硝化作用是生物地球化學(xué)循環(huán)的關(guān)鍵組成部分。它通常被認(rèn)為有兩步過程,氨首先被氧化成為亞硝酸鹽,再氧化成為硝酸鹽。最近有研究表明,新發(fā)現(xiàn)的全程氨氧化微生物（Complete ammonia oxidizer,Comammox）能獨(dú)立完成氨氧化和亞硝酸鹽氧化過程。目前湖泊岸邊帶挺水植物根際的Comammox菌的研究還比較缺乏。本論文以梁子湖和月湖岸邊帶挺水植物根際為研究對象,利用特異性引物進(jìn)行克隆測序和定量PCR,研究湖泊中Comammox菌的群落結(jié)構(gòu)和豐度,探究了氨氧化古菌（Ammonia Oxidizing Archaea,AOA）、氨氧化細(xì)菌（Ammonia Oxidizing Bacteria,AOB）和Comammox菌的共存狀況以及環(huán)境因子對Comammox菌的多樣性和豐度的影響,加深對湖泊氮素循環(huán)的了解,并為水體富營養(yǎng)化修復(fù)提供理論依據(jù)。主要研究結(jié)果如下:（1）對梁子湖和月湖挺水植物根際沉積物中的Comammox菌進(jìn)行克隆測序和定量PCR,在挺水植物根際沉積物中都成功擴(kuò)增到Comammox菌的特異性序列,證實(shí)了Comammox菌在梁子湖和月湖岸邊帶挺水植物根際沉積物中存在,為C... 

【文章來源】：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：65 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

技術(shù)路線圖

梁子湖和月湖挺水植物根際Comammox菌生物多樣性及豐度研究25圖3-2梁子湖挺水植物根際AOA、AOB和Comammox細(xì)菌與環(huán)境因子關(guān)系的RDA圖(圖中紅色實(shí)線箭頭表示環(huán)境因子，藍(lán)色虛線箭頭表示微生物豐度值，字母名稱代表挺水植物采樣點(diǎn)，N.rhizosphere:非根際R-P.australis:蘆葦根際F-P.australis:蘆葦遠(yuǎn)根際R-N.nucifera:荷花根際F-N.nucifera:荷花遠(yuǎn)根際R-A.calamus:菖蒲根際F-A.calamus:菖蒲根際R-P.hydropiper：水蓼根際F-P.hydropiper：水蓼遠(yuǎn)根際)Fig3-2RDAordinationplotsofrelationshipbetweenAOA、AOBandComammoxbacteriaandenvironmentalfactorsintherhizosphereofemergentmacrophytesatdifferentsamplingpointsinLakeLiangzi(Theredsolidarrowindicatestheenvironmentalfactor,thebluedottedarrowindicatesthemicrobialabundancevalueandthequantitativeratioofAnammoxtoN-DAMObacteria,andthelettersrepresenttheemergentplantsandnon-rhizospheresamplingpoints:N.rhizosphere，R-P.australis，F(xiàn)-P.australis，R-N.nucifera，F(xiàn)-N.nucifera，R-A.calamus，F(xiàn)-A.calamu，R-P.hydropipe，F(xiàn)-P.hydropiper)3.2.4梁子湖Comammox菌的群落結(jié)構(gòu)及生物多樣性梁子湖沉積物DNA樣品中成功擴(kuò)增出Comammox菌的amoA特異性序列條帶。-0.61.2-0.61.0ComammoxamoAAOBamoAAOAamoApHOMTPTNNH4+-NNO3--NNO2--NN.rhizosphereR-P.australisF-P.australisR-N.nuciferaR-A.calamusF-A.calamusR-P.hydropiperF-N.nuciferaF-P.hydropiperRDA1(94.2%)RDA2(5.8%)

梁子湖和月湖挺水植物根際Comammox菌生物多樣性及豐度研究27圖3-3梁子湖不同采樣點(diǎn)挺水植物根際Comammox菌的amoA基因系統(tǒng)發(fā)育樹(本文中的參比序列來源GenBank數(shù)據(jù)庫，序列后方的字母和數(shù)字為提交序列號，分支節(jié)點(diǎn)上的數(shù)字表示每經(jīng)過1000次Bootstrap自展分析所支持的次數(shù)所占的百分比；計(jì)算方法為Jukes-Cantormodel；發(fā)育樹左下方標(biāo)尺表示1%序列差異的分支長度)Fig3-3Neighbour-joiningphylogenetictreeofComammoxbacteriaintherhizosphereofemergentmacrophytesatdifferentsamplingpointsinLakeLiangzi(ThereferencesequencesarefromtheGenBank,thelettersandnumbersbehindofthesequencesaresubmittedsequencenumber,thenumberonthebranchnoderepresentsthepercentageoftimessupportedbyeach1000bootstrapanalysis;ThecalculationmethodisJukes-Cantormodel,thescalebarrepresents1%sequencedivergence.)CandidatusNitrospiraInopinata(NZLN885086)Nitrospirasp.(NIUT01000226)OTU2(16/70)OTU15(1/70)freshwaterbiofilm(MF347252)sedimentsofriverreservoirandtidalflat(MG591569)OTU14(1/70)soilfromSwitzerlandAlpineglacier-forefield(LT854238)Cluster1OTU7(2/70)Surfacesoilofricefieldmicrocosm(AB222695)paddysoilofrice(MF347137)OTU11(1/70)OTU12(1/70)sedimentsofriverreservoirandtidalflat(MG591549)OTU4(8/70)sedimentsofriverreservoirandtidalflat(MG591654)wastewatertreatmantplant(MF347372)OTU8(2/70)OTU3(8/70)soilfromShanghaiChongxiWetland(KF264968)Cluster2unculturedmethanotrophicbacteriumfromsoil(FN394210)unculturedmethanotrophicbacteriumfromsoil(FN394185)OTU9(2/70)OT

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號：3047637