水稻Aux/IAA基因家族進(jìn)化分析及OsIAA23基因功能的鑒定
發(fā)布時(shí)間:2021-04-02 10:33
生長(zhǎng)素/吲哚-3-乙酸(Aux/IAA)基因家族在植物生長(zhǎng)素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)中扮演著重要的角色。其與植物細(xì)胞的伸長(zhǎng)、分裂與分化、向光性及重力性、根和芽的發(fā)生等植物生理生化過程都密切相關(guān)。該基因家族及其各自的功能在擬南芥中有比較詳盡的研究,但在水稻這種全球性重要糧食作物中的研究相對(duì)較少。本文通過對(duì)水稻Aux/IAA基因家族進(jìn)化與群體遺傳學(xué)的分析,試圖系統(tǒng)性地探討水稻中Aux/IAA家族基因的進(jìn)化過程,進(jìn)而對(duì)其功能進(jìn)行驗(yàn)證,為水稻高產(chǎn)育種提供理論支撐。Aux/IAA基因家族屬于生長(zhǎng)素響應(yīng)基因家族,其編碼的短壽命核蛋白包含四個(gè)高度保守的結(jié)構(gòu)域(結(jié)構(gòu)域Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ)。我們的研究表明,水稻Aux/IAA基因家族中共有31個(gè)成員;通過群體遺傳學(xué)方法,引入394個(gè)不同品系的水稻的基因組數(shù)據(jù),系統(tǒng)比較不同生態(tài)型樣本中Aux/IAA同源基因序列的核苷酸多樣性、非同義/同義突變比等遺傳多態(tài)性指標(biāo)。計(jì)算結(jié)果表明:基因OsIAA2,OsIAA23和OsIAA27的CDS區(qū)域顯示出相對(duì)較高的遺傳多態(tài)性(≥2‰),而基因OsIAA2,OsIAA22,OsIAA23和OsIAA29在其結(jié)構(gòu)域II中檢測(cè)到了強(qiáng)烈的正選擇。以...
【文章來源】:南京大學(xué)江蘇省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:78 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1典型的Aux/IAA蛋白的結(jié)構(gòu)域1281
種植物的Au以IAA基因和ARF基因系統(tǒng)進(jìn)化樹
圖3.1本研究中使用的載體。A:載體pOs-sgRNA;?B:載體p丨丨-Ubi-cas9-7??試劑準(zhǔn)備:??LB?培養(yǎng)基(1?L>:蛋白胨(TRYPTONE)?10?g:酵母粉(YEAST?EXTRACT)?5?g;??NaCl?10?g:加水至1000?mL,調(diào)節(jié)pH至7.0,如需要固體培養(yǎng)基則加入瓊脂糖??(Agarose)約16?g,高溫高壓滅菌冷卻后,根據(jù)需要加入一定量50?mg/mL卡那霉??素(終濃度50?mg/L)或一定量50?mg/mL壯觀霉素和一定量50?mg/mL鏈霉素(終??濃度均為50mg/L),分裝至皿。??50?mg/mL卡那霉素(20?mL):稱取卡那霉素粉末1?g,溶于20?mL?ddH2〇中,??過濾除菌,分裝到1.5?mL離心管,-20?°C冰箱冷凍保存。??50?mg/mL壯觀霉素(20?mL):稱取壯觀霉素粉末1?g,溶于20?mL?ddH20中,??過濾除菌,分裝到1.5?mL離心管,-20?°C冰箱冷凍保存。??5〇1^尬鏈霉素(2〇1111):稱取鏈霉素粉末18,溶于2〇1111^出0中,過??°
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]生長(zhǎng)素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)研究進(jìn)展[J]. 馮寒騫,李超. 生物技術(shù)通報(bào). 2018(07)
[2]植物AUX/IAA基因家族研究進(jìn)展[J]. 李俊男,燕曉杰,李樞航,張榮沭. 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2018(15)
[3]基于高通量測(cè)序的植物群體基因組學(xué)研究進(jìn)展[J]. 王云生. 遺傳. 2016(08)
[4]A Gain-of-Function Mutation in IAA7/AXR2 Confers Late Flowering under Short-day Light in Arabidopsis[J]. Yan-Xia Mai1,Long Wang1 and Hong-Quan Yang2 1National Key Laboratory of Plant Molecular Genetics,Institute of Plant Physiology and Ecology,Shanghai Institutes for Biological Sciences,the Chinese Academy of Sciences,Shanghai 200032,China 2Plant Science Institute,School of Agriculture and Biology,Shanghai Jiaotong University,Shanghai 200240,China. Journal of Integrative Plant Biology. 2011(06)
本文編號(hào):3115118
【文章來源】:南京大學(xué)江蘇省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:78 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1典型的Aux/IAA蛋白的結(jié)構(gòu)域1281
種植物的Au以IAA基因和ARF基因系統(tǒng)進(jìn)化樹
圖3.1本研究中使用的載體。A:載體pOs-sgRNA;?B:載體p丨丨-Ubi-cas9-7??試劑準(zhǔn)備:??LB?培養(yǎng)基(1?L>:蛋白胨(TRYPTONE)?10?g:酵母粉(YEAST?EXTRACT)?5?g;??NaCl?10?g:加水至1000?mL,調(diào)節(jié)pH至7.0,如需要固體培養(yǎng)基則加入瓊脂糖??(Agarose)約16?g,高溫高壓滅菌冷卻后,根據(jù)需要加入一定量50?mg/mL卡那霉??素(終濃度50?mg/L)或一定量50?mg/mL壯觀霉素和一定量50?mg/mL鏈霉素(終??濃度均為50mg/L),分裝至皿。??50?mg/mL卡那霉素(20?mL):稱取卡那霉素粉末1?g,溶于20?mL?ddH2〇中,??過濾除菌,分裝到1.5?mL離心管,-20?°C冰箱冷凍保存。??50?mg/mL壯觀霉素(20?mL):稱取壯觀霉素粉末1?g,溶于20?mL?ddH20中,??過濾除菌,分裝到1.5?mL離心管,-20?°C冰箱冷凍保存。??5〇1^尬鏈霉素(2〇1111):稱取鏈霉素粉末18,溶于2〇1111^出0中,過??°
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]生長(zhǎng)素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)研究進(jìn)展[J]. 馮寒騫,李超. 生物技術(shù)通報(bào). 2018(07)
[2]植物AUX/IAA基因家族研究進(jìn)展[J]. 李俊男,燕曉杰,李樞航,張榮沭. 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2018(15)
[3]基于高通量測(cè)序的植物群體基因組學(xué)研究進(jìn)展[J]. 王云生. 遺傳. 2016(08)
[4]A Gain-of-Function Mutation in IAA7/AXR2 Confers Late Flowering under Short-day Light in Arabidopsis[J]. Yan-Xia Mai1,Long Wang1 and Hong-Quan Yang2 1National Key Laboratory of Plant Molecular Genetics,Institute of Plant Physiology and Ecology,Shanghai Institutes for Biological Sciences,the Chinese Academy of Sciences,Shanghai 200032,China 2Plant Science Institute,School of Agriculture and Biology,Shanghai Jiaotong University,Shanghai 200240,China. Journal of Integrative Plant Biology. 2011(06)
本文編號(hào):3115118
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