安康市花魔芋matK基因的克隆及分析
發(fā)布時間:2024-03-05 02:20
以安康市花魔芋(Amorphophallus konjac)為材料提取基因組,對matK基因序列進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)凝膠電泳分析后送生物技術(shù)公司測序,并對測序結(jié)果進(jìn)行分析。結(jié)果表明,安康市花魔芋matK基因全長1 551 bp,預(yù)測編碼516個氨基酸;系統(tǒng)進(jìn)化樹結(jié)果顯示,花魔芋與Amorphophallus maxwellii、田陽魔芋(Amorphophallus corrugatus)和西盟魔芋(Amorphophallus krausei)的親緣關(guān)系最近。
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本文編號:3919521
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圖1花魔芋matK基因擴(kuò)增產(chǎn)物凝膠檢測結(jié)果
對PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行凝膠分析顯示,擴(kuò)增片段長度約1800bp(圖1),與預(yù)期相符。對測序結(jié)果分析得知該基因全長1551bp,預(yù)測編碼516個氨基酸(圖2)。將該核苷酸序列在NCBI進(jìn)行Blastn,發(fā)現(xiàn)該序列與花魔芋matK基因序列(AF387398.1)有2個堿基的差異....
圖2花魔芋matK基因及編碼氨基酸序列
以桑樹(Morusalba)為外類群,用Neighbor-joining法構(gòu)建魔芋屬matK基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹。結(jié)果(圖3)顯示,安康市花魔芋與Amorphophallusmaxwellii、田陽魔芋(Amorphophalluscorrugatus)和西盟魔芋(Amorph....
圖3魔芋屬matK序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹
圖2花魔芋matK基因及編碼氨基酸序列3討論
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