灰樹(shù)花[Grifola frondosa(Dicks.Fr)S.F.Gray]是一種重要的珍稀食藥用菌,其味道獨(dú)特鮮美且具有抗腫瘤、提高免疫力、降血壓及抗病毒等多種藥用價(jià)值。本研究對(duì)灰樹(shù)花菌絲體轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行高通量測(cè)序來(lái)搜尋SSR位點(diǎn),并應(yīng)用多態(tài)性EST‐SSR標(biāo)記對(duì)32份灰樹(shù)花菌株進(jìn)行遺傳多樣性評(píng)價(jià),取得以下研究結(jié)果:基于不同地域灰樹(shù)花的ITS rDNA序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),結(jié)果發(fā)現(xiàn),ITS rDNA構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)可以將來(lái)自亞洲和美國(guó)的菌株區(qū)分開(kāi),說(shuō)明灰樹(shù)花的地理距離和遺傳距離存在一定的相關(guān)性。對(duì)灰樹(shù)花菌絲體進(jìn)行高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,三個(gè)生物學(xué)重復(fù)樣本共獲得了13.46 G的數(shù)據(jù)量,DE NOVO拼接14347條Unigenes。共有9433個(gè)Unigenes比對(duì)上NR蛋白庫(kù),占65.74%;在GO功能分類(lèi)中,共54個(gè)類(lèi)別包括7366個(gè)Unigenes有具體功能注釋;有4347個(gè)Unigenes在KOG中獲得具體蛋白功能注釋;2799個(gè)Unigenes與KO庫(kù)有同源信息,注釋到255個(gè)代謝通路。利用MISA軟件,從獲得的Unigenes中進(jìn)行SSR位點(diǎn)查找,共找到515個(gè)SSR位點(diǎn)。利用Pr...

【文章頁(yè)數(shù)】：43 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第一篇 文獻(xiàn)綜述
    第一章 灰樹(shù)花研究現(xiàn)狀
        1.1 灰樹(shù)花概述
        1.2 灰樹(shù)花的人工馴化與栽培
        1.3 灰樹(shù)花的系統(tǒng)發(fā)育研究
        1.4 灰樹(shù)花遺傳多樣性的研究進(jìn)展
    第二章 RNA-Seq研究進(jìn)展
        2.1 轉(zhuǎn)錄組學(xué)的發(fā)展
        2.2 RNA-Seq的發(fā)展及優(yōu)勢(shì)
        2.3 RNA-Seq的應(yīng)用
    第三章 分子標(biāo)記在食藥用真菌遺傳多樣性分析中的應(yīng)用
        3.1 RFLP技術(shù)
        3.2 RAPD技術(shù)
        3.3 AFLP技術(shù)
        3.4 SSR微衛(wèi)星標(biāo)記
第二篇 研究?jī)?nèi)容
    第一章 基于ITS rDNA基因的灰樹(shù)花遺傳多樣性分析
        1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        1.2 試驗(yàn)方法
        1.3 序列比對(duì)和系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建
        1.4 結(jié)果與分析
        1.5 討論
    第二章 基于RNA-Seq的灰樹(shù)花菌絲體轉(zhuǎn)錄組分析
        2.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.3 結(jié)果與分析
        2.4 討論
    第三章 灰樹(shù)花SSR標(biāo)記開(kāi)發(fā)及多態(tài)性分析
        3.1 實(shí)驗(yàn)材料
        3.2 試驗(yàn)方法
        3.3 結(jié)果與分析
        3.4 討論
結(jié)論
作者簡(jiǎn)介
致謝
參考文獻(xiàn)



本文編號(hào)：3769220