活額寄居蟹科(十足目:異尾下目:寄居蟹總科)分子系統(tǒng)學研究
發(fā)布時間:2020-07-03 11:43
【摘要】:活額寄居蟹科Diogenidae Ortmann,1982隸屬于異尾下目(Anomura)寄居蟹總科(Paguroidea),是寄居蟹總科的第二大科。細螯寄居蟹屬Clibanarius Dana,1852是活額寄居蟹科多樣性較高的屬之一,然而,目前關于該屬系統(tǒng)發(fā)育關系的研究卻很少。本研究采用了 2種線粒體基因(16S rRNA和COI)和2種核蛋白編碼基因(NaK和PEPCK)聯(lián)合數(shù)據(jù)集重建了細螯寄居蟹屬的系統(tǒng)發(fā)育關系。研究共選取了來自印度-西太平洋海域的11種細螯寄居蟹,采用了最大似然法和貝葉斯推斷法構建了系統(tǒng)進化樹,得到結果如下:橙紅細螯寄居蟹C rutilus和下齒細螯寄居蟹C.infraspinatus聚為一支,親緣關系較近,白刺細螯寄居蟹C.snelliusi獨立于該分支之外;扁長細螯寄居蟹C.longitarsus和條紋細螯寄居蟹C striolatus聚為一支,親緣關系較近;墨吉細螯寄居蟹C.merguiensis,蘭指細螯寄居蟹C.englaucus和微小細螯寄居蟹C.humilis聚為一支,親緣關系較近,蘭綠細螯寄居蟹C.virescens獨立于該分支之外。研究結果不支持根據(jù)指節(jié)和掌節(jié)長度的不同對細螯寄居蟹屬進行劃分,推測尾節(jié)中縫這一形態(tài)特征對細螯寄居蟹屬的物種劃分可能更具有分類學意義。目前關于活額寄居蟹科內(nèi)部系統(tǒng)演化關系的研究很少。本研究通過采用2種線粒體基因(16S rRNA和COI)和2種核蛋白編碼基因(NaK和PEPCK)聯(lián)合數(shù)據(jù)集進行了活額寄居蟹科系統(tǒng)演化關系的研究。結果表明:研究所涉及的活額寄居蟹科14屬52種可大致分為3大支;支持細螯寄居蟹屬Clibanarius,硬殼寄居蟹屬Calcius,真寄居蟹屬Dardanus,似寄居蟹屬Paguropsina和活額寄居蟹屬Diogenes的單系性;長眼寄居蟹屬Paguristes和窩長眼寄居蟹屬Areopaguristes為多系群,活額寄居蟹科則為并系發(fā)生。長眼寄居蟹屬和窩長眼寄居蟹屬的分類學地位可能存在問題,需要結合形態(tài)特征分析對二者及其下種分類單元進行重新修訂。此外,分化時間分析顯示活額寄居蟹科起源于侏羅紀中期(c.169.59 Mya,95%HPD:189.29-148.13 Mya),并于白堊紀早期(c.142.02 Mya,95%HPD:164.45-121.78 Mya)由淺海遷移到深海,但仍有部分物種留在淺海,具有多次入侵深海的演化歷史。本研究首次聯(lián)合線粒體和核基因探究了細螯寄居蟹屬的種間關系,并對活額寄居蟹科的系統(tǒng)發(fā)育關系進行了較為全面的研究,為活額寄居蟹科系統(tǒng)演化關系的研究和分類系統(tǒng)的修訂提供了分子生物學的證據(jù),也為異尾下目的系統(tǒng)演化研究提供了基礎資料。
【學位授予單位】:中國科學院大學(中國科學院海洋研究所)
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:Q959
【圖文】:
種細螯寄居蟹的左第三步足(引自沙忠利等,2015)。扁長細螯寄居蟹、下齒寬胸細螯寄居蟹、白刺細螯寄居蟹、微小細螯寄居蟹、條紋細螯寄居蟹:指節(jié)略長于掌節(jié);橙紅細螯寄居蟹、珊瑚細螯寄居蟹、蘭綠細螯寄居蟹、墨吉細螯蟹、蘭指細螯寄居蟹:指節(jié)短于掌節(jié)逡逑re邋2.1邋Left邋third邋pereopod邋of邋eleven邋Clibanarius邋species邋(cited邋in邋Sha邋et邋al.,邋2015).邋C.逡逑sus,邋C.邋infraspinatus,邋C.邋eurysternus,邋C.邋snelliusi,邋C.邋humilis邋and邋C.邋striolatus:邋the邋dactal邋to邋or邋slightly邋longer邋than邋the邋propodus;邋C.邋rutilus,邋C.邋corallinus,邋C.邋virescens,邋C.逡逑merguiensis邋and邋C.邋englaucus:邋the邋dactyl邋shorter邋than邋the邋propodus逡逑A提取,PCR擴增和測序逡逑取螯足或步足的肌肉,約5-20邋mg,利用海洋動物組織基因組DNA提取基因組DNA。將獲得的DNA用200山的超純水洗脫并保存于-2中。采用聚合酶鏈式反應(PCR)擴增4種基因的序列片段,分別為:1
