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甜菜抗旱相關(guān)NAC轉(zhuǎn)錄因子基因的克隆與功能驗證

發(fā)布時間:2020-08-15 12:20
【摘要】:甜菜(Beta vulgaris L.)是我國北方地區(qū)的主要糖料作物和經(jīng)濟作物,北方地區(qū)干旱缺水伴隨周期性旱災是制約甜菜產(chǎn)量提高的主要因素。迄今為止,許多植物中與抗旱相關(guān)的NAC轉(zhuǎn)錄因子的基因已經(jīng)被克隆并進行相關(guān)功能的鑒定,但是對甜菜NAC轉(zhuǎn)錄因子家族基因與甜菜抗旱性的相關(guān)研究鮮見報道。本研究通過發(fā)掘干旱誘導的甜菜NAC轉(zhuǎn)錄因子,為闡明甜菜抗旱分子機理和培育抗逆甜菜新材料提供理論依據(jù)。主要研究結(jié)果如下:1.以NAC保守結(jié)構(gòu)域序列為檢索序列對甜菜NAC轉(zhuǎn)錄因子家族成員進行搜索鑒定。對甜菜NAC轉(zhuǎn)錄因子家族成員進行蛋白質(zhì)氨基酸組分和理化性質(zhì)分析、系統(tǒng)進化關(guān)系分析、基因染色體定位及蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域保守性預測;并通過RNA-seq和qRT-PCR分析甜菜NAC基因在水分脅迫下的表達變化。結(jié)果表明:甜菜NAC家族基因共有52個成員,其中50個在9條染色體上不均等分布,2個目前尚未定位;其編碼的蛋白所含氨基酸殘基數(shù)從48到711不等,其中17個為堿性蛋白質(zhì),4個為親水性蛋白質(zhì);52個成員可分為2類,Ⅰ類有38個成員,Ⅱ類有14個成員;同類成員有相近的保守元件,而外顯子和內(nèi)含子數(shù)目具有高變異性;在水分脅迫下甜菜NAC家族成員中共有23個基因上調(diào)表達。2.通過RNA-seq及qRT-PCR分析對甜菜NAC基因家族中的抗旱相關(guān)基因,并對其中兩個抗旱候選基因進行了克隆。從抗旱甜菜品種HI0466中克隆到Bv_twas和Bv hdfh基因完整的CDS片段,其長度分別為1095 bp和912 bp。Bv_hdth基因CDS區(qū)堿基序列與基因組數(shù)據(jù)一致,而Bv_twas基因CDS區(qū)與基因組序列存在9個堿基的差異。3.將Bv_twas和Bv_hdfh在擬南芥中異源過表達,干旱脅迫下,轉(zhuǎn)基因株系根長及側(cè)根數(shù)量增加,地上部長勢也優(yōu)于野生型;轉(zhuǎn)基因擬南芥葉片的SOD、CAT活性高于野生型,但POD活性無明顯差異;相對電導率則低于野生型,表明Bv_twas和Bv_hdf具有耐旱功能。
【學位授予單位】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:Q943.2;S566.3
【圖文】:

甜菜,條染,基因家族,轉(zhuǎn)錄因子


邐-0.674逡逑3.1.2甜菜似C家族基因的染色體定位分析逡逑將52個價也4C家族基因進行染色體定位(圖2),發(fā)現(xiàn)其中的50個成員逡逑在甜菜9條染色體上均有分布。其中第VI條染色體上分布基因最多,共有10逡逑個基因,其次為第I條和第IV條染色體,分別分布有8個和9個基因;定位逡逑到第II、V、VIII條染色體上的基因均為5個;定位到第IX條染色體上的基逡逑因有4個;在第III條和第VII條染色體上分布的基因最少,分R%只有兩個基逡逑因。有2個基因

系統(tǒng)進化分析,模體,家族


3.邋1.邋3甜菜似C家族基因的系統(tǒng)發(fā)育分析及保守性模體分析逡逑將BvNAC家族蛋白序列與擬南芥105個NAC家族蛋白序列用NJ法構(gòu)建系逡逑統(tǒng)進化樹(圖3),并根據(jù)BvNAC家族成員與擬南芥NAC家族成員的進化關(guān)系逡逑將BvNAC轉(zhuǎn)錄因子家族成員進行功能分類。逡逑根據(jù)Ooka等w對擬南芥和水稻NAC家族系統(tǒng)進化樹分組的方法,將甜菜逡逑NAC家族按蛋白的NAC結(jié)構(gòu)域序列相似性分成兩大組,第I大組又分為13個逡逑亞家族,第II大組分為5個亞家族,其中只有3個亞家族中含有BvNAC家族逡逑成員(圖3)。分入第I大組第II亞家族的BvNAC家族成員最多,為9個;逡逑而分入第I大組第Ic、If、Ig、Ii、Ik、Im六個亞家族的BvNAC成員最少,逡逑均為1個。逡逑對BvNAC蛋白序列進行保守性模體預測,共得到13個保守性模體,其中逡逑模體2、4、1、5、6分別代表NAC類轉(zhuǎn)錄因子A、B、C、D、E亞結(jié)構(gòu)域。所有逡逑BvNAC家族成員均含有3?8個模體,且均含有模體5邋(圖4)。根據(jù)系統(tǒng)進化逡逑樹的分組和保守模體分析可將所有BvNAC家族成員分成兩大組:第I大組基因逡逑蛋白序列相對保守

干旱脅迫


圖6邐家族基因在干旱脅迫條件下的?

【參考文獻】

相關(guān)期刊論文 前5條

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3 Haihong Shang,Wei Li;Changsong Zou;Youlu Yuan;;Analyses of the NAC Transcription Factor Gene Family in Gossypium raimondii Ulbr.:Chromosomal Location,Structure,Phylogeny,and Expression Patterns[J];Journal of Integrative Plant Biology;2013年07期

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5 柳展基;邵鳳霞;唐桂英;;植物NAC轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)功能及其表達調(diào)控研究進展[J];西北植物學報;2007年09期

相關(guān)博士學位論文 前2條

1 韓曉敏;中間錦雞兒3個非生物脅迫相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子的克隆與功能分析[D];內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學;2015年

2 周立國;水稻水分脅迫相關(guān)基因克隆及功能驗證[D];華中農(nóng)業(yè)大學;2010年

相關(guān)碩士學位論文 前1條

1 孫宗艷;鹽/干旱脅迫下甜菜幼苗中miR160/164及其靶基因的表達與分析[D];哈爾濱工業(yè)大學;2017年



本文編號:2794104

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