為探究威蘭膠合成途徑中關(guān)鍵基因welE和welC的結(jié)構(gòu)特性及功能,運(yùn)用生物信息學(xué)手段分析了welE和welC基因的序列信息,預(yù)測了其編碼蛋白的理化性質(zhì)、跨膜區(qū)、信號肽、磷酸化修飾、結(jié)構(gòu)域及高級結(jié)構(gòu)等.研究結(jié)果表明,WelE蛋白是由234個(gè)氨基酸組成的穩(wěn)定親水性蛋白質(zhì),無跨膜結(jié)構(gòu)和信號肽,存在20個(gè)磷酸化位點(diǎn),含有一個(gè)BY-kinase結(jié)構(gòu)域,說明WelE可能參與威蘭膠的生產(chǎn)與轉(zhuǎn)運(yùn),WelE二級結(jié)構(gòu)主要由α-螺旋和無規(guī)則卷曲組成,三級結(jié)構(gòu)呈"圓環(huán)狀";WelC蛋白是由449個(gè)氨基酸組成的不穩(wěn)定親水性跨膜蛋白質(zhì),含有2個(gè)跨膜螺旋、無信號肽,存在39個(gè)磷酸化位點(diǎn),含有一個(gè)Wzz結(jié)構(gòu)域,這表明WelC可能與威蘭膠鏈長調(diào)節(jié)有關(guān),WelC二級結(jié)構(gòu)以α-螺旋和無規(guī)則卷曲為主,三級結(jié)構(gòu)呈"條狀",這些結(jié)果為解析welE和welC基因的功能以及建立威蘭膠代謝調(diào)控方法奠定了理論基礎(chǔ). 

【文章來源】：河南師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020,48(01)北大核心

【文章頁數(shù)】：8 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 實(shí)驗(yàn)材料
    1.2 序列分析
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
    2.1 蛋白質(zhì)理化性質(zhì)和一級結(jié)構(gòu)分析
        2.1.1 蛋白質(zhì)理化性質(zhì)分析
        2.1.2 蛋白質(zhì)的親水性和疏水性分析
    2.2 蛋白序列特征和功能分析
        2.2.1 蛋白質(zhì)的跨膜區(qū)分析
        2.2.2 蛋白質(zhì)的信號肽預(yù)測
        2.2.3 蛋白磷酸化修飾預(yù)測
        2.2.4 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域預(yù)測
    2.3 蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
    2.4 蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)預(yù)測
3 討 論



本文編號：3057730