逡逑一致,如圖2.3。其結果能夠很好地解決細螯寄居蟹屬的內(nèi)部種間關系,比單獨逡逑基于線粒體基因和核蛋白編碼基因數(shù)據(jù)得到的結果可信度更高,因此,研宄選擇逡逑該一致樹作為細螯寄居蟹屬的系統(tǒng)進化樹。逡逑,邐Pagurtts邋iKholrusis邐邐I邐Hippo邋admlyla逡逑邐:—H^adocnla邐— ̄^邐;邐"…逡逑邐q邋slriofafttf邐I邐C邋strittlaXm逡逑I—iu0-(_j—C邋bngitarsusl邐_邐rM__J—(邋—w"逡逑871>_C.邋lottsiiarsm2邐_ ̄C.邋longilarsus2逡逑n邐"邋rCsndU^I邐邐rC.infraspinatUs3逡逑—邐M邐iwic邋.neUiusii邐——^邐infrmpimUusI逡逑56邐r<'邋eurvstcmusl邐「T55邐LC.邋inl'raspinatus}逡逑t邋—逡逑邐_jC—pi邋咖邋j邐sneUlusil逡逑n55|_P(邐^r—邐1邋001_r邋TntrWll/.vl>逡逑L-^邐95邋^邋infraspinatml邐阿邐r?邋W逡逑L_5T邐..r1'邐f?Tl__c邋eun-.rrernu.x2逡逑ruti/us2邐L邐「C.邋cvrattimal逡逑「(邋cnrallmusl邐?-C.邋ivrallinui;逡逑R?Lc邋a>rallutiu2邐.—邋C.邋vinwciu/逡逑-yy邐邐C.邋vinacetul邐0
本文編號:2739617
【學位授予單位】:中國科學院大學(中國科學院海洋研究所)
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:Q959
【圖文】:
種細螯寄居蟹的左第三步足(引自沙忠利等,2015)。扁長細螯寄居蟹、下齒寬胸細螯寄居蟹、白刺細螯寄居蟹、微小細螯寄居蟹、條紋細螯寄居蟹:指節(jié)略長于掌節(jié);橙紅細螯寄居蟹、珊瑚細螯寄居蟹、蘭綠細螯寄居蟹、墨吉細螯蟹、蘭指細螯寄居蟹:指節(jié)短于掌節(jié)逡逑re邋2.1邋Left邋third邋pereopod邋of邋eleven邋Clibanarius邋species邋(cited邋in邋Sha邋et邋al.,邋2015).邋C.逡逑sus,邋C.邋infraspinatus,邋C.邋eurysternus,邋C.邋snelliusi,邋C.邋humilis邋and邋C.邋striolatus:邋the邋dactal邋to邋or邋slightly邋longer邋than邋the邋propodus;邋C.邋rutilus,邋C.邋corallinus,邋C.邋virescens,邋C.逡逑merguiensis邋and邋C.邋englaucus:邋the邋dactyl邋shorter邋than邋the邋propodus逡逑A提取,PCR擴增和測序逡逑取螯足或步足的肌肉,約5-20邋mg,利用海洋動物組織基因組DNA提取基因組DNA。將獲得的DNA用200山的超純水洗脫并保存于-2中。采用聚合酶鏈式反應(PCR)擴增4種基因的序列片段,分別為:1
逡逑一致,如圖2.3。其結果能夠很好地解決細螯寄居蟹屬的內(nèi)部種間關系,比單獨逡逑基于線粒體基因和核蛋白編碼基因數(shù)據(jù)得到的結果可信度更高,因此,研宄選擇逡逑該一致樹作為細螯寄居蟹屬的系統(tǒng)進化樹。逡逑,邐Pagurtts邋iKholrusis邐邐I邐Hippo邋admlyla逡逑邐:—H^adocnla邐— ̄^邐;邐"…逡逑邐q邋slriofafttf邐I邐C邋strittlaXm逡逑I—iu0-(_j—C邋bngitarsusl邐_邐rM__J—(邋—w"逡逑871>_C.邋lottsiiarsm2邐_ ̄C.邋longilarsus2逡逑n邐"邋rCsndU^I邐邐rC.infraspinatUs3逡逑—邐M邐iwic邋.neUiusii邐——^邐infrmpimUusI逡逑56邐r<'邋eurvstcmusl邐「T55邐LC.邋inl'raspinatus}逡逑t邋—逡逑邐_jC—pi邋咖邋j邐sneUlusil逡逑n55|_P(邐^r—邐1邋001_r邋TntrWll/.vl>逡逑L-^邐95邋^邋infraspinatml邐阿邐r?邋W逡逑L_5T邐..r1'邐f?Tl__c邋eun-.rrernu.x2逡逑ruti/us2邐L邐「C.邋cvrattimal逡逑「(邋cnrallmusl邐?-C.邋ivrallinui;逡逑R?Lc邋a>rallutiu2邐.—邋C.邋vinwciu/逡逑-yy邐邐C.邋vinacetul邐0
【參考文獻】
相關期刊論文 前1條
1 肖麗嬋;王永良;沙忠利;;中國海真寄居蟹屬一新記錄種(寄居蟹總科,活額寄居蟹科)[J];海洋與湖沼;2014年01期
相關博士學位論文 前1條
1 楊頻;中國沼蝦屬分子系統(tǒng)學及日本沼蝦群體遺傳結構的研究[D];華東師范大學;2007年
本文編號:2739617
本文鏈接:http://sikaile.net/projectlw/swxlw/2739617.html
最近更新
教材專著