苯酚脅迫下多刺裸腹溞實時定量PCR內(nèi)參基因的篩選
發(fā)布時間:2021-04-21 23:08
為研究苯酚脅迫下多刺裸腹溞(Moina macrocopa)相關(guān)基因的表達(dá)情況,篩選用于實時定量PCR分析的最佳內(nèi)參基因。利用內(nèi)參基因表達(dá)的cycle threshold(Ct值)非參數(shù)檢驗、GeNorm、NormFinder和BestKeeper四種方法對β-actin、16S rRNA和12S rRNA進(jìn)行分析,篩選出苯酚脅迫下多刺裸腹溞表達(dá)相對穩(wěn)定的內(nèi)參基因。結(jié)果顯示,從Ct值初步判定不同濃度苯酚脅迫后,多刺裸腹溞體內(nèi)β-actin、16S rRNA和12S rRNA均可穩(wěn)定表達(dá),且穩(wěn)定性順序為:16S rRNA>12S rRNA>β-actin,從GeNorm軟件分析顯示內(nèi)參基因的穩(wěn)定性順序為:16S rRNA=β-actin>12S rRNA, NormFinder和Bestkeeper分析顯示的穩(wěn)定性順序均為:16S rRNA>β-actin>12S rRNA;谝陨纤姆N方法對三個候選內(nèi)參基因的篩選,確定了16S rRNA作為多刺裸腹溞實時定量PCR的最佳內(nèi)參基因,有助于提高qRT-PCR分析的準(zhǔn)確性,為進(jìn)一步研究苯酚脅迫多刺裸腹溞后目的基因...
【文章來源】:水生生物學(xué)報. 2020,44(01)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實驗動物
1.2 實驗方法
2 結(jié)果
2.1 總RNA質(zhì)量檢測和內(nèi)參基因目的片段的擴(kuò)增
2.2 實時定量PCR分析
2.3 內(nèi)參基因表達(dá)的穩(wěn)定性分析
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]大白菜-結(jié)球甘藍(lán)易位系實時熒光定量PCR內(nèi)參基因的篩選[J]. 崔菲菲,孟川,王彥華,趙建軍,陳雪平,申書興,顧愛俠. 華北農(nóng)學(xué)報. 2018(05)
[2]RNA質(zhì)量對內(nèi)參基因選擇和qRT-PCR結(jié)果評價的影響[J]. 霍雪萍,張琳萍,趙向絨,劉勤社,王海芳. 生物技術(shù)通訊. 2018(03)
[3]菲律賓蛤仔不同發(fā)育時期及成體不同組織中內(nèi)參基因篩選[J]. 牟政強(qiáng),閆路路,王化敏,霍忠明,閆喜武. 水產(chǎn)學(xué)報. 2018(05)
[4]豬IGF1、EGFR、EGF、β-actin基因熒光定量PCR標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立[J]. 徐環(huán)葉,曹玲芝,劉博,陳立功,孟利佳,崔歡,庫爾瓦尼古麗·伊明江,董世山. 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2017(05)
[5]藜科植物藜和灰綠藜實時熒光定量PCR內(nèi)參基因的選擇[J]. 劉艷霞,蘭欣欣,曹婧,張晶華,蘭海燕. 廣西植物. 2016(12)
[6]實時熒光定量PCR檢測皺紋盤鮑Δ5脂肪酸去飽和酶基因表達(dá)方法的建立及應(yīng)用[J]. 李明珠,麥康森,何艮,艾慶輝,徐瑋,張文兵. 水生生物學(xué)報. 2014(02)
[7]水稻缺素脅迫下實時熒光定量RT-PCR的內(nèi)參基因的選擇[J]. 魏毅東,陳玉,郭海萍,謝華安,張建福,王宗華. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2013(11)
[8]溴氰菊酯對多刺裸腹溞急性毒性及解毒代謝的影響[J]. 彭方,王茜,王蘭. 水生生物學(xué)報. 2013(03)
[9]植物實時熒光定量PCR內(nèi)參基因的選擇[J]. 胡瑞波,范成明,傅永福. 中國農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報. 2009(06)
[10]Validation of Zebrafish (Danio rerio) Reference Genes for Quantitative Real-time RT-PCR Normalization[J]. Andrew DODD,Daniel LA,Warren C. MCNABB,Donald R. LOVE. Acta Biochimica et Biophysica Sinica. 2007(05)
