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擬南芥和菘藍SEP3基因不同剪接本以及菘藍IiSEP1和IiSEP2基因功能研究

發(fā)布時間:2020-12-31 17:39
  本工作研究了擬南芥和菘藍SEP3直系同源基因不同剪接本以及菘藍E類花同源異型基因IiSEP1和IiSEP2的生物學(xué)功能。擬南芥的AtSEP3基因和菘藍的IiSEP3基因具有同樣的剪接方式,可以產(chǎn)生全長剪接本(AtSEP3-2與IiSEP3-2)和缺少第六個外顯子的可變剪接本(AtSEP3-3與IiSEP3-3),這種保守的剪接方式對植物生長過程可能具有重要的調(diào)節(jié)功能。IiSEP3-2、IiSEP3-3、IiSEP1和IiSEP2蛋白的N-末端都存在一個核定位信號KRIENKINRQVTFAKRR,它們均定位于細胞核中。對氨基酸序列進行分析,發(fā)現(xiàn)這幾個蛋白質(zhì)的C末端都有三個保守的基序,分別為SEP motifⅠ(FFQPLE)、SEP/AGL6motif(PILQIGY)和SEP motifⅡ(NNYMLGWLP),所以這幾種蛋白質(zhì)可能具有冗余性功能。采用qRT-PCR技術(shù)對AtSEP3-2、AtSEP3-3、IiSEP3-2和IiSEP3-3四種剪接本以及IiAP1、IiSEP1和IiSEP2基因在轉(zhuǎn)錄水平的表達模式進行分析,結(jié)果表明IiAP1和AtAP1存在相似的表達模式,在營養(yǎng)生長... 

【文章來源】:西北大學(xué)陜西省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:185 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

擬南芥和菘藍SEP3基因不同剪接本以及菘藍IiSEP1和IiSEP2基因功能研究


可變剪接示意圖

示意圖,可變剪接,方式,外顯子


西北大學(xué)博士學(xué)位論文指在一定情況下外顯子被作為內(nèi)含子的一個部分,通過可變剪接方式在哺乳動物中比較常見[4]。內(nèi)含子保留是也有可能會與兩個外顯子的側(cè)翼相連形成一個新的外顯指兩個外顯子中只有一個能夠存在于最終的 mRNA 分上游外顯子的 3′-端邊界發(fā)生了改變。可變的 3′-端受體發(fā)生了改變。除了上述 5 種可變剪接方式,還有一些其和可變 poly(A)等[6]。

分子機制,過程,可變剪接,內(nèi)含子


著 U1 snRNA 和 U4 snRNA 被釋放出來,在 U2 snRNA、用下內(nèi)含子彎曲,外顯子靠近,pre-mRNA 結(jié)構(gòu)發(fā)生改變, C。最后 U2 snRNA、U6 snRNA、U5 snRNA 和外顯子得到A。釋放的 UsnRNA 可以進入下一輪循環(huán)(圖 1.3)[9]。除許多 RNA 結(jié)合蛋白在 mRNA 的加工、剪接位點的選擇以及[8]。真核生物中,具有內(nèi)含子的基因通過可變剪接可以產(chǎn)生多種一過程中,對不同剪接位點的識別會導(dǎo)致內(nèi)含子保留、外顯可變選擇?勺兗艚幽軌虍a(chǎn)生具有不同功能的蛋白質(zhì),加強外,可變剪接也可以在編碼序列中過早地引入終止密碼子,無義降解(nonsense-mediated decay)。同時,可變剪接可以率對基因表達起到調(diào)節(jié)作用[10]。

【參考文獻】:
期刊論文
[1]Graft-accelerated virus-induced gene silencing facilitates functional genomics in rose flowers[J]. Huijun Yan,Shaochuan Shi,Nan Ma,Xiaoqian Cao,Hao Zhang,Xianqin Qiu,Qigang Wang,Hongying Jian,Ningning Zhou,Zhao Zhang,Kaixue Tang.  Journal of Integrative Plant Biology. 2018(01)
[2]甜櫻桃成花相關(guān)MADS-box基因的克隆及表達分析[J]. 段續(xù)偉,倪楊,張曉明,閆國華,王晶,周宇,張開春.  果樹學(xué)報. 2018(01)
[3]棗SEP1基因的克隆和表達分析[J]. 張力曼,馮春芳,劉孟軍,趙錦.  河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2016(05)
[4]八氫番茄紅素脫氫酶的研究進展[J]. 李春季,李炳學(xué),韓曉日.  微生物學(xué)報. 2016(11)
[5]春蘭CgSEP3基因的克隆和表達分析[J]. 賈春蕾,向林,秦德輝,李小白,吳超,孫崇波.  西北植物學(xué)報. 2014(07)



本文編號:2950034

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