黃瓜AGL15-like基因的克隆及功能分析
發(fā)布時間:2021-03-20 23:39
MADS-box是一個轉(zhuǎn)錄因子基因家族,在植物生長發(fā)育過程中起著非常重要的作用。AGAMOUS-like15(AGL15-like)是MADS-box基因家族中的一個亞家族,在植物體細胞胚胎發(fā)生、花器官轉(zhuǎn)變、葉片和果實發(fā)育等過程中的作用尤為明顯;然而AGL15-like基因在黃瓜(Cucumis sativus L.)中的研究未見報道,克隆黃瓜AGL15-like基因并對其進行功能研究,有助于闡明黃瓜花器官發(fā)育的分子機理。本研究從黃瓜中克隆了擬南芥AtAGL15和AtAGL18的直系同源基因CsMADS25和CsMADS26,并對它們進行了生物信息學(xué)和表達特性分析。此外,通過構(gòu)建CsMADS25和CsMADS26基因的過表達載體并遺傳轉(zhuǎn)化擬南芥,通過分析轉(zhuǎn)基因擬南芥的形態(tài)學(xué)觀察來對這兩個基因的功能進行研究,主要的結(jié)果如下:(1)CsMADS25基因的開放閱讀框(ORF)長度為810 bp,編碼269個氨基酸。CsMADS26基因的開放閱讀框長度為669 bp,編碼222個氨基酸。CsMADS25和CsMADS26均屬親水的酸性蛋白,含MADS-box轉(zhuǎn)錄因子的MADS和K功能域以及多個...
【文章來源】:江西農(nóng)業(yè)大學(xué)江西省
【文章頁數(shù)】:76 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
花器官發(fā)育的四聚體模型圖
第一章 文獻綜述中最為保守的區(qū)域,也是所有MADS-box基因共有的唯一區(qū)域,,有些可能存在蛋白質(zhì) N 端附近,是特殊的結(jié)合基元,主要參向平行的α-螺旋基元所形成的特定的二聚體結(jié)構(gòu)而與 DNA 小溝新的α-螺旋 DNA 結(jié)合結(jié)構(gòu)[33]。K 結(jié)構(gòu)域是由 70 個氨基酸形成的是一個卷曲螺旋的結(jié)構(gòu),又細分為 3 個α-螺旋 K1,K2,K3,分別水殘基組成,可以調(diào)節(jié)蛋白間的相互作用,預(yù)測這些殘基將形成互作用所需的兩親性螺旋,是植物 MADS-box 轉(zhuǎn)錄因子的特征序的結(jié)構(gòu)基元[35]。I 結(jié)構(gòu)域是含有親水殘基的不穩(wěn)定區(qū)域,具有低35 個氨基酸組成,位于 M 域與 K 域之間。但預(yù)計會形成一個α螺的特異性和二聚體化[15]。C 端結(jié)構(gòu)域位于 K 域下游,約由 30 個高度保守的。但 C 端可以包含特定的基序,包括一些很重要的氨激活、翻譯后修飾或蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)相互作用等。有一些植物蛋含一段附加的 N 末端殘基。
技術(shù)路線圖
【參考文獻】:
期刊論文
[1]牦牛Lkb1基因編碼區(qū)克隆及其在骨骼肌的表達分析[J]. 雷召雄,柏雪,林亞秋,李鍵,字向東,熊顯榮,熊燕. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2019(01)
[2]灰氈毛忍冬LmPAL1基因的克隆及表達分析[J]. 陳勛,劉暢宇,陳婭,龍雨青,童巧珍,劉湘丹,周日寶. 中草藥. 2019(01)
[3]巨桉EXP基因家族的生物信息學(xué)分析[J]. 詹妮,謝耀堅,陳鴻鵬,劉果. 林業(yè)科學(xué)研究. 2018(06)
[4]北京地區(qū)犬冠狀病毒的分離鑒定及遺傳進化分析[J]. 王靜,秦彤,由欣月,劉暢,史利軍,梁琳,李金祥,崔尚金. 中國獸醫(yī)科學(xué). 2019(01)
[5]玉米脫水素基因家族的鑒定與分析[J]. 趙陽,王玉,蔡慧林,程備久,馬慶. 安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2015(05)
[6]小金海棠ferritin基因的克隆和表達分析[J]. 盧彬彬,王憶,殷麗麗,張新忠,韓振海. 核農(nóng)學(xué)報. 2013(02)
