辣椒熱激蛋白HSP90家族基因鑒定及分析
發(fā)布時間:2023-04-05 00:11
借助生物信息學(xué)工具對辣椒熱激蛋白HSP90家族基因進行鑒定,并分析其理化性質(zhì)、結(jié)構(gòu)特征、系統(tǒng)進化關(guān)系以及在各組織器官和高溫脅迫下的表達(dá)模式。結(jié)果表明,辣椒基因組中含有7個HSP90家族基因,分布于5條染色體上,內(nèi)含子數(shù)2~19不等,含有5個保守基序;系統(tǒng)進化關(guān)系分析顯示辣椒7個HSP90家族基因分為3組;亞細(xì)胞定位結(jié)果顯示辣椒HSP90蛋白定位于細(xì)胞質(zhì)與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中;基于已發(fā)表的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進行組織表達(dá)分析,HSP90在不同組織中的表達(dá)模式不同;高溫處理可不同程度地激活HSP90的表達(dá)。
【文章頁數(shù)】:10 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 辣椒HSP90家族基因鑒定
1.2 辣椒HSP90家族基因特征分析
1.3 辣椒HSP90家族基因組織特異性表達(dá)分析
1.4 辣椒HSP90家族基因在高溫脅迫下的表達(dá)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 辣椒HSP90家族成員的基本信息
2.2 辣椒HSP90家族基因的結(jié)構(gòu)
2.3 辣椒HSP90家族蛋白保守基序的預(yù)測
2.4 辣椒HSP90家族基因的染色體定位
2.5 辣椒、番茄、水稻和擬南芥HSP90家族基因比較分析
2.6 辣椒HSP90蛋白的亞細(xì)胞定位
2.7 辣椒HSP90家族基因的組織表達(dá)
2.8 辣椒HSP90家族基因在高溫脅迫不同時間下葉片中的表達(dá)
3 討論
本文編號:3782329
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1 材料與方法
1.1 辣椒HSP90家族基因鑒定
1.2 辣椒HSP90家族基因特征分析
1.3 辣椒HSP90家族基因組織特異性表達(dá)分析
1.4 辣椒HSP90家族基因在高溫脅迫下的表達(dá)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 辣椒HSP90家族成員的基本信息
2.2 辣椒HSP90家族基因的結(jié)構(gòu)
2.3 辣椒HSP90家族蛋白保守基序的預(yù)測
2.4 辣椒HSP90家族基因的染色體定位
2.5 辣椒、番茄、水稻和擬南芥HSP90家族基因比較分析
2.6 辣椒HSP90蛋白的亞細(xì)胞定位
2.7 辣椒HSP90家族基因的組織表達(dá)
2.8 辣椒HSP90家族基因在高溫脅迫不同時間下葉片中的表達(dá)
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