基于mtDNA全序列的噪鹛科部分鳥(niǎo)類(lèi)的系統(tǒng)進(jìn)化
發(fā)布時(shí)間:2021-03-25 00:58
噪鹛科鳥(niǎo)類(lèi)來(lái)自于雀形目一目中的原來(lái)的畫(huà)眉科。原來(lái)的畫(huà)眉科所包含的鳥(niǎo)類(lèi)俗稱(chēng)畫(huà)眉,其物種相互間的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系大多都是未知或有爭(zhēng)議的,噪鹛科中的鳥(niǎo)類(lèi)也不例外。本實(shí)驗(yàn)采用LA-PCR,引物步移法,以及測(cè)序得到大草鹛(Garrulax waddelli)(英文名:Giant Babax)、山噪鹛(Garrulax davidi)(英文名:Plain Laughingthrush)、灰腹噪鹛(Trochalopteron henrici)(英文名:Brown-cheeked Laughingthrush)和橙翅噪鹛(Trochalopteron elliotii)(英文名:Elliot’s Laughingthrush)的mtDNA全序列;分別對(duì)這4種鳥(niǎo)類(lèi)的mtDNA序列長(zhǎng)度、堿基含量、蛋白編碼基因(PCGs)、核糖體RNA基因(rRNA genes)、轉(zhuǎn)運(yùn)RNA基因(tRNA genes),以及D-loop區(qū)進(jìn)行分析;同時(shí)使用這4種鳥(niǎo)類(lèi)mtDNA序列,及從NCBI中獲得的草鹛屬、噪鹛屬及彩翼噪鹛屬的10種鳥(niǎo)類(lèi)與2種相思鳥(niǎo)屬鳥(niǎo)類(lèi),共16種噪鹛科鳥(niǎo)類(lèi)的mtDNA全序列和它們序列中的13/12個(gè)蛋白編...
【文章來(lái)源】:蘭州大學(xué)甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:85 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
鳥(niǎo)類(lèi)mtDNA的基因排列順序(Singh,2008)
和D-loop1(圖3-1)。圖 3-1 橙翅噪鹛 mtDNA 的基因圖譜Fig 3-1 The gene map of Trochalopteron elliotii mtDNA
22圖 3-2 橙翅噪鹛 mtDNA 的 tRNA 二級(jí)結(jié)構(gòu)Fig 3-2 The tRNA secondary structure of Trochalopteron elliotii mtDNA3.1.6 控制區(qū)橙翅噪鹛 mtDNA 中有 2 個(gè) D-loop 區(qū),又稱(chēng)為非編碼區(qū)或者控制區(qū)。D-loop1長(zhǎng) 1,135 bp,A+T 的含量為 53.57%;D-loop2長(zhǎng) 1,162 bp,A+T 的含量為 54.73%。經(jīng) NCBI Blast 比對(duì)發(fā)現(xiàn),這兩個(gè)控制區(qū)的相似度達(dá)到 100%。D-loop1分布于tRNAThr和 tRNAPro之間,D-loop2分布于 tRNAGlu和 tRNAPhe之間。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]北京地區(qū)山噪鹛繁殖巢記述[J]. 鄭光美. 動(dòng)物學(xué)雜志. 2016(05)
[2]鶯總科鳥(niǎo)類(lèi)的系統(tǒng)分類(lèi)進(jìn)展評(píng)述(英文)[J]. Per ALSTRM,Urban OLSSON,雷富民. Chinese Birds. 2013(02)
[3]甘肅卓尼橙翅噪鹛繁殖生態(tài)報(bào)道[J]. 蔣迎昕,朱永智,孫悅?cè)A. 四川動(dòng)物. 2007(03)
[4]雀形目15種鳥(niǎo)類(lèi)CoⅠ與Cyt b基因序列的比較[J]. 梁剛,張衛(wèi),雷富民,尹祚華,黃原,李天憲. 動(dòng)物分類(lèi)學(xué)報(bào). 2007(03)
[5]山西蘆芽山自然保護(hù)區(qū)山噪鹛的生態(tài)觀察[J]. 吳麗榮. 四川動(dòng)物. 2005(04)
[6]山西歷山黑臉噪鹛的生態(tài)習(xí)性觀察[J]. 劉榮,賈紅衛(wèi),寧建友. 動(dòng)物學(xué)雜志. 2002(01)
[7]鷹科四種鳥(niǎo)類(lèi)線(xiàn)粒體DNA的差異和分子進(jìn)化關(guān)系的研究[J]. 李慶偉,田春宇,李爽. 遺傳. 2001(06)
[8]橙翅噪鹛的生態(tài)觀察[J]. 劉煥金,薛紅忠. 野生動(dòng)物. 1999(01)
[9]山噪鹛繁殖習(xí)性的觀察[J]. 楊向明,李世廣. 動(dòng)物學(xué)雜志. 1998(02)
