原生動(dòng)物八肋游仆蟲(chóng)NMD途徑UPF因子的功能分析
發(fā)布時(shí)間:2020-12-22 22:20
基因的準(zhǔn)確表達(dá)對(duì)于機(jī)體細(xì)胞正常的生理活動(dòng)至關(guān)重要,它受到了細(xì)胞中多種不同分子機(jī)制的調(diào)控。其中,無(wú)義介導(dǎo)的mRNA降解途徑(nonsense-mediated mRNA decay,NMD),它作為一種真核生物基因表達(dá)質(zhì)量控制機(jī)制,能夠識(shí)別并降解那些含有提前終止密碼子(premature termination codons,PTCs)的無(wú)義mRNA。mRNA降解依賴(lài)于細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)翻譯過(guò)程,目前已知可以調(diào)節(jié)植物、動(dòng)物、真菌和纖毛蟲(chóng)中轉(zhuǎn)錄物的表達(dá)水平。無(wú)義mRNA的識(shí)別是NMD機(jī)制的核心,UPF(up-frameshift)蛋白質(zhì)是識(shí)別和降解無(wú)義mRNA的一類(lèi)關(guān)鍵因子。前期研究表明,在八肋游仆蟲(chóng)(Euplotes octocarinatus)細(xì)胞中僅有UPF1和UPF2兩種UPF蛋白質(zhì),沒(méi)有發(fā)現(xiàn)存在于人和酵母等細(xì)胞中的UPF3。生物信息學(xué)分析顯示,八肋游仆蟲(chóng)的UPF2(EoUPF2)包含三個(gè)串聯(lián)的MIF4G(middle domain of translation initiation factor 4G)結(jié)構(gòu)域和一個(gè)C末端UPF1的結(jié)合區(qū)域。大多數(shù)真核生物共享核心NMD因子,而NMD途徑...
【文章來(lái)源】:山西大學(xué)山西省
【文章頁(yè)數(shù)】:68 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
異常終止過(guò)程
1.2 NMD 途徑的底物[2]一些 mRNAs,包含一個(gè)或多個(gè)上游開(kāi)放閱讀框(upstream open reading framFs)(圖 1.2C),由于 EJC 不會(huì)被翻譯過(guò)程中的核糖體從 mRNA 上解離,導(dǎo) 介導(dǎo)的 NMD 途徑,但是也不是所有的 uORFs 都會(huì)被 NMD 降解[11],如血素(thrombopoietin, TPO)就是這樣一個(gè)例子。
圖 1.3 NMD 中兩種復(fù)合體結(jié)構(gòu)[37]1.3.3 EJC 復(fù)合體外顯子連接復(fù)合體(EJC),沉積在 mRNA 外顯子連接處上游[22,38],大約 20-24個(gè)核苷酸的位置[21,31,34],形成拼接的 mRNA 核糖核蛋白顆粒(mRNAribonucleoprotein[39]
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]UPF2介導(dǎo)八肋游仆蟲(chóng)NMD途徑SURF和EJC的耦聯(lián)[J]. 柴楊麗,呂佳,周寶春,梁愛(ài)華,柴寶峰. 山西大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2019(03)
[2]長(zhǎng)鏈非編碼RNAGAS5抑制內(nèi)皮細(xì)胞功能[J]. 孫玉聰,楚海榮,李宏,官秀梅,張曉蕓,崔曉棟,成敏. 中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2018(08)
[3]八肋游仆蟲(chóng)NMD通路的初步研究[J]. 石文鑫,王美,柴楊麗,呂佳,張志云,王剛,柴寶峰. 中國(guó)細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報(bào). 2018(06)
[4]SMG1-UPF1-eRF1-eRF3復(fù)合體參與賈第蟲(chóng)無(wú)義介導(dǎo)的mRNA降解激活[J]. 王美,呂佳,石文鑫,柴楊麗,文建凡,張西臣,柴寶峰. 中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2018(05)
[5]千金藤素對(duì)乳腺癌細(xì)胞MDA-MB-231自噬降解的影響[J]. 鄧琴,傅若秋,高寧. 第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(24)
[6]釀酒酵母TORC1通路上游調(diào)控元件以及在核糖體合成中的作用[J]. 張文哲,李萬(wàn)杰. 中國(guó)細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報(bào). 2017(11)
[7]無(wú)義mRNA降解途徑的機(jī)制與進(jìn)化[J]. 柴寶峰,王美,石文鑫,柴楊麗,呂佳. 山西大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2017(03)
[8]9種發(fā)熱伴出疹病原體基因芯片檢測(cè)方法的建立[J]. 徐勝平,劉琪琦,張嚴(yán)峻,王升啟. 軍事醫(yī)學(xué). 2017(02)
[9]SYBR Green II熒光定量PCR結(jié)合熔解曲線鑒別不同亞型兔病毒性出血癥病毒方法的建立[J]. 譚永貴,劉騰,朱杰,郭慧敏,吳巧梅,李琦,繆秋紅,陳宗艷,李傳峰,劉光清. 中國(guó)動(dòng)物傳染病學(xué)報(bào). 2017(01)
[10]鎘脅迫下黑點(diǎn)青鳉(Oryzias melastigma)肝臟金屬硫蛋白mRNA性別差異性表達(dá)研究[J]. 謝晴,薄軍,鄭榕輝,洪幅坤,張玉生. 生態(tài)毒理學(xué)報(bào). 2016(06)
博士論文
[1]F9基因無(wú)義突變導(dǎo)致重型血友病的分子機(jī)制[D]. 王剛.山西大學(xué) 2013
