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snx-3(tm1595)線(xiàn)蟲(chóng)腸細(xì)胞中自噬小體積累的機(jī)制研究

發(fā)布時(shí)間:2020-07-27 11:08
【摘要】:自噬(autophagy)是一類(lèi)進(jìn)化上保守的細(xì)胞內(nèi)降解過(guò)程,主要是將細(xì)胞內(nèi)老化或多余的細(xì)胞成份運(yùn)送到溶酶體中進(jìn)行降解。具有雙層膜結(jié)構(gòu)的自噬小體包裹著自噬底物,與內(nèi)吞小體及溶酶體融合或者直接與溶酶體融合,隨后自噬小體包裹的自噬底物被溶酶體中的水解酶降解,降解過(guò)程釋放的能量以及降解后產(chǎn)生的氨基酸小分子可以被細(xì)胞重新利用。自噬在維持細(xì)胞內(nèi)穩(wěn)態(tài)、生長(zhǎng)發(fā)育、免疫能力、分化重建中也具有重要的作用。分選蛋白(SNXs)能夠在胞內(nèi)完成轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的分揀,進(jìn)而對(duì)內(nèi)吞體進(jìn)行精細(xì)調(diào)控。分選連接蛋白3(sorting nexin 3,SNX3)是SNX~(PX)類(lèi)蛋白的一個(gè)成員,目前研究的最多的功能是SNX3調(diào)控細(xì)胞內(nèi)蛋白轉(zhuǎn)運(yùn),內(nèi)吞體成熟與分選等,SNX3在自噬過(guò)程中的作用還沒(méi)有被很好的探究。有研究表明線(xiàn)蟲(chóng)(C.elegans)體內(nèi)snx-3基因突變后會(huì)造成一系列發(fā)育障礙。我們利用成像研究觀察到snx-3(tm1595)線(xiàn)蟲(chóng)腸細(xì)胞中自噬小體相關(guān)結(jié)構(gòu)的標(biāo)記蛋白LGG-1蛋白出現(xiàn)明顯積累,生化結(jié)果也表明GFP::LGG-1含量增多。ATG-13、BEC-1和ATG-7在自噬小體的形成過(guò)程中發(fā)揮著重要作用,我們利用成像技術(shù)觀察到snx-3分別與atg-13,bec-1以及atg-7雙突變的線(xiàn)蟲(chóng)腸細(xì)胞中LGG-1的含量明顯減少,表明snx-3(tm1595)線(xiàn)蟲(chóng)腸細(xì)胞中LGG-1增多是由于自噬活動(dòng)導(dǎo)致。因此我們以秀麗線(xiàn)蟲(chóng)為模式生物,探究了snx-3(tm1595)線(xiàn)蟲(chóng)腸細(xì)胞中LGG-1增多的原因。我們首先想知道snx-3(tm1595)線(xiàn)蟲(chóng)體內(nèi)自噬通量(autophagic flux)的水平,自噬通量可以衡量細(xì)胞降解活性。使用mCherry::GFP::LGG-1標(biāo)記區(qū)分自噬小體與自噬溶酶體,我們觀察到snx-3(tm1595)線(xiàn)蟲(chóng)腸細(xì)胞中自噬小體含量明顯升高,自噬溶酶體含量沒(méi)有明顯變化,推測(cè)snx-3(tm1595)線(xiàn)蟲(chóng)體內(nèi)自噬通量下降。自噬底物W07G4.5聚集體增多證明snx-3(tm1595)線(xiàn)蟲(chóng)體內(nèi)自噬通量下降。我們分別對(duì)snx-3(tm1595)線(xiàn)蟲(chóng)腸細(xì)胞中自噬小體的生成、自噬小體與溶酶體的融合和自噬小體在溶酶體中的降解三個(gè)階段進(jìn)行檢測(cè)。干擾CUP-5的表達(dá)或者使用Baf A1處理破壞溶酶體的功能后,snx-3(tm1595)線(xiàn)蟲(chóng)腸細(xì)胞中自噬小體沒(méi)有進(jìn)一步升高,而且snx-3突變后daf-2(e1370)線(xiàn)蟲(chóng)體內(nèi)LGG-1的含量升高,表明SNX-3不參與自噬早期階段中自噬小體的生成,snx-3(tm1595)線(xiàn)蟲(chóng)腸細(xì)胞中自噬小體沒(méi)有被誘導(dǎo)增多。Baf A1處理后不影響snx-3(tm1595)線(xiàn)蟲(chóng)腸細(xì)胞中自噬小體和自噬溶酶體的分布,表明snx-3(tm1595)線(xiàn)蟲(chóng)體內(nèi)自噬小體與溶酶體的融合或者自噬小體在溶酶體中的降解存在障礙。通過(guò)統(tǒng)計(jì)比較與溶酶體融合的自噬小體所占的比例,我們發(fā)現(xiàn)snx-3(tm1595)線(xiàn)蟲(chóng)腸細(xì)胞中自噬小體與溶酶體融合減慢。LysoTracker可以檢測(cè)并反映溶酶體的酸性情況和功能強(qiáng)弱,使用LysoTracker標(biāo)記溶酶體我們觀察到snx-3(tm1595)線(xiàn)蟲(chóng)腸細(xì)胞中溶酶體功能正常。另外,通過(guò)饑餓誘導(dǎo)自噬觀察LGG-1標(biāo)記的自噬結(jié)構(gòu)蛋白的降解,我們發(fā)現(xiàn)snx-3(tm1595)線(xiàn)蟲(chóng)腸細(xì)胞中自噬小體在溶酶體中的降解正常?傊,本論文工作證明了snx-3(tm1595)線(xiàn)蟲(chóng)體內(nèi)自噬通量降低,降解活性下降。snx-3(tm1595)線(xiàn)蟲(chóng)腸細(xì)胞中積累的LGG-1主要是因?yàn)樽允赏砥陔A段自噬小體與溶酶體的融合速率減慢。本文初步探究證明了在線(xiàn)蟲(chóng)中SNX-3可以通過(guò)影響自噬過(guò)程中自噬小體與溶酶體的融合過(guò)程參與自噬過(guò)程,這為進(jìn)一步研究SNX-3在自噬過(guò)程的具體作用分子機(jī)制提供了基礎(chǔ)和參考依據(jù)。
【學(xué)位授予單位】:華中科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類(lèi)號(hào)】:Q25
【圖文】:

