南海冷泉微生物多樣性分析及一株新菌的鑒定
發(fā)布時(shí)間:2020-12-12 00:25
深海占據(jù)了約三分之二的地球總面積,是全球最大的生態(tài)系統(tǒng),含有豐富的生物資源,但由于深海研究起步晚、難度大,人們對(duì)這一生態(tài)系統(tǒng)及其中生物的了解還十分有限。冷泉系統(tǒng)由海底碳?xì)浠衔餄B漏形成,是深海貧瘠環(huán)境中的“綠洲”,在世界范圍內(nèi)廣泛存在。大多數(shù)冷泉系統(tǒng)富含甲烷和硫化氫,其中參與硫循環(huán)和甲烷循環(huán)的硫氧化菌、硫酸鹽還原菌和甲烷氧化古菌等微生物在該生態(tài)系統(tǒng)中發(fā)揮著極其重要的作用。本文針對(duì)2017年“科學(xué)號(hào)”科學(xué)考察船在南海臺(tái)灣西南部冷泉區(qū)采集的水體和沉積物樣品,利用非培養(yǎng)法和培養(yǎng)法對(duì)其中的微生物進(jìn)行了分析。我們通過(guò)16S rDNA高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)來(lái)源于南海冷泉滲漏區(qū)、非滲漏區(qū)以及非冷泉區(qū)的水體和沉積物樣品進(jìn)行了微生物群落結(jié)構(gòu)分析。通過(guò)將冷泉區(qū)樣品與其他樣品中的微生物進(jìn)行比較分析,我們發(fā)現(xiàn)冷泉區(qū)存在著獨(dú)特的微生物群落結(jié)構(gòu):冷泉區(qū)樣品中大量存在參與硫循環(huán)和甲烷循環(huán)的微生物,其含量遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于非滲漏區(qū)和非冷泉區(qū),且沉積物中微生物群落隨深度變化表現(xiàn)出明顯的分布特征。具體來(lái)說(shuō),冷泉滲漏區(qū)水體及表層0-8 cm沉積物樣品中存在大量的硫氧化菌Sulfurovum,占總OTU(operational taxono...
【文章來(lái)源】:中國(guó)科學(xué)院大學(xué)(中國(guó)科學(xué)院海洋研究所)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:94 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
采樣位置
南海冷泉區(qū)各樣品測(cè)序結(jié)果
辛普森指數(shù) 0.343 0.006** 0.181ACE 指數(shù) 0.265 0.266 0.032*Chao1 0.281 0.231 0.028*p 值為 0.05。**表示組間有極顯著差異(p<0.01),*表示組間有顯著差異(p<0.05)。CSP為非冷泉區(qū)沉積物樣品,CSRP 為冷泉區(qū)沉積物樣品,CSW 為水體樣品。(2)物種多樣性曲線描述各樣品組內(nèi)菌群多樣性的曲線為稀釋曲線(Rarefaction Curve)和等級(jí)聚類曲線(Rank Abundance Curve),二者既可說(shuō)明各樣本的物種豐富度,也可說(shuō)明測(cè)序數(shù)據(jù)的合理性。各樣品組的稀釋曲線和等級(jí)聚類曲線(圖 2.3)均隨測(cè)序深度的增加逐漸趨向平坦,表明測(cè)序數(shù)據(jù)量漸進(jìn)合理,測(cè)序深度足夠,所有文庫(kù)都有較好的說(shuō)明性。
本文編號(hào):2911501
【文章來(lái)源】:中國(guó)科學(xué)院大學(xué)(中國(guó)科學(xué)院海洋研究所)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:94 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
采樣位置
南海冷泉區(qū)各樣品測(cè)序結(jié)果
辛普森指數(shù) 0.343 0.006** 0.181ACE 指數(shù) 0.265 0.266 0.032*Chao1 0.281 0.231 0.028*p 值為 0.05。**表示組間有極顯著差異(p<0.01),*表示組間有顯著差異(p<0.05)。CSP為非冷泉區(qū)沉積物樣品,CSRP 為冷泉區(qū)沉積物樣品,CSW 為水體樣品。(2)物種多樣性曲線描述各樣品組內(nèi)菌群多樣性的曲線為稀釋曲線(Rarefaction Curve)和等級(jí)聚類曲線(Rank Abundance Curve),二者既可說(shuō)明各樣本的物種豐富度,也可說(shuō)明測(cè)序數(shù)據(jù)的合理性。各樣品組的稀釋曲線和等級(jí)聚類曲線(圖 2.3)均隨測(cè)序深度的增加逐漸趨向平坦,表明測(cè)序數(shù)據(jù)量漸進(jìn)合理,測(cè)序深度足夠,所有文庫(kù)都有較好的說(shuō)明性。
本文編號(hào):2911501
本文鏈接:http://sikaile.net/projectlw/swxlw/2911501.html
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