【摘要】：珊瑚礁是人類最重要的資源之一,而全球珊瑚礁自20世紀(jì)90年代至今卻一直處于衰退狀態(tài)。本文旨在通過(guò)對(duì)海南三亞的指形鹿角珊瑚(Acropora digitifera)、小葉鹿角珊瑚(Acropora microphthalma)、中間鹿角珊瑚(Acropora intermedia)、指狀薔薇珊瑚1(Montipora digitata)、指狀薔薇珊瑚2(Montipora digitata),風(fēng)信子鹿角珊瑚(Acropora hyacinthus)、Montipora vietnamensis和單星薔薇珊瑚(Montipora monasteriata)共七種鹿角珊瑚科(Acroporidae)珊瑚線粒體基因組結(jié)構(gòu)與系統(tǒng)發(fā)育研究,為珊瑚分類及珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)保護(hù)提供數(shù)據(jù)和理論基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下:本研究中7種珊瑚的線粒體基因組全序列長(zhǎng)度在17690 bp~18360 bp之間,均包括13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因、2個(gè)rRNA基因以及2個(gè)tRNA基因;堿基組成為T(mén)AGC,均表現(xiàn)出較高的AT含量。本研究中7種珊瑚均包含13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因,即ND1、ND2、ND3、ND4、ND4L、ND5、ND6、COI、COII、COIII、Cytb、ATP6和ATP8,都在H鏈進(jìn)行編碼,其排列順序和組成均一致,均含有2個(gè)tRNA基因,即tRNA~(Met)和tRNA~(Trp),其中tRNA~(Met)長(zhǎng)度均為71 bp,tRNA~(Trp)長(zhǎng)度均為70 bp,且形成穩(wěn)定的莖環(huán)結(jié)構(gòu)。12S rRNA和16S rRNA相對(duì)保守且位置固定,都位于H鏈。本文中7種珊瑚的線粒體蛋白質(zhì)編碼基因密碼子的第一位點(diǎn)、第二位點(diǎn)及第三位點(diǎn)的轉(zhuǎn)換和顛換均不存在明顯飽和現(xiàn)象。利用13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因密碼子三個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析,構(gòu)建鹿角珊瑚科NJ系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)以及貝葉斯系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),兩種方法構(gòu)建出的系統(tǒng)樹(shù)樹(shù)型大體相同。其中風(fēng)信子鹿角珊瑚(Acropora hyacinthus)、小葉鹿角珊瑚(Acropora microphthalma)數(shù)據(jù)結(jié)果與GenBank已有研究數(shù)據(jù)一致;指形鹿角珊瑚(Acropora digitifera)中間鹿角珊瑚(Acropora intermedia)與GenBank中已有研究數(shù)據(jù)具有一定差異,同種間遺傳距離為0.00076;指狀薔薇珊瑚(Montipora digitata)、Montipora vietnamensis、單星薔薇珊瑚(Montipora monasteriata)與GenBank中的Montipora peltiformis(KY094487)遺傳距離最近,分別為0.00034、0.00279和0.00102。研究結(jié)果表明,線粒體基因組全序列在鹿角珊瑚科內(nèi)不同屬之間具有較好的解析能力,能夠清晰的區(qū)分不同屬之間的珊瑚分類地位和系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,而在同屬不同種類之間,珊瑚的線粒體基因組結(jié)構(gòu)十分相近,線粒體基因組全序列難以清晰分辨不同種類之間的差異,不僅需要以經(jīng)典形態(tài)學(xué)分類為基礎(chǔ),還要結(jié)合部分核基因片段進(jìn)一步證明。
【圖文】：

1圖 1.1 全球珊瑚礁分布圖及其受威脅等級(jí)Figure 1.1 Global map of coral reefs and their threat levels

圖 1.2 珊瑚在刺細(xì)胞動(dòng)物分類中的位置[31]Figure 1.1 Position of coral in Cnidaria1.2.1 造礁石珊瑚的一般特征
【學(xué)位授予單位】：自然資源部第三海洋研究所
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2019
【分類號(hào)】：Q953

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本文編號(hào)：2704355