[10]山噪鹛繁殖習(xí)性初步觀察[J]. 田德雨,仝英. 山西林業(yè)科技. 1998(01)
碩士論文
[1]鶇屬九種鳥(niǎo)線(xiàn)粒體基因組全序列比較及系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系[D]. 江波.蘭州大學(xué) 2018
[2]倉(cāng)鼠屬物種線(xiàn)粒體基因組特征及系統(tǒng)發(fā)生[D]. 丁勵(lì).蘭州大學(xué) 2017
[3]部分雀形目鳥(niǎo)類(lèi)的CoⅠ和Cytb基因序列測(cè)定及其系統(tǒng)發(fā)育研究[D]. 熊偉.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
本文編號(hào):3098726
【文章來(lái)源】:蘭州大學(xué)甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:85 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
鳥(niǎo)類(lèi)mtDNA的基因排列順序(Singh,2008)
和D-loop1(圖3-1)。圖 3-1 橙翅噪鹛 mtDNA 的基因圖譜Fig 3-1 The gene map of Trochalopteron elliotii mtDNA
22圖 3-2 橙翅噪鹛 mtDNA 的 tRNA 二級(jí)結(jié)構(gòu)Fig 3-2 The tRNA secondary structure of Trochalopteron elliotii mtDNA3.1.6 控制區(qū)橙翅噪鹛 mtDNA 中有 2 個(gè) D-loop 區(qū),又稱(chēng)為非編碼區(qū)或者控制區(qū)。D-loop1長(zhǎng) 1,135 bp,A+T 的含量為 53.57%;D-loop2長(zhǎng) 1,162 bp,A+T 的含量為 54.73%。經(jīng) NCBI Blast 比對(duì)發(fā)現(xiàn),這兩個(gè)控制區(qū)的相似度達(dá)到 100%。D-loop1分布于tRNAThr和 tRNAPro之間,D-loop2分布于 tRNAGlu和 tRNAPhe之間。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]北京地區(qū)山噪鹛繁殖巢記述[J]. 鄭光美. 動(dòng)物學(xué)雜志. 2016(05)
[2]鶯總科鳥(niǎo)類(lèi)的系統(tǒng)分類(lèi)進(jìn)展評(píng)述(英文)[J]. Per ALSTRM,Urban OLSSON,雷富民. Chinese Birds. 2013(02)
[3]甘肅卓尼橙翅噪鹛繁殖生態(tài)報(bào)道[J]. 蔣迎昕,朱永智,孫悅?cè)A. 四川動(dòng)物. 2007(03)
[4]雀形目15種鳥(niǎo)類(lèi)CoⅠ與Cyt b基因序列的比較[J]. 梁剛,張衛(wèi),雷富民,尹祚華,黃原,李天憲. 動(dòng)物分類(lèi)學(xué)報(bào). 2007(03)
[5]山西蘆芽山自然保護(hù)區(qū)山噪鹛的生態(tài)觀察[J]. 吳麗榮. 四川動(dòng)物. 2005(04)
[6]山西歷山黑臉噪鹛的生態(tài)習(xí)性觀察[J]. 劉榮,賈紅衛(wèi),寧建友. 動(dòng)物學(xué)雜志. 2002(01)
[7]鷹科四種鳥(niǎo)類(lèi)線(xiàn)粒體DNA的差異和分子進(jìn)化關(guān)系的研究[J]. 李慶偉,田春宇,李爽. 遺傳. 2001(06)
[8]橙翅噪鹛的生態(tài)觀察[J]. 劉煥金,薛紅忠. 野生動(dòng)物. 1999(01)
[9]山噪鹛繁殖習(xí)性的觀察[J]. 楊向明,李世廣. 動(dòng)物學(xué)雜志. 1998(02)
[10]山噪鹛繁殖習(xí)性初步觀察[J]. 田德雨,仝英. 山西林業(yè)科技. 1998(01)
碩士論文
[1]鶇屬九種鳥(niǎo)線(xiàn)粒體基因組全序列比較及系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系[D]. 江波.蘭州大學(xué) 2018
[2]倉(cāng)鼠屬物種線(xiàn)粒體基因組特征及系統(tǒng)發(fā)生[D]. 丁勵(lì).蘭州大學(xué) 2017
[3]部分雀形目鳥(niǎo)類(lèi)的CoⅠ和Cytb基因序列測(cè)定及其系統(tǒng)發(fā)育研究[D]. 熊偉.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
本文編號(hào):3098726
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