黃瓜CsMYB108基因的克隆與序列分析
發(fā)布時間:2024-03-22 00:59
中國黃瓜品種繁多,目前黃瓜雜種優(yōu)勢是選育新品種的關(guān)鍵,雜種優(yōu)勢是一種植物共有的獨特生物現(xiàn)象,然而黃瓜雜種優(yōu)勢的分子機理研究還尚未深入。為探究黃瓜雜種優(yōu)勢形成的機理,本研究中父本D0708-2田間表現(xiàn)為雌雄同株,早熟性佳,但是抗病抗逆性差,母本D1104-2-4田間表現(xiàn)為強雌性系,抗病抗逆性佳。以超親優(yōu)勢的雜交種C15-114為試驗材料,篩選出一個與父母本的差異基因Cs MYB108,并運用基因克隆技術(shù)克隆了該基因并對該蛋白進行生物信息學分析,挖掘該基因在黃瓜遭遇逆境脅迫過程中所參與的作用機制。結(jié)果表明:CsMYB108轉(zhuǎn)錄因子全長675 bp,編碼225個氨基酸,該轉(zhuǎn)錄因子編碼的蛋白質(zhì)屬于細胞核中的疏水性蛋白質(zhì),并無明顯信號肽和無跨膜結(jié)構(gòu)。與甜瓜構(gòu)成同一進化分支,同源性較高。本研究結(jié)果為黃瓜的雜種優(yōu)勢提供理論依據(jù),也為進一步試驗研究提供基因材料。
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
本文編號:3934394
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圖2CsMYB108在不同黃瓜品系中表達
圖1總RNA電泳檢測1.3CsMYB108的基因克隆與酶切驗證
圖3CsMYB108PCR擴增產(chǎn)物(A)與酶切驗證(B)
通過PCR技術(shù),以黃瓜D0708-2、D1104-2-4和C15-114黃瓜品系莖尖cDNA為模板,CsMYB108上游和下游引物擴增序列全長,1%瓊脂糖凝膠電泳擴增出1條長度超過600bp的目的片段(圖3A),將該片段切下回收后,將其連接到pSXCN-1250載體上,利用質(zhì)粒....
圖4CsMYB108的保守結(jié)構(gòu)域
通過SOPMA軟件分析CsMYB108蛋白的二級結(jié)構(gòu),結(jié)果發(fā)現(xiàn)在整個多肽鏈中,占比最多的是α螺旋,有110個,占比為49.11%;其次是無規(guī)則卷曲,有97個,占比為43.40%;然后是β折疊,有11個,占比是4.91%;最后是延伸主鏈,有6條,占比是2.68%(圖7)。另外,把C....
圖1總RNA電泳檢測
基于本實驗室前期的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中,MYB家族中的CsMYB108在雜交組合中的DEGs數(shù)值顯著大于父本,與母本接近。因此,本研究中通過qRT-PCR技術(shù)的驗證測序結(jié)果。qRT-PCR結(jié)果表明,CsMYB-108在D1104-2-4中表達量為D0708-2的6.86倍,C15-114....
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