[2]mTOR抑制劑Rapamycin聯(lián)合RNAi沉默STAT3基因誘導(dǎo)BEL-7402肝癌細(xì)胞凋亡的實(shí)驗(yàn)研究[D]. 張毅.吉林大學(xué) 2012
[3]IUGR豬的生長(zhǎng)與腸道發(fā)育及L-精氨酸和大豆卵磷脂的營(yíng)養(yǎng)調(diào)控研究[D]. 王遠(yuǎn)孝.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
碩士論文
[1]eRF1的C端結(jié)構(gòu)域在終止密碼子識(shí)別過(guò)程中的功能[D]. 閆靜.山西大學(xué) 2017
[2]日本血吸蟲(chóng)性相關(guān)Tsunagi基因的克隆、表達(dá)及初步鑒定[D]. 王曉楠.安徽醫(yī)科大學(xué) 2008
本文編號(hào):2932534
【文章來(lái)源】:山西大學(xué)山西省
【文章頁(yè)數(shù)】:68 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
異常終止過(guò)程
1.2 NMD 途徑的底物[2]一些 mRNAs,包含一個(gè)或多個(gè)上游開(kāi)放閱讀框(upstream open reading framFs)(圖 1.2C),由于 EJC 不會(huì)被翻譯過(guò)程中的核糖體從 mRNA 上解離,導(dǎo) 介導(dǎo)的 NMD 途徑,但是也不是所有的 uORFs 都會(huì)被 NMD 降解[11],如血素(thrombopoietin, TPO)就是這樣一個(gè)例子。
圖 1.3 NMD 中兩種復(fù)合體結(jié)構(gòu)[37]1.3.3 EJC 復(fù)合體外顯子連接復(fù)合體(EJC),沉積在 mRNA 外顯子連接處上游[22,38],大約 20-24個(gè)核苷酸的位置[21,31,34],形成拼接的 mRNA 核糖核蛋白顆粒(mRNAribonucleoprotein[39]
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]UPF2介導(dǎo)八肋游仆蟲(chóng)NMD途徑SURF和EJC的耦聯(lián)[J]. 柴楊麗,呂佳,周寶春,梁愛(ài)華,柴寶峰. 山西大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2019(03)
[2]長(zhǎng)鏈非編碼RNAGAS5抑制內(nèi)皮細(xì)胞功能[J]. 孫玉聰,楚海榮,李宏,官秀梅,張曉蕓,崔曉棟,成敏. 中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2018(08)
[3]八肋游仆蟲(chóng)NMD通路的初步研究[J]. 石文鑫,王美,柴楊麗,呂佳,張志云,王剛,柴寶峰. 中國(guó)細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報(bào). 2018(06)
[4]SMG1-UPF1-eRF1-eRF3復(fù)合體參與賈第蟲(chóng)無(wú)義介導(dǎo)的mRNA降解激活[J]. 王美,呂佳,石文鑫,柴楊麗,文建凡,張西臣,柴寶峰. 中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2018(05)
[5]千金藤素對(duì)乳腺癌細(xì)胞MDA-MB-231自噬降解的影響[J]. 鄧琴,傅若秋,高寧. 第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(24)
[6]釀酒酵母TORC1通路上游調(diào)控元件以及在核糖體合成中的作用[J]. 張文哲,李萬(wàn)杰. 中國(guó)細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報(bào). 2017(11)
[7]無(wú)義mRNA降解途徑的機(jī)制與進(jìn)化[J]. 柴寶峰,王美,石文鑫,柴楊麗,呂佳. 山西大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2017(03)
[8]9種發(fā)熱伴出疹病原體基因芯片檢測(cè)方法的建立[J]. 徐勝平,劉琪琦,張嚴(yán)峻,王升啟. 軍事醫(yī)學(xué). 2017(02)
[9]SYBR Green II熒光定量PCR結(jié)合熔解曲線鑒別不同亞型兔病毒性出血癥病毒方法的建立[J]. 譚永貴,劉騰,朱杰,郭慧敏,吳巧梅,李琦,繆秋紅,陳宗艷,李傳峰,劉光清. 中國(guó)動(dòng)物傳染病學(xué)報(bào). 2017(01)
[10]鎘脅迫下黑點(diǎn)青鳉(Oryzias melastigma)肝臟金屬硫蛋白mRNA性別差異性表達(dá)研究[J]. 謝晴,薄軍,鄭榕輝,洪幅坤,張玉生. 生態(tài)毒理學(xué)報(bào). 2016(06)
博士論文
[1]F9基因無(wú)義突變導(dǎo)致重型血友病的分子機(jī)制[D]. 王剛.山西大學(xué) 2013
[2]mTOR抑制劑Rapamycin聯(lián)合RNAi沉默STAT3基因誘導(dǎo)BEL-7402肝癌細(xì)胞凋亡的實(shí)驗(yàn)研究[D]. 張毅.吉林大學(xué) 2012
[3]IUGR豬的生長(zhǎng)與腸道發(fā)育及L-精氨酸和大豆卵磷脂的營(yíng)養(yǎng)調(diào)控研究[D]. 王遠(yuǎn)孝.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
碩士論文
[1]eRF1的C端結(jié)構(gòu)域在終止密碼子識(shí)別過(guò)程中的功能[D]. 閆靜.山西大學(xué) 2017
[2]日本血吸蟲(chóng)性相關(guān)Tsunagi基因的克隆、表達(dá)及初步鑒定[D]. 王曉楠.安徽醫(yī)科大學(xué) 2008
本文編號(hào):2932534
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