過(guò)程圖,自噬,過(guò)程


華 中 科 技 大 學(xué) 碩 士 學(xué) 位 論 文構(gòu)的自噬小體包裹需要降解的細(xì)胞質(zhì)成分轉(zhuǎn)運(yùn)到溶酶體降解,當(dāng)自噬過(guò)程發(fā)生缺陷如自噬出現(xiàn)下調(diào)或者過(guò)度上調(diào)時(shí)都會(huì)破壞細(xì)胞內(nèi)穩(wěn)態(tài)平衡。目前在線(xiàn)蟲(chóng)體內(nèi)對(duì)于自噬過(guò)程的研究主要是巨自噬,因?yàn)闆](méi)有研究數(shù)據(jù)證明線(xiàn)蟲(chóng)體內(nèi)存在另外兩種形式的自噬途徑[9]。

自噬,步驟,過(guò)程


當(dāng)營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)缺乏時(shí),TORC1 從溶酶體膜上被釋放,自噬過(guò)程被誘導(dǎo)[13, 14],持續(xù)的自噬活動(dòng)會(huì)補(bǔ)充營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),進(jìn)而又重新激活 TOR 抑制自噬。AMPK 信號(hào)路徑也通過(guò)感知營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)來(lái)調(diào)節(jié)自噬過(guò)程[15]。營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)充足的情況下,mTORC1 被激活,激活的 mTORC1 磷酸化 ULK1/Atg1,磷酸化的 ULK1/Atg1不能與 AMPK 結(jié)合,因此 ULK1/Atg1 處于失活狀態(tài),自噬過(guò)程被抑制;營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)缺乏時(shí),AMPK 直接與 ULK1/Atg1 結(jié)合,并磷酸化激活 ULK1/Atg1 所需要的位點(diǎn),因此AMPK 可以通過(guò)抑制 mTORC1 的活性,激活 ULK1/Atg1 誘導(dǎo)復(fù)合物來(lái)誘導(dǎo)自噬。人們發(fā)現(xiàn)自噬過(guò)程到現(xiàn)在已經(jīng)有 50 余年,但是近十年才對(duì)自噬過(guò)程調(diào)節(jié)的分子機(jī)制有所研究。在酵母自噬基因的有關(guān)研究中,發(fā)現(xiàn) ATG 蛋白家族中約 30 個(gè)基因參與調(diào)控自噬過(guò)程,它們分別作用于細(xì)胞自噬過(guò)程中的各個(gè)步驟,成為調(diào)控自噬的主要機(jī)制[16],這些 ATG 蛋白具有高度保守性,參與從單細(xì)胞生物到多細(xì)胞生物的自噬調(diào)控過(guò)程。自噬過(guò)程可以分為五個(gè)不同的事件[3]:自噬的起始、吞噬泡的延伸、自噬小體的成熟、自噬小體與溶酶體融合、自噬小體包裹物在溶酶體中降解(圖 1.2)。

自噬,分子機(jī)制


被 Atg4 切割下來(lái),循環(huán)到細(xì)胞質(zhì)中。Atg8 參與調(diào)節(jié)膜結(jié)構(gòu)的延伸以及自噬小體的體積大小,Atg8 還可以作為接頭蛋白通過(guò)結(jié)合包含 Atg8 家族蛋白結(jié)合區(qū)域(AIM)的蛋白將它們募集到自噬小體[28]。在線(xiàn)蟲(chóng)中的研究也識(shí)別出了兩類(lèi)泛素樣復(fù)合物。LGG-1 和 LGG-2 是線(xiàn)蟲(chóng)體內(nèi) Atg8 的同源物,但是 LGG-1 與哺乳動(dòng)物中 GABARAP相關(guān)性更強(qiáng),而 LGG-2 與哺乳動(dòng)物中 LC3 相關(guān)性更強(qiáng)。LGG-1 和 LGG-2 可以與包含 LIR/AIM 結(jié)構(gòu)域的蛋白結(jié)合,但是它們?cè)谧允蛇^(guò)程的功能不同[9, 29]。LGG-1 參與自噬小體的形成以及自噬小體與溶酶體的融合,LGG-2 參與自噬小體與溶酶體的融合。LGG-1 在 LGG-2 的上游起作用,可以募集 LGG-2 到自噬小體,使自噬小體與晚期內(nèi)吞體/溶酶體的融合。線(xiàn)蟲(chóng)體內(nèi)有兩種 Atg4 半胱氨酸蛋白酶的同源基因ATG-4.1 和 ATG-4.2。LGG-1 被 ATG-4.1 或 ATG-4.2 切割后,產(chǎn)生 LGG-1-I 的形式,在 ATG-7 和 ATG-3 作用下產(chǎn)生 LGG-1-II 的形式。LGG-1 和 LGG-2 的含量以及不同形式可以通過(guò)生化實(shí)驗(yàn)進(jìn)行檢測(cè),LGG-1 在維持線(xiàn)蟲(chóng)的生長(zhǎng)發(fā)育以及繁衍后代的能力中具有重要作用,而 LGG-2 在其中的作用不明顯[30]。

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