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豆醬自然發(fā)酵過(guò)程中菌群結(jié)構(gòu)及其代謝功能的宏轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2020-05-04 23:10
【摘要】:豆醬是以大豆為主要原料,經(jīng)微生物自然發(fā)酵而成的一種風(fēng)味獨(dú)特的傳統(tǒng)發(fā)酵制品,其菌群結(jié)構(gòu)直接影響豆醬的品質(zhì)。而目前關(guān)于豆醬發(fā)酵過(guò)程中菌群結(jié)構(gòu)及功能的研究還大多集中在DNA層面,其結(jié)果并不能反映豆醬體系中菌群的真實(shí)情況,對(duì)于發(fā)酵過(guò)程中實(shí)際發(fā)生的代謝反應(yīng)也只能是推測(cè)。因此,為反映自然發(fā)酵豆醬菌落的真實(shí)情況,避免傳統(tǒng)分子生物學(xué)手段所帶來(lái)的死亡菌群干擾,故嘗試使用宏轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)來(lái)對(duì)豆醬發(fā)酵體系中的真正發(fā)揮作用的活菌群落進(jìn)行分析,深入解析不同發(fā)酵階段微生物的功能基因表達(dá)變化以及微生物對(duì)環(huán)境的適應(yīng)性反應(yīng),從功能豐度譜和物種組成譜兩個(gè)層面,分別比較了不同發(fā)酵時(shí)期的差異表達(dá)量大小,并將重要的理化指標(biāo)與宏轉(zhuǎn)錄的研究結(jié)果進(jìn)行整合分析,同時(shí)采用頂空固相微萃取和氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用方法,對(duì)傳統(tǒng)豆醬的揮發(fā)性風(fēng)味成分進(jìn)行分析,與宏轉(zhuǎn)錄組共同揭示發(fā)酵過(guò)程中真正發(fā)揮重要作用的菌種及其相關(guān)功能類群。主要研究結(jié)果如下:1.首先對(duì)豆醬總RNA提取的前處理方法進(jìn)行對(duì)比研究,發(fā)現(xiàn)對(duì)豆醬樣品進(jìn)行離心處理可以很好地解決復(fù)雜發(fā)酵體系對(duì)RNA提取的影響,這種樣品前處理方式對(duì)發(fā)酵初期豆醬總RNA提取的幫助尤為明顯。2.宏轉(zhuǎn)錄組功能研究結(jié)果顯示,各個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)雖各有側(cè)重,但都大量注釋到代謝活動(dòng),說(shuō)明自然發(fā)酵豆醬中的微生物活動(dòng)大多與氨基酸,碳水化合物及能量代謝有關(guān)。宏轉(zhuǎn)錄組物種注釋結(jié)果表明,液態(tài)醬發(fā)酵階段,細(xì)菌真正起主導(dǎo)作用。主要菌屬為四聯(lián)球菌屬、乳桿菌屬、葡萄球菌屬、太平洋海洋桿菌屬及腸球菌屬,真菌僅在發(fā)酵初期有一定豐度。絕大部分物種呈正相關(guān)關(guān)系,但乳桿菌屬與芽胞八疊球菌屬、曲霉菌屬及太平洋海洋桿菌中的菌種呈負(fù)相關(guān)關(guān)系。各發(fā)酵階段樣品功能和物種層面一致性較高。3.冗余分析(redundancy analysis,RDA)結(jié)果表明,絕大部分菌屬呈正相關(guān)關(guān)系,乳桿菌屬與太平洋海洋桿菌屬呈強(qiáng)負(fù)相關(guān)關(guān)系。此外,葡萄球菌屬、腸球菌屬、芽胞桿菌屬、枝芽孢桿菌屬、曲霉屬及根霉菌屬與pH值及水分呈正相關(guān)關(guān)系,四聯(lián)球菌屬、太平洋海洋桿菌屬、庫(kù)特氏菌屬與pH值呈負(fù)相關(guān)關(guān)系。乳桿菌屬及四聯(lián)球菌屬與色度呈正相關(guān)關(guān)系,說(shuō)明其可能對(duì)豆醬色澤變化有一定影響。僅乳桿菌屬與鹽濃度呈正相關(guān)關(guān)系。4.共檢出27種揮發(fā)性成分,最主要的揮發(fā)性成分是酯類物質(zhì)。相關(guān)性分析結(jié)果表明,腸球菌屬、四聯(lián)球菌屬、乳桿菌屬可能為脂質(zhì)代謝主要功能菌。嗜鹽四聯(lián)球菌、蛋白原酶乳桿菌、酸魚(yú)乳桿菌、植物乳桿菌、糞腸球菌、枯草芽孢桿菌與風(fēng)味物質(zhì)成顯著正相關(guān)關(guān)系,其可能為對(duì)揮發(fā)性風(fēng)味物質(zhì)合成有重要影響且真正發(fā)揮作用的核心發(fā)酵微生物種。
【圖文】:

電泳圖,豆醬,不同前處理,電泳圖


檢測(cè)結(jié)果如圖 1 所示,不同前處理方式所獲得的 RNA發(fā)酵時(shí)期的總 RNA 提取效果也存在一定差異。,,經(jīng)過(guò)離心處理后的樣品能得到 23S、16S 條帶,條帶 的亮度高于 16S 條帶,說(shuō)明經(jīng)離心處理后提取的總 R于后續(xù)試驗(yàn);而未經(jīng)離心處理的樣品 RNA 條帶相對(duì)較嚴(yán)重,完整性較差,無(wú)法滿足宏轉(zhuǎn)錄組建庫(kù)要求。同時(shí)泳條帶亮度明顯弱于發(fā)酵第 56 天,說(shuō)明發(fā)酵初期豆醬末期。

統(tǒng)計(jì)圖,統(tǒng)計(jì)圖,功能體,大類


圖 2 KEGG 注釋結(jié)果統(tǒng)計(jì)圖Fig.2 KEGG comment results statisticsOG 注釋ggNOG 分類,可以統(tǒng)計(jì)注釋到的 24 個(gè)功能大類的 EggNOG 功能體的注釋結(jié)果如圖 3 所示。
【學(xué)位授予單位】:沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:TS264.24

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本文編號(hào):2649132

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