目的:通過生物信息學(xué)方法篩選急性髓系白血病（AML）患者骨髓間充質(zhì)干細胞（BM-MSC）衰老相關(guān)的差異表達基因并予以驗證,為AML的科研和臨床提供新的分子標(biāo)志物。方法:應(yīng)用血液病醫(yī)院AML患者BMMSC制作基因表達譜芯片并參考從NCBI數(shù)據(jù)庫GEO中選取的芯片GSE84881,綜合地進行數(shù)據(jù)分析并篩選差異表達基因。運用DAVID分析軟件進行基因本體論（GO）富集分析和KEGG通路富集分析,篩選出與AML患者BM-MSC衰老相關(guān)的差異表達基因。收集病人及健康供者的骨髓樣本,體外擴增MSC并應(yīng)用RT-PCR技術(shù)檢測衰老相關(guān)基因表達水平與芯片的一致性,輔以衰老相關(guān)β-半乳糖苷酶染色實驗和MTT細胞增殖實驗對AML患者BM-MSC表型和功能進行驗證。結(jié)果:篩選出247個差異表達基因,其中有132個基因表達上調(diào),115個基因表達下調(diào)。側(cè)重分析6個衰老相關(guān)基因,包括表達上調(diào)基因COL3A1（P=0.025）、CRYAB（P=0.0003）、DCN（P=0.0368）以及表達下調(diào)基因CCL2（P=0.0256）、CTSC（P=0.0001）、IL6（P=0.0482）。RT-PCR實驗結(jié)果提示,上述... 

【文章來源】：中國實驗血液學(xué)雜志. 2019年02期 北大核心

【文章頁數(shù)】：7 頁

【文章目錄】：
材料和方法
    試劑與儀器
    基因芯片樣本
    細胞實驗樣本
    基因芯片的分析和差異表達基因的篩選
    衰老相關(guān)差異表達基因的RT-PCR檢測
    衰老表型的衰老相關(guān)β-半乳糖苷酶 （senescenceassociatedβ-Galactosidase, SA-β-Gal） 的染色實驗檢測
    AML患者BM-MSC增殖能力的MTT檢測
    統(tǒng)計學(xué)分析
結(jié)果
    基因芯片分析結(jié)果
    差異表達基因的GO分析、KEGG分析以及衰老相關(guān)基因的篩選
    RT-PCR檢測結(jié)果
    細胞增殖能力的MTT檢測結(jié)果
討論


【參考文獻】：
期刊論文
[1]間充質(zhì)干細胞在造血調(diào)控中的作用[J]. 霍思維,張毅.  中國實驗血液學(xué)雜志. 2006(01)



本文編號：2953053