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雙孢線(xiàn)蟲(chóng)草不同生境微生物多樣性及宏基因組研究

發(fā)布時(shí)間:2020-10-18 13:35
   雙孢線(xiàn)蟲(chóng)草Ophiocordyceps bispora為亞洲新紀(jì)錄種,目前還沒(méi)有關(guān)于雙孢線(xiàn)蟲(chóng)草不同生境之間的研究。本研究采用高通量測(cè)序技術(shù),通過(guò)宏基因研究手段,對(duì)五個(gè)不同生境下的雙孢線(xiàn)蟲(chóng)草進(jìn)行分析,主要獲得以下結(jié)果:為了比較五個(gè)不同生境下雙孢線(xiàn)蟲(chóng)草微生物多樣性之間的差異,采集哀牢山五個(gè)不同生境下成熟的雙孢線(xiàn)蟲(chóng)草進(jìn)行研究,進(jìn)行擴(kuò)增子分析,通過(guò)α、β-多樣性分析探究不同生境下雙孢線(xiàn)蟲(chóng)草的異同點(diǎn);ò陥D結(jié)果顯示Ob.alD和Ob.alC中獨(dú)有的OTU最多,穩(wěn)定性高于其余三組;UPGMA聚類(lèi)樹(shù)對(duì)樣品進(jìn)行等級(jí)聚類(lèi),Ob.alD在真菌和細(xì)菌中與其他組差異度最大;通過(guò)對(duì)細(xì)菌優(yōu)勢(shì)菌群分析可得,Pseudomonas假單胞菌屬所占優(yōu)勢(shì)最大,而且Ob.alA的物種豐富度最高;通過(guò)對(duì)真菌優(yōu)勢(shì)菌群分析結(jié)果顯示,多個(gè)蟲(chóng)草真菌屬都被注釋到,這一發(fā)現(xiàn)研究?jī)r(jià)值很高。為比較五個(gè)不同生境下雙孢線(xiàn)蟲(chóng)草功能基因之間的差異,對(duì)擴(kuò)增子分析進(jìn)行進(jìn)一步的研究,基于宏基因技術(shù)手段,在門(mén)水平上Ob.alA和Ob.alB組物種組成成分相似與Ob.alD差異最大,而且Ob.alA和Ob.alB兩個(gè)生境都為草地,這樣的結(jié)果暗示與生境有著較大的關(guān)系。KEGG代謝通路中將差距最大的為Ob.alA和Ob.alD進(jìn)行比較,氨基酸的生物合成呈上調(diào)趨勢(shì),擴(kuò)增子結(jié)果顯示Ob.alA組比Ob.alD組細(xì)菌物種多樣性和群落豐富度高,暗示Ob.alA組碳水化合物代謝和氨基酸代謝比Ob.alD組高,與Ob.alA組細(xì)菌群落豐度和多樣性指數(shù)高有關(guān);Ob.alA組生活環(huán)境復(fù)雜,Ob.alD生活環(huán)境簡(jiǎn)單,所以O(shè)b.alA為了能夠更好適應(yīng)環(huán)境,與自我保護(hù)反應(yīng)中谷胱氨酸相關(guān)的甘氨酸的合成有一定的關(guān)系?剐曰蜃⑨尳Y(jié)果顯示,ARO從整體上來(lái)看Ob.alC和Ob.alD豐度都要低于其余三組,且Ob.alD較之其余四組缺少四環(huán)素抗性基因家族(Tet)中的TetX。據(jù)文獻(xiàn)記載,遠(yuǎn)離人群的環(huán)境其抗性基因的濃度要遠(yuǎn)遠(yuǎn)低于受人類(lèi)活動(dòng)干擾的環(huán)境里的抗性基因的濃度,而Ob.alA、Ob.alB組的生境靠近農(nóng)田且經(jīng)常有村民經(jīng)過(guò);Ob.alC組靠近山頂且周?chē)嵌盖蜕降匾约皹?shù)木密集不宜人群活動(dòng);Ob.alD組是山頂,人群經(jīng)過(guò)更少;Ob.alE組是一片稀疏的針葉林,經(jīng)常會(huì)有村民放牧、伐樹(shù)、采菌等活動(dòng),接近人群,說(shuō)明造成這種現(xiàn)象的原因與生境和人群活動(dòng)有關(guān)。本研究分析不同生境下雙孢線(xiàn)蟲(chóng)草的微生物多樣性及宏基因組研究,明確不同生境下雙孢線(xiàn)蟲(chóng)草之間微生物存在差異,真菌菌群的多重寄生現(xiàn)象具有很大的研究?jī)r(jià)值。同時(shí),通過(guò)宏基因研究手段,獲得雙孢線(xiàn)蟲(chóng)草不同生境代謝通路功能基因和抗性基因的差異,對(duì)研究其生境以及生長(zhǎng)機(jī)理提供一定的指導(dǎo)意義。
【學(xué)位單位】:云南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類(lèi)】:Q93
【部分圖文】:

線(xiàn)蟲(chóng),采樣點(diǎn),生境


用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)的開(kāi)展。??1.3采樣點(diǎn)設(shè)置??本研宄采樣點(diǎn)如(圖2.1)所示,共5個(gè)??的丨爲(wèi)??__??圖2.1雙孢線(xiàn)蟲(chóng)草采樣點(diǎn)生境??Fig.?2.1?Samplin?habitat?of?Ophiocordyceps?bispora??10??

曲線(xiàn),線(xiàn)蟲(chóng),箱型,曲線(xiàn)


圖2.3不同生境雙孢線(xiàn)蟲(chóng)草累積箱型圖a?16S;b?ITS??

指數(shù)組,箱型,線(xiàn)蟲(chóng),細(xì)菌


Observed?Species。指數(shù)表明,雙孢線(xiàn)蟲(chóng)草內(nèi)生菌中細(xì)菌比真菌明顯有更高的物種??豐富度。而細(xì)菌和真菌所有指數(shù)的P值都在0.2-1.0之間,由此可以說(shuō)明不同樣點(diǎn)??雙孢線(xiàn)蟲(chóng)草中的細(xì)菌和真菌的差異不顯著(P<〇.〇5表明差異顯著)。從圖2.4香農(nóng)??箱型圖中可以看出,五個(gè)不同生境中細(xì)菌香農(nóng)指數(shù)??Ob.alB>Ob.alA>Ob.alC>Ob.alE>Ob.alD,即細(xì)菌群落多樣性?Ob.alA?最高,Ob.alD??最低,說(shuō)明雙孢線(xiàn)蟲(chóng)草的細(xì)菌多樣性在山頂紫砂石生境下多樣性最低;五個(gè)不同??生境中真菌香農(nóng)指數(shù)0b.alB>0b.alC>0b.alD>0b.alE>0b.alA,即真菌群落多樣性??Ob.alB?最多,Ob.alA?最低。??表2.3不同生境雙孢蟲(chóng)草微生物多樣性指數(shù)??Table?2.3?Microbial?a-diversity?indices?of?different?habitats?of?Ophiocordyceps?bispora??group?observed—species?shannon?simpson?chaol?ACE?goods—coverage??Ob.alA?421?3.666?0.722?466.023?477.26?0.998??Ob.alB?435?3.907?0.784?482.223?488.655?0.998??16s?Ob.alC?296?2.767?0.621?333.594?340.826?0.999??O
【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2846363

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