β-桶狀膜蛋白是一種跨膜蛋白,常被稱為β-桶狀外膜蛋白（β-barrel Outer Membrane Proteins,OMPs）,主要在真核生物的葉綠體與線粒體以及革蘭氏陰性菌外膜上存在。它參與了許多生物進(jìn)程,包括物質(zhì)的跨膜運(yùn)輸、信號(hào)傳導(dǎo)、運(yùn)動(dòng)等。值得注意的是,它與革蘭氏陰性菌的致病毒素——內(nèi)毒素的釋放有關(guān)。所以研究β-桶狀外膜蛋白的生物發(fā)生有可能對(duì)內(nèi)毒素引發(fā)的疾病起預(yù)防或治療作用。β-桶狀外膜蛋白的裝配與插膜過程是由β-Barrel Assembly Machinery（Bam）復(fù)合體介導(dǎo)的,而本文的研究對(duì)象BamA蛋白質(zhì)是Bam復(fù)合體的核心蛋白,因此研究BamA蛋白質(zhì)可能對(duì)尋找新的治療靶標(biāo)有幫助。BamA蛋白質(zhì)主要由β-桶結(jié)構(gòu)與5個(gè)POTRA（Polypeptide Transport-Associated）結(jié)構(gòu)域組成。隨著越來越多蛋白質(zhì)的晶體結(jié)構(gòu)被解析以及計(jì)算機(jī)的飛速發(fā)展,分子動(dòng)力學(xué)模擬被廣泛地應(yīng)用到各類學(xué)科的研究中。由于它可以動(dòng)態(tài)觀察蛋白質(zhì)的運(yùn)動(dòng)狀態(tài),因此可以彌補(bǔ)實(shí)驗(yàn)的不足,為問題的研究提供新視角。該方法主要原理是通過求解牛頓第二定律中的運(yùn)動(dòng)方程來獲取下一步的運(yùn)動(dòng)坐標(biāo),本質(zhì)... 

【文章來源】：吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：58 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

Bam復(fù)合體晶體結(jié)構(gòu)圖

第 1 章 緒論接下來解析出的晶體結(jié)構(gòu)為 BamB復(fù)合結(jié)構(gòu)[7, 8]。該晶體結(jié)構(gòu)進(jìn)一步證實(shí)4 的交界處相連，如圖 1.2，這種相起重要作用。在此之后，BamA 的體結(jié)構(gòu)也被解析出來，該結(jié)構(gòu)顯示作用[9, 10]，晶體結(jié)構(gòu)如圖 1.3。BamD 究表明 BamD 可能會(huì)激活 BamA[11]

BamD與BamA的POTRA4、POTRA5晶體結(jié)構(gòu)圖

【參考文獻(xiàn)】：
碩士論文
[1]BamA蛋白的全原子及粗�；壽E的主成分分析[D]. 劉蘭茹.吉林大學(xué) 2016



本文編號(hào)：3015215