[7]黃瓜果實發(fā)育早期Aux/IAA家族部分基因的差異表達分析[J]. 王壘,婁麗娜,閆立英,婁群峰,陳勁楓. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2011(04)
[8]植物MADS-box基因FRUITFULL(FUL)研究進展[J]. 褚婷婷,謝華,徐勇,馬榮才. 中國生物工程雜志. 2010(09)
[9]黃瓜花的性別決定[J]. 張菊平. 生物學(xué)通報. 2009(06)
[10]控制花器官發(fā)育的ABCDE模型[J]. 叢楠,程治軍,萬建民. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2007(07)
博士論文
[1]植物雙組分信號系統(tǒng)調(diào)控雌配子體發(fā)育的研究及其相關(guān)基因家族在白菜中的鑒定、進化和表達分析[D]. 劉振寧.浙江大學(xué) 2016
[2]水稻CCT家族基因功能驗證,OsMADS3新等位基因突變機制的研究[D]. 張莉.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[3]牡丹開花與衰老的生理生化機制研究[D]. 史國安.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[4]雜交鵝掌楸體細胞胚胎發(fā)生標(biāo)志基因克隆及表達分析[D]. 魏丕偉.南京林業(yè)大學(xué) 2009
碩士論文
[1]茶樹CsDEF基因克隆及AP3/DEF基因系統(tǒng)進化分析[D]. 秋夢穎.陜西師范大學(xué) 2015
[2]水稻OsRboh1基因的表達模式分析與遺傳轉(zhuǎn)化初步研究[D]. 劉秋圓.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]擬南芥AP2/ERF基因ERF055調(diào)控莖端分生組織發(fā)育的功能研究[D]. 滕飛.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]轉(zhuǎn)錄因子AtMYB44促進擬南芥抗病耐熱及抑制開花的作用[D]. 田雙梅.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[5]文心蘭花發(fā)育相關(guān)基因的cDNA-AFLP差異顯示及表達分析[D]. 龔茂江.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2011
[6]擬南芥LEAFY及龍眼LEAFY同源基因轉(zhuǎn)化雪柑研究[D]. 王會全.福建農(nóng)林大學(xué) 2009
本文編號:3091878
【文章來源】:江西農(nóng)業(yè)大學(xué)江西省
【文章頁數(shù)】:76 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
花器官發(fā)育的四聚體模型圖
第一章 文獻綜述中最為保守的區(qū)域,也是所有MADS-box基因共有的唯一區(qū)域,,有些可能存在蛋白質(zhì) N 端附近,是特殊的結(jié)合基元,主要參向平行的α-螺旋基元所形成的特定的二聚體結(jié)構(gòu)而與 DNA 小溝新的α-螺旋 DNA 結(jié)合結(jié)構(gòu)[33]。K 結(jié)構(gòu)域是由 70 個氨基酸形成的是一個卷曲螺旋的結(jié)構(gòu),又細分為 3 個α-螺旋 K1,K2,K3,分別水殘基組成,可以調(diào)節(jié)蛋白間的相互作用,預(yù)測這些殘基將形成互作用所需的兩親性螺旋,是植物 MADS-box 轉(zhuǎn)錄因子的特征序的結(jié)構(gòu)基元[35]。I 結(jié)構(gòu)域是含有親水殘基的不穩(wěn)定區(qū)域,具有低35 個氨基酸組成,位于 M 域與 K 域之間。但預(yù)計會形成一個α螺的特異性和二聚體化[15]。C 端結(jié)構(gòu)域位于 K 域下游,約由 30 個高度保守的。但 C 端可以包含特定的基序,包括一些很重要的氨激活、翻譯后修飾或蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)相互作用等。有一些植物蛋含一段附加的 N 末端殘基。
