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DNA聚合酶反應(yīng)繞過(guò)D-/L-異核苷-胸苷產(chǎn)生的潛在致突變性研究

發(fā)布時(shí)間:2021-02-11 14:44
  以修飾的非天然核苷作為主體結(jié)構(gòu)所衍生出來(lái)的核苷類(lèi)藥物已經(jīng)在抗病毒、抗腫瘤治療中發(fā)揮著積極的作用。但是,由于正常生命體需要的天然核苷與非天然核苷結(jié)構(gòu)相似,從而導(dǎo)致DNA聚合酶的選擇性松懈可能會(huì)將修飾核苷引入到正常DNA鏈中,進(jìn)而造成體內(nèi)正常DNA的化學(xué)損傷。非天然核苷酸及其衍生物的摻入可能會(huì)引起的基因變異,甚至?xí)绊懟蛲耆璧K正常核酸的生物功能,引起生物體系統(tǒng)紊亂的毒副作用。本論文旨在從核苷的化學(xué)和立體修飾角度,深入研究一種核苷藥物分子(異核苷)摻入DNA鏈之后,異核苷在體內(nèi)的代謝及毒副作用。本論文還研究了生物體內(nèi)各種聚合酶對(duì)藥理活性明確或具有潛在活性的異核苷的識(shí)別能力;在此基礎(chǔ)上,本論文進(jìn)一步深入研究了異核苷損傷的核酸在這些酶的作用下是如何進(jìn)行復(fù)制的。特別地,研究了異核苷類(lèi)藥物分子置于核酸鏈中后,其在正常細(xì)胞的復(fù)制過(guò)程中的跨損傷修復(fù)或變異。目前B家族DNA聚合酶可以識(shí)別D-異核苷三磷酸結(jié)構(gòu),而L-核苷損傷的DNA在體外B家族DNA聚合酶的作用下,具有很強(qiáng)的自我修復(fù)能力。為了研究在不同家族DNA聚合酶的指導(dǎo)下,異核苷損傷的核酸的復(fù)制和跨損傷修復(fù)能力。本論文通過(guò)酶聚合反應(yīng)動(dòng)力學(xué)分析和保真度... 

【文章來(lái)源】:北京交通大學(xué)北京市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:70 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

DNA聚合酶反應(yīng)繞過(guò)D-/L-異核苷-胸苷產(chǎn)生的潛在致突變性研究


圖1.1三種L-核苷類(lèi)抗病毒藥物??Figure?1.1?Three?L-nucleoside?antiviral?drugs??

異核苷,種類(lèi),核苷


?替比夫定?克立夫定??圖1.1三種L-核苷類(lèi)抗病毒藥物??Figure?1.1?Three?L-nucleoside?antiviral?drugs??1.1.2異核苷??異核苷(圖1.2)?(Isonucleic?acid,?iso)是一類(lèi)堿基由糖基的1’位移至其它位??置的核苷。由于堿基位置的位移,原來(lái)的半縮醛式糖苷鍵缺失,使得異核苷比正??常核苷或者脫氧核苷都要穩(wěn)定。與天然核苷相似,由于糖基鏈接結(jié)構(gòu)及對(duì)映體的??不同,異核苷又可分為D-/L-異核苷兩種對(duì)映體構(gòu)型。其中D-異核苷構(gòu)型與天然??D-核苷類(lèi)型相同,L-異核苷構(gòu)型則與L-核苷構(gòu)型類(lèi)似。??2??

堿基,位點(diǎn),堿基對(duì)


根據(jù)堿基配對(duì)原理,堿基之間的配對(duì)識(shí)別是根據(jù)堿基上的-OH2和-NH2之間??的氫鍵的相互作用來(lái)實(shí)現(xiàn)的。據(jù)此可對(duì)堿基進(jìn)行位點(diǎn)修飾,如5-位修飾的2’脫氧??尿苷等。通過(guò)堿基位點(diǎn)的修飾(圖1.3),可以增加寡核苷酸鏈的解鏈溫度,從??而提高寡核苷酸的穩(wěn)定性,進(jìn)而提高對(duì)非互補(bǔ)核酸鏈的識(shí)別能力。??nh2?X?T2??ho.?N?N?nh2?h?1?n?nh2?h??\y?\°y??OH?OH?〇H??2-龍苷?6-位獅嘌呤猶?5-位娜的苷??圖1.3堿基位點(diǎn)修飾??Figure?1.3?base?site?modifications??研宄人員一直在努力開(kāi)發(fā)新的人工堿基對(duì)(非天然堿基對(duì))用于完善堿基數(shù)??據(jù)庫(kù)。2000年,HiraoPl結(jié)合了非標(biāo)準(zhǔn)氫鍵模式和形狀-互補(bǔ)性?xún)蓚(gè)概念,在2-氨??基-6-二甲基氨基嘌呤和吡啶-2-酮之間,開(kāi)發(fā)了屬于他們的第一個(gè)非天然堿基對(duì)。??經(jīng)過(guò)不斷地改進(jìn),最終得到具有優(yōu)異摻入效率的疏水Ds-Px堿基對(duì)。疏水性Ds-??Px堿基對(duì)通過(guò)連續(xù)改進(jìn)過(guò)程從兩個(gè)初始?jí)A基對(duì):氫鍵x-y和疏水Q-?Pa對(duì)產(chǎn)生??(圖1.4a)。在沒(méi)有任何改性三磷酸的情況下,Ds-Px堿基對(duì)在PCR中表現(xiàn)出高??效率的識(shí)別能力和保真度。最近,Him〇t25H正實(shí)了?Ds-Px堿基對(duì)可以在100個(gè)PCR??循環(huán)中存活,并且在100個(gè)循環(huán)PCR后,超過(guò)97%的DNA中Ds-Px堿基對(duì)保??留在1028倍擴(kuò)增產(chǎn)物中。??1999年


本文編號(hào):3029269

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