檸條錦雞兒WRKY轉(zhuǎn)錄因子的篩選及功能初步分析
發(fā)布時間:2021-04-09 19:36
檸條錦雞兒是豆科植物,生長在荒漠或半荒漠地區(qū),具有降血脂,抗氧化以及抗癌等生物學作用,同時,對環(huán)境的生態(tài)適應性較高,抗逆性極強,具有重要的研究價值和經(jīng)濟價值。為了挖掘檸條錦雞兒中抗旱相關(guān)基因資源,實驗室前期構(gòu)建了苗期干旱處理的cDNA文庫并進行了高通量測序。通過生物信息學分析發(fā)現(xiàn)了49個干旱上調(diào)表達基因,其中包含了6個WRKY轉(zhuǎn)錄因子。在此基礎上,本研究以擬南芥Col-0生態(tài)型為受體材料,通過構(gòu)建表達載體、轉(zhuǎn)化擬南芥、獲得轉(zhuǎn)基因擬南芥純合株系和干旱相關(guān)表型測定,獲得了如下研究結(jié)果:(1)將6個WRKY轉(zhuǎn)錄因子的序列和擬南芥基因組數(shù)據(jù)庫進行比對,根據(jù)序列的同源性比對結(jié)果將6個WRKY轉(zhuǎn)錄因子分別命名為CkWRKY2,CkWRKY4,CkWRKY20,CkWRKY23,CkWRKY51和CkWRKY75。這些基因的cDNA編碼區(qū)全長分別為1614bp,1386bp,1527bp,1107bp,618bp和951bp,分別編碼537個,461個,508個,368個,205個和316個氨基酸。根據(jù)WRKY結(jié)構(gòu)域數(shù)目和鋅指結(jié)構(gòu)類型,將6個WRKY轉(zhuǎn)錄因子分為3類,其中,CkWRKY2,CkWRK...
【文章來源】:海南師范大學海南省
【文章頁數(shù)】:75 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
WRKY轉(zhuǎn)錄因子的分類(文鋒等,2017)
圖 1.2 一個月大苗齡檸條錦雞兒干旱處理前后表型及高通量測序差異基因(a)圖為干旱處理前后植株表型變化;(b)圖為干旱植株較未干旱植株結(jié)果。Figure 1.2 Graph showing the difference between phenotype and high-thrsequencing after drought treatment in Caragana korshinskii . (a) the phechanges of plants before and after drought treatment.; (b) the sequencing redrought plants compared with non-drought plants.1.6 研究目的及意義WRKY 轉(zhuǎn)錄因子是一大類調(diào)節(jié)蛋白,它們在響應生物和非生物脅迫重要的作用(Guo et al., 2018)。WRKY 家族還是一類高度保守的轉(zhuǎn)錄因子(a) (b)
海南師范大學碩士學位論文多序列比對采用 geneDoc(下載地址:https://github.com/karlnicholas/GeneDo軟件比對,構(gòu)建系統(tǒng)進化樹使用 MEGA7.0 軟件。2.2.2.3 植物 WRKY 結(jié)構(gòu)域的保守性分析利用 geneDoc 進行 WRKY 多序列比對,比對結(jié)果進行 WRKY 結(jié)構(gòu)域的保守性分析。2.2.3 構(gòu)建表達載體2.2.3.1 雙酶切獲得載體骨架本研究選用 35S-Red-Kan,采用 In-Fusion 同源重組構(gòu)建植物表達載體。用限制性內(nèi)切酶 EcoRI 和 XmaI 對 35S-Red-Kan 載體質(zhì)粒進行雙酶切。獲得雙酶切骨架,回收骨架用于目的片段的連接。
本文編號:3128198
【文章來源】:海南師范大學海南省
【文章頁數(shù)】:75 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
WRKY轉(zhuǎn)錄因子的分類(文鋒等,2017)
圖 1.2 一個月大苗齡檸條錦雞兒干旱處理前后表型及高通量測序差異基因(a)圖為干旱處理前后植株表型變化;(b)圖為干旱植株較未干旱植株結(jié)果。Figure 1.2 Graph showing the difference between phenotype and high-thrsequencing after drought treatment in Caragana korshinskii . (a) the phechanges of plants before and after drought treatment.; (b) the sequencing redrought plants compared with non-drought plants.1.6 研究目的及意義WRKY 轉(zhuǎn)錄因子是一大類調(diào)節(jié)蛋白,它們在響應生物和非生物脅迫重要的作用(Guo et al., 2018)。WRKY 家族還是一類高度保守的轉(zhuǎn)錄因子(a) (b)
海南師范大學碩士學位論文多序列比對采用 geneDoc(下載地址:https://github.com/karlnicholas/GeneDo軟件比對,構(gòu)建系統(tǒng)進化樹使用 MEGA7.0 軟件。2.2.2.3 植物 WRKY 結(jié)構(gòu)域的保守性分析利用 geneDoc 進行 WRKY 多序列比對,比對結(jié)果進行 WRKY 結(jié)構(gòu)域的保守性分析。2.2.3 構(gòu)建表達載體2.2.3.1 雙酶切獲得載體骨架本研究選用 35S-Red-Kan,采用 In-Fusion 同源重組構(gòu)建植物表達載體。用限制性內(nèi)切酶 EcoRI 和 XmaI 對 35S-Red-Kan 載體質(zhì)粒進行雙酶切。獲得雙酶切骨架,回收骨架用于目的片段的連接。
本文編號:3128198
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