生姜中辛辣化合物激活TRPV1的結(jié)構(gòu)機(jī)制研究
【學(xué)位單位】:青島大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類(lèi)】:TS201.2
【部分圖文】:
圖 1.辣椒素和生姜辛辣化合物的結(jié)構(gòu)比較A. 辣椒素結(jié)合口袋的放大視圖,顯示辣椒素-TRPV1 相互作用的結(jié)構(gòu)模型。辣椒素分子用粉紅色來(lái)表示,頸部和頭部形成氫鍵的基團(tuán)分別以紅色和橙色顯示。TRPV1 以米色顯示,辣椒素與兩個(gè)殘基,T551 和 E571 形成氫鍵,分別以紅色和橙色突出顯示。 B. 辣椒素、6-姜烯醇、6 姜酚和姜酮的化學(xué)結(jié)構(gòu)。所有四種化合物都具有香草基部分并且在結(jié)構(gòu)上相似,不同之處在于頸部和尾部側(cè)鏈。
圖 1.辣椒素和生姜辛辣化合物的結(jié)構(gòu)比較辣椒素結(jié)合口袋的放大視圖,顯示辣椒素-TRPV1 相互作用的結(jié)構(gòu)模型。辣椒素分子色來(lái)表示,頸部和頭部形成氫鍵的基團(tuán)分別以紅色和橙色顯示。TRPV1 以米色顯示,與兩個(gè)殘基,T551 和 E571 形成氫鍵,分別以紅色和橙色突出顯示。 B. 辣椒素、6-6 姜酚和姜酮的化學(xué)結(jié)構(gòu)。所有四種化合物都具有香草基部分并且在結(jié)構(gòu)上相似,在于頸部和尾部側(cè)鏈。
. 生姜化合物與辣椒素結(jié)合口袋結(jié)合為了研究生姜化合物激活 mTRPV1 的結(jié)構(gòu)機(jī)制,我們首先測(cè)試了生否與辣椒素一樣競(jìng)爭(zhēng)相同的配體結(jié)合口袋,辣椒素的的位置已在低溫電子密度圖中被清楚地識(shí)別出[8,9]。以此為目的,我們測(cè)試了生姜化TRPV1 是否可以被辣椒平競(jìng)爭(zhēng)性拮抗,辣椒平是一種已知的 TRPV其可與辣椒素競(jìng)爭(zhēng)相同的配體結(jié)合位點(diǎn),這一點(diǎn)在低溫冷凍電鏡中已使用活細(xì)胞鈣成像,我們證實(shí)了三種生姜化合物對(duì) mTRPV1 通道的以被辣椒平有效拮抗(圖 3)。前期研究表明,辣椒平的結(jié)合部分是由551 殘基的氫鍵介導(dǎo)的[37]。類(lèi)似的相互作用也有助于辣椒素與頸部區(qū)結(jié)合[11,12],其在生姜化合物中是保守的。我們接下來(lái)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)551 和另一種形成氫鍵的殘基 E571 對(duì)于生姜化合物激活 TRPV1 是至基于生姜化合物和辣椒素之間的結(jié)構(gòu)相似性,我們進(jìn)行了一系列功能特異性配體-宿主相互作用。
【相似文獻(xiàn)】
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