技術(shù)路線圖
【參考文獻】:
期刊論文
[1]牦牛Lkb1基因編碼區(qū)克隆及其在骨骼肌的表達分析[J]. 雷召雄,柏雪,林亞秋,李鍵,字向東,熊顯榮,熊燕. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2019(01)
[2]灰氈毛忍冬LmPAL1基因的克隆及表達分析[J]. 陳勛,劉暢宇,陳婭,龍雨青,童巧珍,劉湘丹,周日寶. 中草藥. 2019(01)
[3]巨桉EXP基因家族的生物信息學(xué)分析[J]. 詹妮,謝耀堅,陳鴻鵬,劉果. 林業(yè)科學(xué)研究. 2018(06)
[4]北京地區(qū)犬冠狀病毒的分離鑒定及遺傳進化分析[J]. 王靜,秦彤,由欣月,劉暢,史利軍,梁琳,李金祥,崔尚金. 中國獸醫(yī)科學(xué). 2019(01)
[5]玉米脫水素基因家族的鑒定與分析[J]. 趙陽,王玉,蔡慧林,程備久,馬慶. 安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2015(05)
[6]小金海棠ferritin基因的克隆和表達分析[J]. 盧彬彬,王憶,殷麗麗,張新忠,韓振海. 核農(nóng)學(xué)報. 2013(02)
[7]黃瓜果實發(fā)育早期Aux/IAA家族部分基因的差異表達分析[J]. 王壘,婁麗娜,閆立英,婁群峰,陳勁楓. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2011(04)
[8]植物MADS-box基因FRUITFULL(FUL)研究進展[J]. 褚婷婷,謝華,徐勇,馬榮才. 中國生物工程雜志. 2010(09)
[9]黃瓜花的性別決定[J]. 張菊平. 生物學(xué)通報. 2009(06)
[10]控制花器官發(fā)育的ABCDE模型[J]. 叢楠,程治軍,萬建民. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2007(07)
博士論文
[1]植物雙組分信號系統(tǒng)調(diào)控雌配子體發(fā)育的研究及其相關(guān)基因家族在白菜中的鑒定、進化和表達分析[D]. 劉振寧.浙江大學(xué) 2016
[2]水稻CCT家族基因功能驗證,OsMADS3新等位基因突變機制的研究[D]. 張莉.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[3]牡丹開花與衰老的生理生化機制研究[D]. 史國安.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[4]雜交鵝掌楸體細胞胚胎發(fā)生標(biāo)志基因克隆及表達分析[D]. 魏丕偉.南京林業(yè)大學(xué) 2009
碩士論文
[1]茶樹CsDEF基因克隆及AP3/DEF基因系統(tǒng)進化分析[D]. 秋夢穎.陜西師范大學(xué) 2015
[2]水稻OsRboh1基因的表達模式分析與遺傳轉(zhuǎn)化初步研究[D]. 劉秋圓.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]擬南芥AP2/ERF基因ERF055調(diào)控莖端分生組織發(fā)育的功能研究[D]. 滕飛.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]轉(zhuǎn)錄因子AtMYB44促進擬南芥抗病耐熱及抑制開花的作用[D]. 田雙梅.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[5]文心蘭花發(fā)育相關(guān)基因的cDNA-AFLP差異顯示及表達分析[D]. 龔茂江.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2011
[6]擬南芥LEAFY及龍眼LEAFY同源基因轉(zhuǎn)化雪柑研究[D]. 王會全.福建農(nóng)林大學(xué) 2009
本文編號:3091878
本文鏈接:http://sikaile.net/projectlw/swxlw/3091878.html
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