為尋找控制葡萄果實發(fā)育期性狀及其他品質(zhì)性狀的基因位點,本研究對‘莎巴珍珠’SSR標記在后代衍生品種中的遺傳傳遞情況進行分析。并以179個葡萄品種為材料,基于GBS測序結果對8個葡萄果實品質(zhì)性狀進行了全基因組關聯(lián)分析研究。1.對‘莎巴珍珠’衍生系（‘莎巴珍珠’及其后代32個衍生品種以及5個其他親本）進行SSR標記。選取50對分布在葡萄19條染色體上的SSR標記,對‘莎巴珍珠’SSR標記在其衍生后代中的遺傳傳遞情況進行了分析。經(jīng)篩選得到3個高遺傳穩(wěn)定且遺傳頻率均在80%以上的‘莎巴珍珠’特異SSR標記——VVMD5、VVMD32和VMC4F8分別位于16、4和1號染色體上。注釋發(fā)現(xiàn),其所在區(qū)域基因分別注釋為受體蛋白激酶、未知蛋白和WRKY轉(zhuǎn)錄因子。研究結果表明,這些基因與‘莎巴珍珠’衍生品種果實發(fā)育期性狀相關。2.對收集到的179份葡萄材料進行GBS測序。經(jīng)篩選共獲得的32,311個分布于葡萄全基因組的高質(zhì)量SNP標記,用于全基因組關聯(lián)分析（GWAS）。（1）以葡萄果粒顏色的定位結果為參照選擇最優(yōu)統(tǒng)計模型——GEMMA,作為本研究GWAS分析的模型對葡萄果實品質(zhì)性狀進行分析。（2）研究結果... 

【文章頁數(shù)】：66 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
第1章 前言
    1.1 葡萄發(fā)育期性狀QTLs研究
    1.2 骨干親本研究
        1.2.1 骨干親本遺傳多樣性研究
        1.2.2 骨干親本優(yōu)異染色體區(qū)段的追蹤
        1.2.3 骨干親本QTL分析
    1.3 關聯(lián)分析
        1.3.1 關聯(lián)分析的優(yōu)勢
        1.3.2 葡萄全基因組關聯(lián)分析進展
        1.3.3 GBS-GWAS研究
    1.4 研究內(nèi)容及目標
第2章 材料方法
    2.1 植物材料
    2.2 DNA提取
    2.3 ‘莎巴珍珠’衍生系研究
        2.3.1 SSR標記分析
        2.3.2 SSR標記篩選
    2.4 自然群體研究
        2.4.1 自然群體的表型
        2.4.2 GBS測序
        2.4.3 連鎖不平衡(LD)、群體結構和聚類分析
        2.4.4 全基因組關聯(lián)分析
    2.5 標記位點基因注釋
第3章 結果分析
    3.1 ‘莎巴珍珠’衍生系研究
        3.1.1 ‘莎巴珍珠’衍生系SSR分子標記篩選
        3.1.2 標記位點基因注釋
    3.2 自然群體的研究
        3.2.1 表型分析
        3.2.2 SNP標記分析
        3.2.3 遺傳結構與連鎖不平衡
        3.2.4 全基因組關聯(lián)分析
        3.2.5 標記位點附近區(qū)域基因注釋
第4章 討論
    4.1 骨干親本及其衍生品種遺傳傳遞分析
    4.2 GWAS群體和模型
    4.3 果實性狀的候選基因
第5章 結論
參考文獻
附錄 Ⅰ179 個葡萄材料表型數(shù)據(jù)
附錄 Ⅱ ‘莎巴珍珠’衍生系SSR標記引物表
附錄 Ⅲ 四種GWAS分析模型Q-Q圖結果
致謝
攻讀學位期間的研究成果


【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3723914