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擬南芥RNA編輯因子(MORF2)和線粒體RNA聚合酶(RPOTm)結(jié)構(gòu)與功能研究

發(fā)布時(shí)間:2021-01-02 08:25
  RNA編輯是一種轉(zhuǎn)錄后修飾過(guò)程,通過(guò)堿基的插入、刪除或替換可以改變RNA分子的遺傳信息。RNA編輯通常發(fā)生在植物的質(zhì)體和線粒體中,會(huì)改變編碼的核苷酸,引入新的啟動(dòng)子和終止子,具有校正和調(diào)控翻譯等生物學(xué)意義。目前為止已經(jīng)鑒定出許多RNA編輯因子。2005年,發(fā)現(xiàn)了第一個(gè)RNA編輯因子CRR4,它是PLS型五肽重復(fù)(PPR)蛋白家族的成員。隨后又發(fā)現(xiàn)許多其他PLS型PPR蛋白參與植物RNA編輯。事實(shí)上,所有研究的PPR蛋白都位于質(zhì)體或線粒體中。一般認(rèn)為PPR蛋白是一類參與RNA編輯的反式作用因子,作為RNA結(jié)合蛋白起作用。還有一類非PPR蛋白質(zhì)對(duì)開(kāi)花植物葉綠體和線粒體中的RNA編輯也是必須的,它們被稱為MORF蛋白或RIP蛋白家族。MORF蛋白是一個(gè)小蛋白家族,在擬南芥中有10個(gè)成員。其中MORF2和MORF9位于質(zhì)體中,MORF1和MORF3-7位于線粒體中,MORF8則是定位于兩個(gè)細(xì)胞器中,MORF10則被認(rèn)為不參與RNA編輯。通過(guò)酵母雙雜交實(shí)驗(yàn)以及pull down實(shí)驗(yàn)表明,MORF蛋白之間存在相互作用,能形成同源或異源聚合體,說(shuō)明MORF蛋白可能需要共同作用來(lái)參與編輯。在本篇論文中... 

【文章來(lái)源】:安徽大學(xué)安徽省 211工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】:99 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

擬南芥RNA編輯因子(MORF2)和線粒體RNA聚合酶(RPOTm)結(jié)構(gòu)與功能研究


圖1-2.?dāng)M南芥PPR蛋白的基序結(jié)構(gòu).(Lurin,Andres?e/“/.,2004)??Figure?1-2.?Motif?structure?of?PPR?proteins?involved?in?Arabidopsis?thaliana.??

擬南芥,假基因,突變體,蛋白


Motifs??P?□?LI?□?L2?■?S?□?E?L?.」E+lH?DYWl?1??圖1-2.?dāng)M南芥PPR蛋白的基序結(jié)構(gòu).(Lurin,Andres?e/“/.,2004)??Figure?1-2.?Motif?structure?of?PPR?proteins?involved?in?Arabidopsis?thaliana.??(Lurin,Andres?el?^/.,2004)??大部分PPR蛋白只影一個(gè)或是兩個(gè)編輯位點(diǎn),如cvt28的突變體有兩個(gè)編??輯位點(diǎn)受到影響、〇妒82突變體有兩個(gè)、突變體有一個(gè)和突變體中僅??僅也只有一個(gè)編輯位點(diǎn)受到了影響。但是也有一部分PPR蛋白能影響6至8?jìng)(gè)??編輯位點(diǎn),甚至更多。如PDM1,它能影響大約27個(gè)編輯位點(diǎn)I66]。但是分析這??4??

晶體結(jié)構(gòu),復(fù)合物,殘基,基序


它們?cè)冢停希遥萍易逯械拇_切作用很大程度上仍然未知。??一系列研宄表明,MORF蛋白可與PLS型PPR蛋白結(jié)合173],最近己經(jīng)確定??了?MORF9和PLS型PPR蛋白復(fù)合物中的晶體結(jié)構(gòu),如圖1-5。清楚地觀察到??—個(gè)(PLS)3PPR結(jié)合三個(gè)M0RF9分子,每個(gè)M0RF9與接近其凹面的PLS三??聯(lián)體相互作用|7(11。該相互作用主要涉及MORF9的D164和來(lái)自PLS三聯(lián)體的??L型基序的K29,在這兩個(gè)殘基中的任一處的單個(gè)突變都會(huì)完全消除了相互作用。??此外,從M0RF9的殘基W160、L162和L-和S-型基序的相關(guān)殘基觀察到廣泛??的疏水相互作用l7u】。??a?M0RF9?^?^??'-集??著%.??b??ISO?182?1?DT4?r?L162?^?W160??、L19?5165?A?S'*?Vr4i:16.??¥玲,26?Y17^'?S?Lt^^3Vv23"??1?123?<29^?_?<?t?丨、??.?、I?'?—?i::—??圖1-5.?(PLS)3PPR和MORF9復(fù)合物的晶體結(jié)構(gòu)。??(Yan,Zhang?et?al.,2017)??Figure?1-5.?Crystal?structure?of?(PLShPPR?in?complex?with?MORF9.??(Yan


本文編號(hào):2953015

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