本研究以小球藻（Chlorella sorokiniana）葉綠體基因組序列為材料,選取其中以ATG為起始密碼子且長于300 bp的38條非重復(fù)編碼序列為研究對象,利用CodonW、CUSP、Excel等軟件分析其密碼子使用特征。結(jié)果表明,小球藻葉綠體基因組編碼序列的有效密碼子數(shù)（ENC）分布在30.18～61.00之間,其密碼子偏好性不強(qiáng),GC_3S的含量僅為29%,表明密碼子中的第3位堿基以A/T結(jié)尾為主;有效密碼子數(shù)與GC_3S的相關(guān)性達(dá)到極顯著水平。中性繪圖分析、ENC-plot分析、PR2-plot分析結(jié)果表明,小球藻葉綠體基因組密碼子的偏好性主要受自然選擇的影響。最終確定TTT、TTA、CAA、CCA、ATT、GTT、TCA、ACA、GCT、TAT、TGA、CAT、AAT、AAA、GAT、GAA、CGT和GGT 18個高頻高表達(dá)密碼子為最優(yōu)密碼子。研究結(jié)果對小球藻資源的開發(fā)利用具有重要意義。 

【文章來源】：分子植物育種. 2020,18(17)北大核心

【文章頁數(shù)】：9 頁

【部分圖文】：

ENC-plot分析

中性繪圖分析

PR2-plot分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號：3085556