葡萄無核性狀SSR標(biāo)記的驗證及葡萄乙烯釋放量全基因組關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時間:2023-04-10 23:00
無核葡萄因其食用方便,深受消費者的青睞。人們對無核葡萄形成的原因做了大量的研究,但是葡萄無核的遺傳機(jī)理還不清楚。本文通過利用已經(jīng)開發(fā)的無核相關(guān)的4個SSR分子標(biāo)記P1VvAGLL11、P2VvAGLL11、P3VvAGLL11和VMC7F2在90份鮮食葡萄品種中進(jìn)行驗證,旨在找到葡萄無核性狀檢驗通用率高的分子標(biāo)記,來輔助無核品種的選育,提高育種效率。乙烯在葡萄果實成熟中起著重要的作用,對葡萄貯藏中果粒的脫落和穗軸的褐化也起著一定的調(diào)控作用。為了解葡萄的果粒和穗軸的乙烯釋放規(guī)律,發(fā)掘與葡萄果粒和穗軸乙烯釋放量性狀相關(guān)的優(yōu)異等位變異。本研究以62個自然群體葡萄品種為材料,利用全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)的方法以79對SSR引物對該自然群體的進(jìn)行分析,尋找與葡萄乙烯釋放相關(guān)的分子標(biāo)記。本研究的主要結(jié)果如下:1.在用四個無核SSR分子標(biāo)記進(jìn)行驗證發(fā)現(xiàn),VMC7F2在驗證群體中并沒有差異。而P1VvAGLL11、P2VvAGLL11、P3VvAGLL11三個標(biāo)記經(jīng)過...
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
致謝
縮略詞 Abbreviation
摘要
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 葡萄的起源與發(fā)展
2 無核葡萄研究
2.1 無核葡萄概況
2.2 無核葡萄形成機(jī)理與遺傳機(jī)制
3 乙烯的研究進(jìn)展
3.1 乙烯對植物的作用和影響
3.2 乙烯的生物合成過程
3.3 葡萄中乙烯的研究進(jìn)展
4 關(guān)聯(lián)分析
4.1 關(guān)聯(lián)分析的原理和方法
4.2 關(guān)聯(lián)分析的研究策略與優(yōu)點
5 本研究的目的和技術(shù)路線
5.1 研究目的
5.2 技術(shù)路線
第二章 葡萄無核性狀的SSR標(biāo)記驗證
1 引言
2 材料與方法
2.1 試驗材料
2.2 試驗方法
2.2.1 植物組織DNA提取
2.2.2 PCR反應(yīng)體系的建立
2.2.3 PCR反應(yīng)條件
2.2.4 聚丙烯凝膠的制備與電泳
2.2.5 SSR分子數(shù)據(jù)統(tǒng)計
2.2.6 SSR分子標(biāo)記數(shù)據(jù)分析
3 驗證結(jié)果與分析
3.1 SSR標(biāo)記P1VvAGLL11擴(kuò)增結(jié)果的統(tǒng)計分析
3.2 SSR標(biāo)記P2VvAGLL11擴(kuò)增結(jié)果的統(tǒng)計分析
3.3 SSR標(biāo)記P3VvAGLL11擴(kuò)增結(jié)果的統(tǒng)計分析
3.4 SSR標(biāo)記VMC7F2擴(kuò)增結(jié)果的統(tǒng)計分析
3.5 群體遺傳多樣性分析
4 討論與結(jié)論
4.1 討論
4.2 結(jié)論
第三章 葡萄乙烯釋放量全基因組關(guān)聯(lián)分析
1 引言
2 材料與方法
2.1 試驗材料
2.2 試驗方法
2.2.1 乙烯釋放速率的測定分析(GC法)
2.2.2 葉片組織基因組DNA提取與檢測
2.2.3 PCR反應(yīng)體系建立
2.2.4 聚丙烯酰胺凝膠的制備與電泳
2.2.5 分子標(biāo)記數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析
2.2.6 群體結(jié)構(gòu)分析
2.2.7 連鎖不平衡(LD)分析
2.2.8 利用GLM進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析
2.2.9 利用MLM進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 果粒乙烯釋放速率測定結(jié)果分析
3.2 穗梗乙烯釋放速率測定結(jié)果分析
