為明確大白菜TPS (BrTPS)家族成員信息及對高溫脅迫信號的響應(yīng),本研究利用生物信息學(xué)方法,在大白菜基因組數(shù)據(jù)庫中鑒定了BrTPS基因家族成員,并對其理化性質(zhì)、進(jìn)化特征、蛋白結(jié)構(gòu)及在高溫脅迫下的表達(dá)模式進(jìn)行分析。結(jié)果表明,大白菜全基因組含有15個(gè)TPS基因家族成員,分布于8條染色體上。除BrTPS14和BrTPS15外,其余成員各含有1個(gè)TPS和1個(gè)TPP結(jié)構(gòu)域,并且所含motif的排列順序也完全一致。理化性質(zhì)分析發(fā)現(xiàn),15個(gè)成員的氨基酸長度介于129～1 459 aa之間,分子量大小在14.73～165.83 kD之間,大部分BrTPS蛋白為酸性蛋白和親水蛋白,以無規(guī)則卷曲作為二級結(jié)構(gòu)主要構(gòu)成元件。進(jìn)化分析表明,大白菜TPS基因家族成員可分為2類,其中ClassⅠ包含5個(gè)成員,ClassⅡ包含10個(gè)成員。本研究對高溫脅迫前后不同組織和持續(xù)高溫脅迫下葉片中的表達(dá)分析,發(fā)現(xiàn)大部分的BrTPS基因可對高溫脅迫產(chǎn)生響應(yīng),但在表達(dá)規(guī)律上存在差異。這些研究結(jié)果為后續(xù)研究大白菜TPS基因提供一定參考。

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

為進(jìn)一步分析大白菜TPS基因家族蛋白序列的差異，通過對其motif進(jìn)行預(yù)測(圖2)，最終獲得10個(gè)motif。對發(fā)現(xiàn)的10個(gè)motif進(jìn)行Pfam和SM-ART注釋分析后，共有8個(gè)motif得到了命名，分別是motif1、motif2、motif3、motif5、motif7、m....

圖1大白菜TPS基因家族編碼蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化樹1.5高溫脅迫下大白菜TPS家族基因的表達(dá)特性

利用Q-PCR技術(shù)，分析了大白菜TPS家族基因在高溫(42℃)處理前后不同組織(根,莖,葉)中的表達(dá)情況。結(jié)果表明(圖3)，正常條件下，BrTPS1和BrTP-S3在根和葉中表達(dá)量較高，BrTPS2、BrTPS7、BrTPS8、BrTPS11和BrTPS13在葉中的表達(dá)量高于在根....

在高溫脅迫不同時(shí)間段下大白菜TPS基因在葉片中的表達(dá)情況(圖4)。在高溫脅迫過程中，絕大數(shù)BrTPS基因均對高溫脅迫產(chǎn)生響應(yīng)，且呈現(xiàn)出多種相對表達(dá)模式，僅BrTPS9和BrTPS14基因表達(dá)沒有顯著變化。隨脅迫時(shí)間延長，BrTPS1、BrTPS3、BrTPS4、BrTPS5、Br....

本文編號：4011764