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中國(guó)沿海紅條毛膚石鱉(Acanthochitona rubrolineatus)系統(tǒng)地理學(xué)研究

發(fā)布時(shí)間:2020-04-14 20:09
【摘要】:海洋生物多樣性是生物多樣性的重要組成部分之一,F(xiàn)今海洋生物的遺傳結(jié)構(gòu)是更新世冰期、洋流、長(zhǎng)江沖淡水、海表溫度及生態(tài)環(huán)境因子等因素的綜合作用結(jié)果,目前海洋生物的研究熱點(diǎn)集中于揭示生物種群的生態(tài)遺傳及系統(tǒng)地理學(xué)研究。本論文以紅條毛膚石鱉(Acanthochitona rubrolineatus,Lischke,1873)為研究對(duì)象,隸屬多板綱(Polyplacophora)毛膚石鱉科(Acanthochitonidae)毛膚石鱉屬(Acanthochitona)。紅條毛膚石鱉主要棲息于潮間帶,具有狹溫性、狹鹽性、有限的擴(kuò)散能力以及較快的突變速度等特征,使得該物種成為系統(tǒng)地理學(xué)研究的理想對(duì)象。本論文以線粒體細(xì)胞色素氧化酶亞基I(mitochondrial cytochrome oxidase subunit I,mt COI)和16S核糖體RNA(16S ribosomal RNA,16S rRNA)的基因作為分子標(biāo)記,通過(guò)構(gòu)建中國(guó)潮間帶紅條毛膚石鱉現(xiàn)有種群的系統(tǒng)地理分布格局,試圖探討更新世冰期及物種生態(tài)環(huán)境等因素對(duì)潮間帶物種進(jìn)化及地理分布格局形成機(jī)制的影響。本研究共選取了16個(gè)地理種群,采集199個(gè)樣本。紅條毛膚石鱉mt COI基因的654 bp進(jìn)行分析,堿基含量分別為:A:28.83;T:29.35;C:8.96;G:32.86,共界定51個(gè)單倍型且占樣本量的25.63%。單倍型最多的樣地是大連、長(zhǎng)島、砣磯,單倍型H2出現(xiàn)的頻率最高?傮w單倍型多樣性為0.9125±0.0109,總體核苷酸多樣性為0.2340±0.1146。對(duì)樣本的16S rRNA基因的480 bp進(jìn)行分析,堿基含量分別為:A:23.88;T:48.58;C:12.53;G:15.00,共界定28個(gè)單倍型且占樣本量的0.14%。單倍型最多的樣地是長(zhǎng)島,單倍型H9出現(xiàn)的頻率最高。總體單倍型多樣性為0.8968±0.0083,總體核苷酸多樣性為0.1198±0.0639。AMOVA的分析表明紅條毛膚石鱉的遺傳變異主要來(lái)源于種群間。紅條毛膚石鱉種群生態(tài)遺傳分析。綜合mt COI和16S rRNA基因的生態(tài)遺傳研究分析,核苷酸多樣性、平均核苷酸差異數(shù)與年平均降水量變異系數(shù)、日照百分率、日照時(shí)數(shù)呈顯著正相關(guān),與年平均氣溫、年平均降水量及年平均水汽壓呈顯著負(fù)相關(guān)或存在相關(guān)趨勢(shì);單倍型多樣性與年平均降水量趨向顯著負(fù)相關(guān)。數(shù)據(jù)表明紅條毛膚石鱉種群的進(jìn)化受環(huán)境因子影響顯著,其中溫度和降水量是影響該物種生存及分布的主要環(huán)境因子,且遺傳多樣性與溫度和降水量呈負(fù)相關(guān)。又因?yàn)榧t條毛膚石鱉物種具有狹溫性和狹鹽性,推測(cè)該物種適宜生存的溫度和鹽度條件更接近黃渤海潮間帶的現(xiàn)存環(huán)境。紅條毛膚石鱉種群的系統(tǒng)地理學(xué)研究。中國(guó)邊緣海分為兩個(gè)譜系且存在顯著的遺傳分化:黃渤海譜系和東海譜系。遺傳分化指數(shù)Fst值、基因流Nm的數(shù)據(jù)分析表明紅條毛膚石鱉種群間存在顯著的遺傳結(jié)構(gòu);IBD的分析表明,種群間的遺傳距離與種群間實(shí)際地理距離之間存在顯著的距離遺傳模式(COI:R~2=0.810,P0.001;16S rRNA:R~2=0.859,P0.001)。分子鐘估算結(jié)果,黃渤海譜系與東海譜系大約在216.987Mya(COI)~204.371Mya(16S rRNA)開(kāi)始分化,對(duì)應(yīng)地質(zhì)時(shí)間中的三疊紀(jì)。種群歷史動(dòng)態(tài)分析發(fā)現(xiàn)總體樣本、黃渤海譜系及東海譜系的核苷酸不配對(duì)分布均呈現(xiàn)單峰分布,與群體突然擴(kuò)張模型下的預(yù)期分布基本吻合。黃渤海譜系和東海譜系的中性檢驗(yàn)說(shuō)明譜系均偏離中性但是不顯著,種群擴(kuò)張估計(jì)值的θ_1遠(yuǎn)高于θ_0,表明紅條毛膚石鱉兩譜系在近期歷經(jīng)了顯著的種群擴(kuò)張。根據(jù)公式τ=2μkt計(jì)算紅條毛膚石鱉種群的擴(kuò)張時(shí)間,黃渤海譜系的擴(kuò)張時(shí)間約在0.772Mya~0.406Mya,對(duì)應(yīng)中國(guó)第四紀(jì)間冰期的大姑-廬山間冰期,東海譜系種群擴(kuò)張時(shí)間約在0.194Mya~0.061Mya,對(duì)應(yīng)末次間冰期。
【圖文】:

