核桃譜系地理學和轉錄組學遺傳標記開發(fā)研究
發(fā)布時間:2024-01-27 14:08
核桃Uuglans regia)為胡桃屬植物中的模式種,分布范圍廣泛,栽培歷史悠久且具有很高的食用和藥用價值。長期以來核桃復雜的遺傳背景與重要的價值是學者關注的焦點。目前,對核桃植物進行研究的報道主要集中在形態(tài)學、解剖學、胚胎學、細胞學和孢粉學等方面。應用分子標記技術對胡桃屬植物進行研究的報道也僅限于個別種的少數(shù)群體或個體,采用的分子遺傳標記也大多是通用引物,其多態(tài)性及所含的遺傳信息都比較有限。因而通過分子標記手段對核桃全國不同地理群體的遺傳多樣性進行研究以及開發(fā)出更多遺傳信息豐富的標記的研究是有必要的。本研究一方面通過DNA測序技術,利用單親遺傳細胞質分子標記及雙親遺傳的核DNA片段進行核桃譜系地理學探討;另一方面基于Illumina HiSeqTM高通量測序平臺,對核桃的葉片、花芽、雌花及雄花四種器官進行轉錄組測序,獲得4.98 G數(shù)據(jù),隨后利用生物信息學方法對數(shù)據(jù)進行了重頭組裝、拼接、注釋及相關生物信息學分析,并利用核桃不同Unigene中微衛(wèi)星序列開發(fā)易擴增、多態(tài)性好的EST-SSR引物。通過上述兩方面的研究分析,為核桃群體進化歷史、遺傳標記及其種質資源的開發(fā)利用和保護提供理論...
【文章頁數(shù)】:121 頁
【學位級別】:碩士
本文編號:3887109
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圖2-10基于ITS的MP輯與單倍型網(wǎng)絡分布困??FitlO?Results?of?MP?treeAand?NetworkB)?based?on?ITS?dataset??
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