本研究以采集自內(nèi)蒙古錫林郭勒盟的12份酸馬奶和蒙古國巴彥洪格爾省的16份傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品（包括4份酸馬奶、3份酸牛奶和9份奶酪樣品）樣品為研究對象,采用純培養(yǎng)方法法結(jié)合16S rRNA基因測序技術(shù)分離鑒定其中的乳酸菌;同時,采用PacBio單分子實(shí)時測序技術(shù)（PacBio SMRT）分析傳統(tǒng)發(fā)酵乳中的細(xì)菌多樣性,并對比分析內(nèi)蒙古和蒙古國不同地區(qū)酸馬奶樣品中的細(xì)菌菌群結(jié)構(gòu)。具體結(jié)果如下:1.傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品中共分離得到105株乳酸菌,鑒定為2個屬,8個種,優(yōu)勢菌種為 Lactobacillus helveticus 和 Lactobacillus kefiranofaciens,占分離菌株的79.05%,結(jié)果表明不同類型的乳制品中乳酸菌種類不同。2.基于PacBio SMRT測序技術(shù)檢測發(fā)現(xiàn),內(nèi)蒙古錫林郭勒地區(qū)12份酸馬奶樣品中的細(xì)菌歸為5個門、34個屬和60菌種,其中優(yōu)勢菌種為Streptococcus parauberis（62.82%）和Lactobacillus helveticu和（27.12%）,結(jié)果表明酸馬奶樣品之間的細(xì)菌多樣性和相對豐度存在差異。3.基于PacBio SMRT... 

【文章來源】：內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)

【文章頁數(shù)】：81 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖３酸馬奶樣品的稀疏曲線（Ａ）和香農(nóng)多樣性曲線（Ｂ）??Ｆｉｇ．３?Ｔｈｅ?Ｒａｒｅｆａｃｔｉｏｎ?ｃｕｒｖｅ?（Ａ）?ａｎｄ?Ｓｈａｎｎｏｎ?ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ?ｃｕｒｖｅ?（Ｂ）?ｏｆ?ｋｏｕｍｉｓｓ?ｓａｍｐｌｅｓ??

現(xiàn)物種數(shù)、香農(nóng)指數(shù)和辛普森指數(shù)（表６）。??依據(jù)發(fā)現(xiàn)物種數(shù)和香農(nóng)指數(shù)繪制稀疏曲線（Ｒａｒｅｆａｃｔｉｏｎ?ｃｕｒｖｅ?）和香農(nóng)曲線??（Ｓｈａｎｎｏｎ?ｃｕｒｖｅ）分析和評價測序質(zhì)ｉｌ和深度。如圖６屮稀疏曲線所示，測定樣品??屮的測得ＯＴＵｓ數(shù)ｉｔ會隨著測序深度的增加而增加，２丨測序量達(dá)到１００００時，個別??樣品中依然有物種可以測到。侃香農(nóng)曲線在測序位為４０００時就進(jìn)入平臺期，說明在??該測序深度下，樣品中的細(xì)菌的多樣性可以被允分展示。因此，本試驗(yàn)細(xì)菌測序量??可以滿足后續(xù)生物信息學(xué)分析的要求。??３．?３．?２蒙古國巴彥洪格爾省傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品中的細(xì)菌構(gòu)成??通過將ＯＴＵｓ序列與數(shù)據(jù)庫ＲＤＰ、Ｇｒｅｅｎｇｅｎｅｓ和Ｓｉｌｖａ進(jìn)行比對，鑒定得到隸??

ｆｒｏｍ?Ｂａｙａｎｋｈｏｎｇｏｒ?ｏｆ?Ｍｏｎｇｏｌｉａ??３．?３．?３蒙古國巴彥洪格爾省傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品中的ｐ多樣性??基于Ｕｎｉｆｒａｃ距離的ＰＣｏＡ對三類樣品進(jìn)行了分析，如圖８所示，第一、二主坐??標(biāo)的貢獻(xiàn)率分別為８８．８７％和５．４７％；基于１）１１＼￥＃矗保蓿ǎ保保蓿叮薜模浚ǎ蕞柊耍?諞�、�?鰨崳?坐標(biāo)的貢獻(xiàn)率分別為１９．７２％和１５．２９％。由圖８可見，同一類型的傳統(tǒng)發(fā)酵乳樣品??

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號：3534951