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白菜裂葉基因BrcLL1的克隆與功能初步分析

發(fā)布時(shí)間:2024-03-22 02:24
  白菜(Brassica rapa ssp.chinensis)原產(chǎn)中國,是一種重要的葉菜類蔬菜。葉形多樣性在很大程度上是由葉緣形狀變化形成的,其中葉片裂刻性狀是一種很重要的經(jīng)濟(jì)或者標(biāo)記性狀,研究其基因調(diào)控機(jī)制對(duì)豐富葉形育種和改良商品性都具有一定的應(yīng)用及理論意義。在課題組前期研究基礎(chǔ)上,本實(shí)驗(yàn)對(duì)控制該性狀的基因進(jìn)行了精細(xì)的區(qū)間定位,篩選出控制裂葉的候選基因,命名為BrcLL1(B.rapa.ssp.chinensis lobed-leaf 1),對(duì)其進(jìn)行了克隆和時(shí)空表達(dá)分析,并通過轉(zhuǎn)基因?qū)ζ溥M(jìn)行了初步功能驗(yàn)證。主要獲得了以下研究結(jié)果:1.候選基因BrcLL1分析盡管前期研究將BrcLL1基因定位在Bra9511和Bra9512標(biāo)記之間,但在該區(qū)間內(nèi)沒有預(yù)測(cè)到編碼基因。本研究利用F2大群體中的隱形個(gè)體,對(duì)近鄰2個(gè)標(biāo)記3KBra9510和Bra9510-4H重新驗(yàn)證,結(jié)果發(fā)現(xiàn)候選基因與這2個(gè)標(biāo)記共分離,標(biāo)記3KBra9510和Bra9510-4H分別來源于其中一個(gè)編碼基因Bra009510的啟動(dòng)子和基因內(nèi)部,進(jìn)一步轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果表明,該基因在裂葉中的表達(dá)明顯下調(diào),因此Bra009510可能為...

【文章頁數(shù)】:50 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖2-1多態(tài)性標(biāo)記的群體分析

圖2-1多態(tài)性標(biāo)記的群體分析

p3.0軟件計(jì)算標(biāo)記和裂葉基因之間的遺傳距離并作圖。析子標(biāo)記的鑒定中,本實(shí)驗(yàn)室將候選基因定位于標(biāo)記Bra9511和Bra951測(cè)到編碼基因。在此基礎(chǔ)上,本研究擴(kuò)大分離群體中的個(gè)377株隱形個(gè)體,檢測(cè)已開發(fā)的分子標(biāo)記(3KBra9510和2-1),3KBra9510....


圖2-2分離群體中BrcLL1基因的遺傳圖譜和物理圖譜

圖2-2分離群體中BrcLL1基因的遺傳圖譜和物理圖譜

其縮小到標(biāo)記Bra009511和Bra009512之間,物理距離5.7kb,但是該區(qū)間并沒有注基因(富春元2014)。本研究通過重新定位,標(biāo)記3KBr9510和Bra9510-4H對(duì)群體的隱性純合單株基因型鑒定結(jié)果與表型結(jié)果完全吻合,說明已成功圖位克隆到候選....


圖3-1BrcLL1基因gDNA擴(kuò)增結(jié)果

圖3-1BrcLL1基因gDNA擴(kuò)增結(jié)果

組數(shù)據(jù)與大白菜基因組數(shù)據(jù)庫中同源基因Bra009510信息,葉和裂葉材料BrcLL1基因(圖3-1),結(jié)果顯示從3個(gè)裂葉1800bp和1600bp的擴(kuò)增條帶,3個(gè)圓葉材料僅能擴(kuò)增出的片段。該條帶回收后,與pGEM-TEasyVector載體連接....


圖-M:DNA5000markerladder;1-2、3-4、5-6、7-8、9-10、11-12分別為引物在14xs33H、14xs31H、1-20H、14xs39B、14xs32B、1-2B模板上BcLL1基因的gDNA擴(kuò)增結(jié)果

圖-M:DNA5000markerladder;1-2、3-4、5-6、7-8、9-10、11-12分別為引物在14xs33H、14xs31H、1-20H、14xs39B、14xs32B、1-2B模板上BcLL1基因的gDNA擴(kuò)增結(jié)果

組數(shù)據(jù)與大白菜基因組數(shù)據(jù)庫中同源基因Bra009510信息,葉和裂葉材料BrcLL1基因(圖3-1),結(jié)果顯示從3個(gè)裂葉1800bp和1600bp的擴(kuò)增條帶,3個(gè)圓葉材料僅能擴(kuò)增出的片段。該條帶回收后,與pGEM-TEasyVector載體連接....



本文編號(hào):3934490

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