小為5.81 （XP₀11398158.1）;家族中各個(gè)成員所含有的保守結(jié)構(gòu)域的位置和數(shù)量都各不相同;所有蛋白成員均無(wú)信號(hào)肽,均不包含跨膜螺旋,不具有跨膜區(qū)域;蛋白成員中最大親水性值為-3. 222（XP₀11398158.1）,最大疏水性值為2.333 （XP₀11401904.1）,且所有成員的平均親疏水性值均小于0;成員中有多個(gè)磷酸化位點(diǎn)值遠(yuǎn)超標(biāo)準(zhǔn)值0.5,最大磷酸化位點(diǎn)值為0.998;該基因家族的蛋白成員二... 

【文章來(lái)源】：廣西植物. 2020,40(12)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：16 頁(yè)

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 AP2轉(zhuǎn)錄因子基因的蛋白成員的一級(jí)結(jié)構(gòu)和理化性質(zhì)分析
        1.2.2 氨基酸的保守結(jié)構(gòu)域、跨膜結(jié)構(gòu)及信號(hào)肽分析
        1.2.3 氨基酸的親疏水性和磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)分析
        1.2.4 編碼蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)分析
        1.2.5 保守基序分析
        1.2.6 同源性分析及進(jìn)化樹(shù)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 AP2轉(zhuǎn)錄因子基因成員的一級(jí)結(jié)構(gòu)和理化性質(zhì)分析
    2.2 氨基酸保守結(jié)構(gòu)域、信號(hào)肽和跨膜域結(jié)構(gòu)分析
    2.3 氨基酸親疏水性預(yù)測(cè)分析
    2.4 磷酸化位點(diǎn)分析
    2.5 原始小球藻AP2轉(zhuǎn)錄因子編碼蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)分析
    2.6 保守基序MEME分析
    2.7 同源性比對(duì)及進(jìn)化樹(shù)分析
3 討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]薔薇科植物DELLA蛋白的生物信息學(xué)分析[J]. 宋偉,李鼎立,王然,原永兵,劉成連,馬春暉.  中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2013(19)
[2]玉米轉(zhuǎn)錄因子結(jié)構(gòu)與功能研究進(jìn)展[J]. 莫曉婷,趙軍,范云六,王磊.  中國(guó)農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報(bào). 2013(03)
[3]玉米LIM結(jié)構(gòu)域蛋白基因家族分析[J]. 張海燕,李佐同,趙長(zhǎng)江,楊克軍,王玉鳳,胡雪微,趙瑩.  玉米科學(xué). 2013(03)
[4]“異養(yǎng)-脅迫”分段培養(yǎng)對(duì)原始小球藻生物量和油脂含量影響研究[J]. 汪桂林,桂小華,鄧偉,趙志良,姚杰,閆云君.  中國(guó)生物工程雜志. 2013(03)
[5]小麥F-box蛋白基因的電子克隆和生物信息學(xué)分析[J]. 王俊生,李俐俐,楊歡,譚光軒,殷貴鴻.  河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(02)
[6]植物AP2/ERF類轉(zhuǎn)錄因子研究進(jìn)展[J]. 張計(jì)育,王慶菊,郭忠仁.  遺傳. 2012(07)
[7]一種基于Quartet Puzzling和鄰接法的進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建算法[J]. 李建伏,郭茂祖,劉揚(yáng).  計(jì)算機(jī)研究與發(fā)展. 2008(11)

博士論文
[1]原始小球藻產(chǎn)油條件及油脂合成代謝調(diào)控的研究[D]. 桂小華.華中科技大學(xué) 2017

碩士論文
[1]中國(guó)櫻桃AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子在花芽休眠解除過(guò)程的表達(dá)與作用研究[D]. 王月.浙江師范大學(xué) 2017
[2]甘藍(lán)型油菜AP2亞家族轉(zhuǎn)錄因子及植物中WRI1的基因組學(xué)分析[D]. 王莉莉.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[3]小蘭嶼蝴蝶蘭AP2/ERF基因家族生物信息學(xué)分析[D]. 朱光哲.中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2016
[4]煙草碳酸酐酶基因的克隆及其生物信息學(xué)分析[D]. 楊朗.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[5]原始小球藻分段培養(yǎng)條件優(yōu)化及高附加值產(chǎn)物提取工藝研究[D]. 汪桂林.華中科技大學(xué) 2013
[6]紅火蟻毒素致敏原soli1、soli4基因的克隆及表達(dá)[D]. 夏巧玉.西南大學(xué) 2007



本文編號(hào)：3152953