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擬南芥根毛發(fā)育基因AtGDPD-Like3關(guān)鍵氨基酸位點研究

發(fā)布時間:2020-06-14 13:43
【摘要】:根毛是由植株根系表皮的單細胞向外凸起形成的管狀結(jié)構(gòu)。根毛占根表面積的77%,它通過增加表皮細胞的吸收面積來促進植物對水分養(yǎng)分的攝取,實現(xiàn)植物的固著、與環(huán)境互作等。根毛發(fā)育是細胞極性生長的一種極端類型——頂端生長,可在十幾小時內(nèi)向特定方向生長十幾倍的細胞長度。這種頂端生長是一個復(fù)雜的過程,受到鈣離子濃度、磷酸肌醇、囊泡運輸、活性氧、細胞壁、細胞骨架等諸多因素的精細調(diào)控。AtGDPD-Lie是編碼甘油磷酸二酯磷酸二酯酶(GDPD)類似基因,其家族基因AtGDPD-Like3在擬南芥的根毛組織中高豐度表達。該基因的表達與擬南芥的根毛形態(tài)發(fā)生密切有關(guān),是根毛伸長所必須的,shv3缺失突變體導(dǎo)致嚴重的根毛發(fā)育缺陷。本實驗為了研究AtGDPD-Like3蛋白質(zhì)功能行使的作用機制,篩選鑒定了 AtGDPD-Like3蛋白質(zhì)氨基酸序列中決定其功能的關(guān)鍵位點,主要研究結(jié)果如下:利用三引物法鑒定了AtGDPD-Lie3基因的T-DNA插入突變體SALK_137845,半定量RT-PCR結(jié)果顯示SALK_137845是AtGDPDL-Like3的敲除突變體,該突變體atgdpdl3有著嚴重的根毛發(fā)育缺陷,其28d苗出現(xiàn)生長緩慢表型。擬南芥AtGDPD-Like3基因,其Locus位點為At4G26690,含有8個外顯子和7個內(nèi)含子,全長CDS序列包含2280個核苷酸、編碼759個氨基酸。同源性檢索發(fā)現(xiàn),在大豆、毛果楊、高粱等物種中均存在AtGDPD-Like3同源基因。通過序列的一致性比對分析,將 Asp86、Asp128、Ser206、Gly261、His289、Asp400、Ser538、Va1556、Asp628 這 9 個保守的氨基酸位點作為突變的目標(biāo)位點。為了鑒定AtGDPD-Like3關(guān)鍵氨基酸位點,針對AtGDPD-Like3蛋白質(zhì)中9個保守的氨基酸位點進行定點單突變,構(gòu)建了一系列攜帶不同單點突變的AtGDPD-Like3,并將其分別轉(zhuǎn)入atgdpdl3突變體菌株進行功能互補實驗。觀察各單點突變的AtGDPD-Like3恢復(fù)atgdpdl3突變體根毛缺陷程度并對根毛進行量化統(tǒng)計,發(fā)現(xiàn)AtGDPD-Like3蛋白質(zhì)中保守的第Asp86、His289突變后,不能恢復(fù)atgdpdl3突變體根毛發(fā)育缺陷表型,說明Asp86、His289突變后AtGDPD-Like3蛋白質(zhì)功能喪失,Asp86、His289是影響AtGDPD-Like3功能的關(guān)鍵氨基酸位點;AtGDPD-Like3蛋白質(zhì)中保守的第Ser206、Va1556、Asp628突變后均能明顯恢復(fù)atgdpdl3突變體根毛生長異常的表型,說明Ser206、Val556、Asp628突變后對AtGDPD-Like3的互補功能不起決定性作用,Ser206、Val556、Asp628不是影響AtGDPD-Like3蛋白質(zhì)功能的關(guān)鍵氨基酸位點;AtGDPD-Like3蛋白質(zhì)中保守的第Asp128、Gly261、Asp400、Ser538突變后只是部分恢復(fù)atgdpdl3突變體根毛發(fā)育缺陷表型,說明Asp128、Gly261、Asp400、Ser538突變后對AtGDPD-Like3功能行使也有一定的影響,Asp128、Gly261、Asp400、Ser538也是影響AtGDPD-Like3蛋白質(zhì)功能的較為關(guān)鍵的氨基酸位點。綜上,Asp86、Asp128、Gly261、His289、Asp400、Ser538 是 AtGDPD-Like3 蛋白質(zhì)氨基酸序列中決定其功能的關(guān)鍵位點;Ser206、Va1556、Asp628保守的氨基酸殘基不是影響AtGDPD-Like3蛋白質(zhì)功能的關(guān)鍵位點。
【學(xué)位授予單位】:東北林業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:Q943.2
【圖文】:

擬南芥根毛發(fā)育基因AtGDPD-Like3關(guān)鍵氨基酸位點研究


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