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植物腐生、病原及內生真菌中CAZymes的比較基因組學分析

發(fā)布時間:2021-03-02 15:43
  作為真核生物中的一個龐大類群,真菌在自然界物質循環(huán)中扮演著不可或缺的地位。不同類型真菌在物質循環(huán)中發(fā)揮不同的作用,例如某些蕈類真菌可供人類食用,但一些真菌卻對農作物具有侵染、破壞作用,如植物病原真菌。因此,如何更好地利用真菌成為了近年來真菌學的研究方向。真菌可以產生大量的碳水化合物活性酶(carbohydrate active enzymes,CAZymes),該類物質是真菌生長發(fā)育過程中極為突出的蛋白家族,與真菌的生活方式可能緊密相關,同時也是降解木質纖維素,解決能源危機綠色生物平臺搭建的重要酶類系統(tǒng)。本研究通過比較基因組學分析腐生、病原及內生真菌三種不同營養(yǎng)生活模式的真菌中CAZymes組成及含量,從而了解編碼CAZymes基因的數量及多樣性與真菌營養(yǎng)方式的關系并揭示三種類型真菌對木質纖維素的不同降解能力,為后期找到高效降解生物質的微生物提供可行性。本文主要的研究內容和結果如下:1.首先,本研究對課題組中9株內生真菌的原始序列進行組裝拼接、基因預測等分析,在此基礎上,同時和數據庫中已知序列的88株真菌一起進行CAZymes篩選。結果發(fā)現,在囊括腐生、病原及內生真菌多種不同營養(yǎng)生活模... 

【文章來源】:江西師范大學江西省

【文章頁數】:74 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

植物腐生、病原及內生真菌中CAZymes的比較基因組學分析


圖2-19株真菌中蛋白數量Fig.2-1Numberofproteinsinninefungi

內生真菌,病原,數量比


圖 3-1 腐生、病原及內生真菌中 CAZymes 數量比較3-1 Comparison of CAZymes in saprophytic, pathogenic and endophyti圖 3-2 腐生、病原及內生真菌中 CAZymes 數量差異性分析fference analysis of CAZymes in saprophytic、pathogenic and endophy

內生真菌,病原,腐生真菌,活性酶


而病原真菌與腐生真菌中的碳水化合物物活性酶數量不存在差異(圖3-2)。圖 3-1 腐生、病原及內生真菌中 CAZymes 數量比較Fig. 3-1 Comparison of CAZymes in saprophytic, pathogenic and endophytic fungi圖 3-2 腐生、病原及內生真菌中 CAZymes 數量差異性分析Fig. 3-2 Difference analysis of CAZymes in saprophyti

【參考文獻】:
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本文編號:3059519

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