為了從雨生紅球藻中獲得感知藍(lán)光信號的植物類型隱花色素（CRY）序列,采用同源克隆和RACE相結(jié)合的方法獲得了雨生紅球藻編碼植物類型Hae-P-CRY的c DNA全長,并對其序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明,Hae-P-CRY基因的c DNA全長為3 608 bp,包含開放閱讀框全長2 988 bp,編碼995個氨基酸,預(yù)測等電點6.19,理論分子質(zhì)量為107.7 ku。經(jīng)Blast P分析發(fā)現(xiàn),Hae-P-CRY氨基酸序列與萊茵衣藻來源植物類型Cre CRY氨基酸序列的相似性達(dá)到66.6%,與擬南芥CRY氨基酸序列相似性為46.94%。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,Hae-P-CRY與其他真核綠藻來源的植物型CRY聚在一支,屬于植物類型CRY。結(jié)構(gòu)域分析表明,Hae-P-CRY基因含有光感知PHR結(jié)構(gòu)域和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)CCT結(jié)構(gòu)域,暗示具有感知和轉(zhuǎn)導(dǎo)光信號功能。試驗從雨生紅球藻得到植物類型Hae-P-CRY基因序列,可為其表達(dá)、功能及互作蛋白研究奠定基礎(chǔ),同時為進(jìn)一步解析雨生紅球藻在藍(lán)光響應(yīng)中的分子機(jī)制奠定基礎(chǔ)。 

【文章來源】：山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(05)

【文章頁數(shù)】：6 頁

【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 試驗材料
        1.1.1 材料
        1.1.2 試劑
        1.1.3 儀器
    1.2 試驗方法
        1.2.1 總RNA的提取
        1.2.2 模板的制備
        1.2.3 引物設(shè)計
        1.2.4 同源片段的獲得
        1.2.5 c DNA全長的獲得
        1.2.6 生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 雨生紅球藻總RNA提取
    2.2 雨生紅球藻Hae-P-CRY基因cDNA序列的獲得
    2.3 雨生紅球藻Hae-P-CRY的理化性質(zhì)分析
    2.4 雨生紅球藻Hae-P-CRY的二級結(jié)構(gòu)分析
    2.5 雨生紅球藻Hae-P-CRY結(jié)構(gòu)域和序列比對分析
    2.6 雨生紅球藻Hae-P-CRY的起源和系統(tǒng)進(jìn)化
3 討論
4 結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]擬南芥ZTL/FKF1/LKP2蛋白家族功能研究進(jìn)展[J]. 曾冰潔,閻晉東,楊飄,周娟,李新梅,趙小英.  生物信息學(xué). 2019(03)
[2]紫蘇二酰甘油�；D(zhuǎn)移酶基因（PfDGAT1）鑒定及表達(dá)分析[J]. 周雅莉,任文燕,郝月茹,安茜,段露露,李潤植,王計平.  山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(05)
[3]籽粒莧優(yōu)質(zhì)貯藏蛋白AhAMA1基因功能分析[J]. 趙熙寧,張飛,岳敏,安茜,宋亞楠,季春麗,崔紅利,李潤植.  山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(05)
[4]光受體介導(dǎo)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)調(diào)控植物開花研究進(jìn)展[J]. 馬朝峰,戴思蘭.  植物學(xué)報. 2019(01)
[5]玉米隱花色素CRY1b和CRY2基因轉(zhuǎn)錄豐度對不同光質(zhì)處理的響應(yīng)[J]. 李紅丹,閆蕾,孫蕾,樊曉聰,陳士瞻,張燕,郭林,游光霞,李莊,楊宗舉,蘇亮,楊建平.  作物學(xué)報. 2018(09)
[6]藍(lán)光受體ZTLs家族調(diào)控植物光周期途徑研究進(jìn)展[J]. 景藝峰,趙淑靚,劉青青,楊敏,王翠玲.  核農(nóng)學(xué)報. 2018(07)
[7]埃氏小球藻對11種抗生素的敏感性[J]. 王亞君,周廣航,季春麗,薛金愛,李潤植.  山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(03)
[8]種子感光的機(jī)理及影響種子感光性的因素[J]. 楊期和,宋松泉,葉萬輝,殷壽華.  植物學(xué)通報. 2003(02)



本文編號：3093207