擬南芥和菘藍(lán)SEP3基因不同剪接本以及菘藍(lán)IiSEP1和IiSEP2基因功能研究
發(fā)布時(shí)間:2020-12-31 17:39
本工作研究了擬南芥和菘藍(lán)SEP3直系同源基因不同剪接本以及菘藍(lán)E類花同源異型基因IiSEP1和IiSEP2的生物學(xué)功能。擬南芥的AtSEP3基因和菘藍(lán)的IiSEP3基因具有同樣的剪接方式,可以產(chǎn)生全長剪接本(AtSEP3-2與IiSEP3-2)和缺少第六個(gè)外顯子的可變剪接本(AtSEP3-3與IiSEP3-3),這種保守的剪接方式對植物生長過程可能具有重要的調(diào)節(jié)功能。IiSEP3-2、IiSEP3-3、IiSEP1和IiSEP2蛋白的N-末端都存在一個(gè)核定位信號KRIENKINRQVTFAKRR,它們均定位于細(xì)胞核中。對氨基酸序列進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)這幾個(gè)蛋白質(zhì)的C末端都有三個(gè)保守的基序,分別為SEP motifⅠ(FFQPLE)、SEP/AGL6motif(PILQIGY)和SEP motifⅡ(NNYMLGWLP),所以這幾種蛋白質(zhì)可能具有冗余性功能。采用qRT-PCR技術(shù)對AtSEP3-2、AtSEP3-3、IiSEP3-2和IiSEP3-3四種剪接本以及IiAP1、IiSEP1和IiSEP2基因在轉(zhuǎn)錄水平的表達(dá)模式進(jìn)行分析,結(jié)果表明IiAP1和AtAP1存在相似的表達(dá)模式,在營養(yǎng)生長...
【文章來源】:西北大學(xué)陜西省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:185 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
可變剪接示意圖
西北大學(xué)博士學(xué)位論文指在一定情況下外顯子被作為內(nèi)含子的一個(gè)部分,通過可變剪接方式在哺乳動(dòng)物中比較常見[4]。內(nèi)含子保留是也有可能會與兩個(gè)外顯子的側(cè)翼相連形成一個(gè)新的外顯指兩個(gè)外顯子中只有一個(gè)能夠存在于最終的 mRNA 分上游外顯子的 3′-端邊界發(fā)生了改變?勺兊 3′-端受體發(fā)生了改變。除了上述 5 種可變剪接方式,還有一些其和可變 poly(A)等[6]。
著 U1 snRNA 和 U4 snRNA 被釋放出來,在 U2 snRNA、用下內(nèi)含子彎曲,外顯子靠近,pre-mRNA 結(jié)構(gòu)發(fā)生改變, C。最后 U2 snRNA、U6 snRNA、U5 snRNA 和外顯子得到A。釋放的 UsnRNA 可以進(jìn)入下一輪循環(huán)(圖 1.3)[9]。除許多 RNA 結(jié)合蛋白在 mRNA 的加工、剪接位點(diǎn)的選擇以及[8]。真核生物中,具有內(nèi)含子的基因通過可變剪接可以產(chǎn)生多種一過程中,對不同剪接位點(diǎn)的識別會導(dǎo)致內(nèi)含子保留、外顯可變選擇?勺兗艚幽軌虍a(chǎn)生具有不同功能的蛋白質(zhì),加強(qiáng)外,可變剪接也可以在編碼序列中過早地引入終止密碼子,無義降解(nonsense-mediated decay)。同時(shí),可變剪接可以率對基因表達(dá)起到調(diào)節(jié)作用[10]。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Graft-accelerated virus-induced gene silencing facilitates functional genomics in rose flowers[J]. Huijun Yan,Shaochuan Shi,Nan Ma,Xiaoqian Cao,Hao Zhang,Xianqin Qiu,Qigang Wang,Hongying Jian,Ningning Zhou,Zhao Zhang,Kaixue Tang. Journal of Integrative Plant Biology. 2018(01)
