發(fā)布時(shí)間：2025-04-23 02:47

　　火龍果(Hylocereus spp.)是仙人掌科(Cactaceae)量天尺屬(Hylocereus)或蛇鞭柱屬(Seleniereus)植物,是近年來被廣泛關(guān)注的一種新興熱帶、亞熱帶水果。本研究通過對火龍果轉(zhuǎn)錄組測序獲得的數(shù)據(jù)進(jìn)行系統(tǒng)分析,建立火龍果SSR-PCR技術(shù)體系;以形態(tài)學(xué)差異顯著的38份火龍果種質(zhì)為材料進(jìn)行引物驗(yàn)證篩選,旨在為火龍果種質(zhì)鑒定、親緣關(guān)系分析及遺傳圖譜構(gòu)建和分子標(biāo)記輔助育種等提供更豐富的標(biāo)記來源。具體研究結(jié)果如下:1)本文利用MISA軟件篩選本實(shí)驗(yàn)室前期工作中對火龍果轉(zhuǎn)錄組測序獲得的108,127條Unigenes,共檢測出7,622個(gè)EST-SSR位點(diǎn),其發(fā)生頻率為6.02%,平均每9.00kb出現(xiàn)一個(gè)位點(diǎn)。單核苷酸重復(fù)類型占優(yōu)勢,占總EST-SSR位點(diǎn)的56.59%,其次是二核苷酸和三核苷酸,分別占28.4%和14.04%;其它特性重復(fù)類型數(shù)量較少,所占比例均不足1%。二核苷酸重復(fù)基元類型中以AG/CT、AC/GT為優(yōu)勢重復(fù)基元,分別占總SSR位點(diǎn)數(shù)目的25.37%和2.02%;三核苷酸重復(fù)基元類型以AAG/CCT為主,占總SSR位點(diǎn)數(shù)目的3.13%。2)基...

【文章頁數(shù)】：67 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖2-1火龍果基因組DNA瓊脂糖凝膠電泳檢測結(jié)果

圖2-1火龍果基因組DNA瓊脂糖凝膠電泳檢測結(jié)果Fig.2-1GelelectrophoresisofgenomicDNAofpitayagermplasms體系的優(yōu)化(43)正交試驗(yàn)設(shè)計(jì)，利用引物C13748對火龍果種質(zhì)R1的DNA進(jìn)擴(kuò)增產(chǎn)物....

圖2-2火龍果種質(zhì)R1的EST-SSR-PCR正交試驗(yàn)擴(kuò)增產(chǎn)物電泳結(jié)果

圖2-1火龍果基因組DNA瓊脂糖凝膠電泳檢測結(jié)果Fig.2-1GelelectrophoresisofgenomicDNAofpitayagermplasmsCR體系的優(yōu)化L16(43)正交試驗(yàn)設(shè)計(jì)，利用引物C13748對火龍果種質(zhì)R1的DNA....

圖2-3引物退火溫度對EST-SSR-PCR的影響

2018屆碩士畢業(yè)論文度為58℃時(shí)，所得擴(kuò)增條帶最為清晰明亮，背景最淺，由此確定的最佳退火溫度為58℃。引物C13748的擴(kuò)增中，當(dāng)退火溫度為58℃增條帶最為清晰明亮，當(dāng)退火溫度為62℃時(shí)，出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增條亮度較弱。所以確定C13748的最佳退火溫度為58....

圖2-4不同質(zhì)量濃度的聚丙烯酰胺變性凝膠電泳EST-SSR電泳結(jié)果

2-4不同質(zhì)量濃度的聚丙烯酰胺變性凝膠電泳EST-SSR電泳結(jié)果分別代表凝膠質(zhì)量濃度為6%、8%和10%；所用引物均為C13748；泳道質(zhì)在不同質(zhì)量濃度的聚丙烯酰胺變性凝膠電泳EST-SSR電泳結(jié)果。ST-SSRelectrophoresisresultso....

本文編號：4041093