目的篩選成人與新生兒來(lái)源的間充質(zhì)干細(xì)胞（mesenchymal stem cells,MSCs）的差異表達(dá)circRNAs,為進(jìn)一步探究circRNAs在增齡調(diào)控MSCs細(xì)胞命運(yùn)中的作用及機(jī)制提供理論基礎(chǔ)。方法通過(guò)對(duì)微陣列數(shù)據(jù)GSE122178中的3例成人骨髓來(lái)源的間充質(zhì)干細(xì)胞樣本、3例圍生期新生兒臍帶血來(lái)源的間充質(zhì)干細(xì)胞樣本進(jìn)行生物信息學(xué)分析,篩選差異表達(dá)的circRNAs,并預(yù)測(cè)其生物學(xué)功能和作用機(jī)制。結(jié)果新生兒臍帶血來(lái)源的間充質(zhì)干細(xì)胞與成人骨髓來(lái)源的間充質(zhì)干細(xì)胞相比,66個(gè)circRNAs表達(dá)顯著上調(diào),107個(gè)circRNAs表達(dá)顯著下調(diào)。其中hsa_circ₀080170表達(dá)上調(diào)最顯著,hsa_circ₀060055表達(dá)下調(diào)最顯著。hsa_circ₀080170具有6個(gè)下游miRNAs結(jié)合位點(diǎn),714個(gè)靶基因;hsa_circ₀060055具有28個(gè)下游miRNAs結(jié)合位點(diǎn),591個(gè)靶基因。KEGG分析顯示,hs... 

【文章來(lái)源】：解放軍醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào). 2020,41(10)

【文章頁(yè)數(shù)】：6 頁(yè)

【部分圖文】：

hsa-miR370和hsa-miR203a的預(yù)測(cè)靶基因的前10條重要KEGG通路

圖 5 hsa-miR370和hsa-miR203a的預(yù)測(cè)靶基因的前10條重要KEGG通路近年來(lái),已有多項(xiàng)研究表明,增齡至少會(huì)影響MSCs的部分功能。Du等[14]發(fā)現(xiàn),源自18 ～ 20歲、30 ～ 35歲、45 ～ 50歲三個(gè)不同年齡段捐贈(zèng)者的牙周膜干細(xì)胞之間,細(xì)胞集落形成率、細(xì)胞周期和凋亡情況以及堿性磷酸酶活性存在顯著差異。隨著年齡的增長(zhǎng),牙周膜干細(xì)胞的集落形成能力下降,G2/S期細(xì)胞減少,細(xì)胞凋亡增加,成骨分化能力下降。此外,陳裕浩等[15]發(fā)現(xiàn),與源于幼年雄性獼猴的骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞相比,源于老年雄性獼猴的骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞形態(tài)呈寬大、扁平形,細(xì)胞增殖緩慢,成骨、成軟骨及成脂分化能力下降,伴隨著IL-1β、IL-4、IL-6和TNF-α等細(xì)胞因子表達(dá)降低。然而,目前關(guān)于circRNAs在增齡對(duì)于MSCs細(xì)胞命運(yùn)的調(diào)控機(jī)制中發(fā)揮的作用少有研究。

圖1 3例成人骨髓來(lái)源的間充質(zhì)干細(xì)胞樣本(GSM3457280、GSM3457281、GSM3457282)和3例圍生期新生兒臍帶血來(lái)源的間充質(zhì)干細(xì)胞樣本(GSM3457283、GSM3457284、GSM3457285)的circRNAs表達(dá)譜圖2 hsa-miR230a、hsa-miR370、hsa-miR197和hsa-miR1225-5p各自的miRDB和Targetscan數(shù)據(jù)庫(kù)的下游靶基因預(yù)測(cè)結(jié)果及韋恩分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]年齡對(duì)獼猴骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞體外分化和細(xì)胞因子水平的影響[J]. 陳裕浩,朱向情,郭德鑌,林慶鏗,何志旭,潘興華.  中國(guó)組織工程研究. 2017(25)



本文編號(hào)：3046257