[2]甜櫻桃成花相關(guān)MADS-box基因的克隆及表達(dá)分析[J]. 段續(xù)偉,倪楊,張曉明,閆國華,王晶,周宇,張開春. 果樹學(xué)報(bào). 2018(01)
[3]棗SEP1基因的克隆和表達(dá)分析[J]. 張力曼,馮春芳,劉孟軍,趙錦. 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(05)
[4]八氫番茄紅素脫氫酶的研究進(jìn)展[J]. 李春季,李炳學(xué),韓曉日. 微生物學(xué)報(bào). 2016(11)
[5]春蘭CgSEP3基因的克隆和表達(dá)分析[J]. 賈春蕾,向林,秦德輝,李小白,吳超,孫崇波. 西北植物學(xué)報(bào). 2014(07)
本文編號:2950034
【文章來源】:西北大學(xué)陜西省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:185 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
可變剪接示意圖
西北大學(xué)博士學(xué)位論文指在一定情況下外顯子被作為內(nèi)含子的一個(gè)部分,通過可變剪接方式在哺乳動(dòng)物中比較常見[4]。內(nèi)含子保留是也有可能會與兩個(gè)外顯子的側(cè)翼相連形成一個(gè)新的外顯指兩個(gè)外顯子中只有一個(gè)能夠存在于最終的 mRNA 分上游外顯子的 3′-端邊界發(fā)生了改變?勺兊 3′-端受體發(fā)生了改變。除了上述 5 種可變剪接方式,還有一些其和可變 poly(A)等[6]。
著 U1 snRNA 和 U4 snRNA 被釋放出來,在 U2 snRNA、用下內(nèi)含子彎曲,外顯子靠近,pre-mRNA 結(jié)構(gòu)發(fā)生改變, C。最后 U2 snRNA、U6 snRNA、U5 snRNA 和外顯子得到A。釋放的 UsnRNA 可以進(jìn)入下一輪循環(huán)(圖 1.3)[9]。除許多 RNA 結(jié)合蛋白在 mRNA 的加工、剪接位點(diǎn)的選擇以及[8]。真核生物中,具有內(nèi)含子的基因通過可變剪接可以產(chǎn)生多種一過程中,對不同剪接位點(diǎn)的識別會導(dǎo)致內(nèi)含子保留、外顯可變選擇?勺兗艚幽軌虍a(chǎn)生具有不同功能的蛋白質(zhì),加強(qiáng)外,可變剪接也可以在編碼序列中過早地引入終止密碼子,無義降解(nonsense-mediated decay)。同時(shí),可變剪接可以率對基因表達(dá)起到調(diào)節(jié)作用[10]。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Graft-accelerated virus-induced gene silencing facilitates functional genomics in rose flowers[J]. Huijun Yan,Shaochuan Shi,Nan Ma,Xiaoqian Cao,Hao Zhang,Xianqin Qiu,Qigang Wang,Hongying Jian,Ningning Zhou,Zhao Zhang,Kaixue Tang. Journal of Integrative Plant Biology. 2018(01)
[2]甜櫻桃成花相關(guān)MADS-box基因的克隆及表達(dá)分析[J]. 段續(xù)偉,倪楊,張曉明,閆國華,王晶,周宇,張開春. 果樹學(xué)報(bào). 2018(01)
[3]棗SEP1基因的克隆和表達(dá)分析[J]. 張力曼,馮春芳,劉孟軍,趙錦. 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(05)
[4]八氫番茄紅素脫氫酶的研究進(jìn)展[J]. 李春季,李炳學(xué),韓曉日. 微生物學(xué)報(bào). 2016(11)
[5]春蘭CgSEP3基因的克隆和表達(dá)分析[J]. 賈春蕾,向林,秦德輝,李小白,吳超,孫崇波. 西北植物學(xué)報(bào). 2014(07)
本文編號:2950034
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