3.3 SSR引物的多態(tài)性篩選
3.4 SSR引物的遺傳多樣性及群體分析
3.4.1 分子數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析
3.4.2 群體結(jié)構(gòu)分析
3.5 關(guān)聯(lián)分析
3.5.1 連鎖不平衡分析
3.5.2 不同模型的比較
3.6 關(guān)聯(lián)分析結(jié)果分析
3.7 VVIN70擴(kuò)增序列驗證
4 討論與結(jié)論
4.1 討論
4.2 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附表1 引物信息
英文摘要
本文編號:3788886
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
致謝
縮略詞 Abbreviation
摘要
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 葡萄的起源與發(fā)展
2 無核葡萄研究
2.1 無核葡萄概況
2.2 無核葡萄形成機(jī)理與遺傳機(jī)制
3 乙烯的研究進(jìn)展
3.1 乙烯對植物的作用和影響
3.2 乙烯的生物合成過程
3.3 葡萄中乙烯的研究進(jìn)展
4 關(guān)聯(lián)分析
4.1 關(guān)聯(lián)分析的原理和方法
4.2 關(guān)聯(lián)分析的研究策略與優(yōu)點
5 本研究的目的和技術(shù)路線
5.1 研究目的
5.2 技術(shù)路線
第二章 葡萄無核性狀的SSR標(biāo)記驗證
1 引言
2 材料與方法
2.1 試驗材料
2.2 試驗方法
2.2.1 植物組織DNA提取
2.2.2 PCR反應(yīng)體系的建立
2.2.3 PCR反應(yīng)條件
2.2.4 聚丙烯凝膠的制備與電泳
2.2.5 SSR分子數(shù)據(jù)統(tǒng)計
2.2.6 SSR分子標(biāo)記數(shù)據(jù)分析
3 驗證結(jié)果與分析
3.1 SSR標(biāo)記P1VvAGLL11擴(kuò)增結(jié)果的統(tǒng)計分析
3.2 SSR標(biāo)記P2VvAGLL11擴(kuò)增結(jié)果的統(tǒng)計分析
3.3 SSR標(biāo)記P3VvAGLL11擴(kuò)增結(jié)果的統(tǒng)計分析
3.4 SSR標(biāo)記VMC7F2擴(kuò)增結(jié)果的統(tǒng)計分析
3.5 群體遺傳多樣性分析
4 討論與結(jié)論
4.1 討論
4.2 結(jié)論
第三章 葡萄乙烯釋放量全基因組關(guān)聯(lián)分析
1 引言
2 材料與方法
2.1 試驗材料
2.2 試驗方法
2.2.1 乙烯釋放速率的測定分析(GC法)
2.2.2 葉片組織基因組DNA提取與檢測
2.2.3 PCR反應(yīng)體系建立
2.2.4 聚丙烯酰胺凝膠的制備與電泳
2.2.5 分子標(biāo)記數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析
2.2.6 群體結(jié)構(gòu)分析
2.2.7 連鎖不平衡(LD)分析
2.2.8 利用GLM進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析
2.2.9 利用MLM進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 果粒乙烯釋放速率測定結(jié)果分析
3.2 穗梗乙烯釋放速率測定結(jié)果分析
3.3 SSR引物的多態(tài)性篩選
3.4 SSR引物的遺傳多樣性及群體分析
3.4.1 分子數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析
3.4.2 群體結(jié)構(gòu)分析
3.5 關(guān)聯(lián)分析
3.5.1 連鎖不平衡分析
3.5.2 不同模型的比較
3.6 關(guān)聯(lián)分析結(jié)果分析
3.7 VVIN70擴(kuò)增序列驗證
4 討論與結(jié)論
4.1 討論
4.2 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附表1 引物信息
英文摘要
本文編號:3788886
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