碩士論文
[1]枝角類衰老相關(guān)蛋白基因和表皮蛋白基因的克隆及表達(dá)分析[D]. 劉阿靜.華東師范大學(xué) 2014
[2]擬穴青蟹免疫相關(guān)基因的克隆及內(nèi)參基因的適用性分析[D]. 房婭博.上海海洋大學(xué) 2013
[3]蚤狀溞生殖轉(zhuǎn)化相關(guān)功能基因Chk1和Hsp90的克隆與表達(dá)分析[D]. 鄒秀.寧波大學(xué) 2013
本文編號:3152665
【文章來源】:水生生物學(xué)報. 2020,44(01)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實驗動物
1.2 實驗方法
2 結(jié)果
2.1 總RNA質(zhì)量檢測和內(nèi)參基因目的片段的擴(kuò)增
2.2 實時定量PCR分析
2.3 內(nèi)參基因表達(dá)的穩(wěn)定性分析
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]大白菜-結(jié)球甘藍(lán)易位系實時熒光定量PCR內(nèi)參基因的篩選[J]. 崔菲菲,孟川,王彥華,趙建軍,陳雪平,申書興,顧愛俠. 華北農(nóng)學(xué)報. 2018(05)
[2]RNA質(zhì)量對內(nèi)參基因選擇和qRT-PCR結(jié)果評價的影響[J]. 霍雪萍,張琳萍,趙向絨,劉勤社,王海芳. 生物技術(shù)通訊. 2018(03)
[3]菲律賓蛤仔不同發(fā)育時期及成體不同組織中內(nèi)參基因篩選[J]. 牟政強(qiáng),閆路路,王化敏,霍忠明,閆喜武. 水產(chǎn)學(xué)報. 2018(05)
[4]豬IGF1、EGFR、EGF、β-actin基因熒光定量PCR標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立[J]. 徐環(huán)葉,曹玲芝,劉博,陳立功,孟利佳,崔歡,庫爾瓦尼古麗·伊明江,董世山. 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2017(05)
[5]藜科植物藜和灰綠藜實時熒光定量PCR內(nèi)參基因的選擇[J]. 劉艷霞,蘭欣欣,曹婧,張晶華,蘭海燕. 廣西植物. 2016(12)
[6]實時熒光定量PCR檢測皺紋盤鮑Δ5脂肪酸去飽和酶基因表達(dá)方法的建立及應(yīng)用[J]. 李明珠,麥康森,何艮,艾慶輝,徐瑋,張文兵. 水生生物學(xué)報. 2014(02)
[7]水稻缺素脅迫下實時熒光定量RT-PCR的內(nèi)參基因的選擇[J]. 魏毅東,陳玉,郭海萍,謝華安,張建福,王宗華. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2013(11)
[8]溴氰菊酯對多刺裸腹溞急性毒性及解毒代謝的影響[J]. 彭方,王茜,王蘭. 水生生物學(xué)報. 2013(03)
[9]植物實時熒光定量PCR內(nèi)參基因的選擇[J]. 胡瑞波,范成明,傅永福. 中國農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報. 2009(06)
[10]Validation of Zebrafish (Danio rerio) Reference Genes for Quantitative Real-time RT-PCR Normalization[J]. Andrew DODD,Daniel LA,Warren C. MCNABB,Donald R. LOVE. Acta Biochimica et Biophysica Sinica. 2007(05)
碩士論文
[1]枝角類衰老相關(guān)蛋白基因和表皮蛋白基因的克隆及表達(dá)分析[D]. 劉阿靜.華東師范大學(xué) 2014
[2]擬穴青蟹免疫相關(guān)基因的克隆及內(nèi)參基因的適用性分析[D]. 房婭博.上海海洋大學(xué) 2013
[3]蚤狀溞生殖轉(zhuǎn)化相關(guān)功能基因Chk1和Hsp90的克隆與表達(dá)分析[D]. 鄒秀.寧波大學(xué) 2013
本文編號:3152665
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