紅條毛膚石鱉,表格,樣地,分布圖


煙臺(tái)大學(xué)碩士學(xué)位論文2 材料與方法2.1 取樣設(shè)計(jì)為完成此次研究?jī)?nèi)容,深入研究中國(guó)沿海紅條毛膚石鱉系統(tǒng)地理學(xué),共選取了16 個(gè)地理種群,,采集了 199 個(gè)樣本,涵蓋了中國(guó)的三個(gè)海區(qū):渤海海域(萊州 LZ、大連 DL、秦皇島 QHD、葫蘆島 HLD、營(yíng)口 YK);黃海海域(連云港 LYG、青島 QD、威海 WH、煙臺(tái) YT);東海海域(廈門(mén) XM、臺(tái)州 TZ、舟山 ZS、汕頭 ST)(圖 2-1)。另外,蓬萊(PL)、砣磯(TJ)、長(zhǎng)島(CD)位于黃海海域和渤海海域交界處。統(tǒng)計(jì)了所有采樣地(除砣磯)近 30 年的環(huán)境因子。將采集的紅條毛膚石鱉樣本保存在無(wú)水乙醇中。

紅條毛膚石鱉,種群,方差分量,固定系數(shù)


圖 3-2 紅條毛膚石鱉地理種群間的遺傳模式分析Fig. 3-2 Correlation between genetic distance and geographic distance (km, log-transformed) in A.rubrolineatus表 3-14 16 個(gè)紅條毛膚石鱉地理種群的 AMOVA 分析結(jié)果Table 3-14AMOVAanalysis results of 16 A. rubrolineatus populations變異來(lái)源Source of variation自由度d.f.平方和Sum ofsquares方差分量Variancecomponents變異百分比Percentageof variation固定系數(shù)PFixationIndicesCOI種群間Among groups1 1441.595 22.768 85.89 Fct=0.8589 <0.001組內(nèi)種群間Among populationwithin group14 206.779 0.974 3.67 Fsc=0.2604 <0.001種群內(nèi)Within populations184 506.117 2.766 10.34 Fst=0.8957 <0.001Total 199 2154.854 26.508種群間Among groups1 294.226 4.835 78.77 Fct=0.7877 <0.001
【學(xué)位授予單位】:煙臺(tái)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類(lèi)號(hào)】:Q958.8

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本文編號(hào):2627660

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