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榨菜與紫甘藍嵌合體后代變異性狀發(fā)生的分子機理研究

發(fā)布時間:2022-12-18 16:29
  嫁接獲得的變異性狀在園藝作物的生產(chǎn)及科學研究中經(jīng)常被發(fā)現(xiàn),對嫁接獲得變異機理的研究已經(jīng)成為國內(nèi)外的熱點。本論文以蕓薹屬蔬菜榨菜(Brassica juncea(L.)Czern.et Coss.var.tumida Tsen et Lee)與紫甘藍(B.oleracea L.var.captataL.)嫁接嵌合體為材料,通過嵌合體連續(xù)自交獲得有性后代GSn(GSn=grafting-selfing,n = generations),觀察了 GSn發(fā)生變異的植物學性狀的特點及其遺傳規(guī)律;通過RNA-seq進行表達譜分析,尋找榨菜與GSn的差異表達基因及其遺傳規(guī)律,篩選與變異性狀可能相關(guān)的基因;通過MSAP(meth-ylation-sensitive amplified polymorphism)分析,探究嫁接引起的DNA甲基化變異及其遺傳規(guī)律,分析DNA甲基化變異與嫁接獲得變異性狀的關(guān)系;通過small RNA測序和比對分析,探究small RNA改變與嫁接誘導的DNA甲基化變異的關(guān)系;通過建立DNA序列未改變的F2表觀遺傳群體,對葉緣裂刻基因進行初步表觀定位。本論文取得的主要結(jié)果如下... 

【文章頁數(shù)】:129 頁

【學位級別】:博士

【文章目錄】:
致謝
摘要
Abstract
縮略詞表
1 緒論
    1.1 植物嫁接
        1.1.1 嫁接的方式
        1.1.2 嫁接獲得變異現(xiàn)象及其遺傳規(guī)律
        1.1.3 嫁接獲得變異的分子機理
    1.2 植物嵌合體
        1.2.1 嵌合體的特征和分類
        1.2.2 嵌合體的應用
    1.3 植物基因組DNA甲基化
        1.3.1 DNA甲基化形成的生物學機制
        1.3.2 DNA甲基化的生物學功能
        1.3.3 DNA甲基化的遺傳規(guī)律
        1.3.4 DNA甲基化的檢測方法
    1.4 siRNA的研究進展
        1.4.1 siRNA的形成和功能
        1.4.2 siRNA參與的RdDM途徑
    1.5 本研究的目的與意義
2 榨菜與紫甘藍莖尖嫁接獲得的變異性狀及其遺傳規(guī)律
    2.1 引言
    2.2 材料與方法
        2.2.1 實驗材料
        2.2.2 實驗方法
    2.3 結(jié)果與分析
        2.3.1 嵌合體TTC有性自交后代獲得的頂端分生組織變異
        2.3.2 嵌合體TTC有性自交后代獲得的葉形變異
        2.3.3 嵌合體TTC有性自交后代獲得的膨大瘤狀莖變異
    2.4 討論
3 榨菜與紫甘藍莖尖嫁接誘導的基因表達水平的變異及其規(guī)律
    3.1 引言
    3.2 材料與方法
        3.2.1 實驗材料
        3.2.2 實驗方法
    3.3 結(jié)果與分析
        3.3.1 Total RNA的質(zhì)量
        3.3.2 測序數(shù)據(jù)質(zhì)量分析、比對和注釋
        3.3.3 對照榨菜與嵌合體有性自交后代的差異表達基因分析
        3.3.4 對照榨菜與嵌合體有性自交后代的差異表達基因GO和KEGG分析
        3.3.5 qRT-PCR驗證
    3.4 討論
4 榨菜與紫甘藍莖尖嫁接誘導的DNA甲基化變異及其遺傳規(guī)律
    4.1 引言
    4.2 材料與方法
        4.2.1 實驗材料
        4.2.2 實驗方法
    4.3 結(jié)果與分析
        4.3.1 GS_1群體甲基化水平的改變
        4.3.2 GS_1群體甲基化模式的改變
        4.3.3 差異甲基化片段的遺傳規(guī)律分析
        4.3.4 差異甲基化片段序列的功能分析
        4.3.5 差異甲基化基因的表達分析及甲基化的重亞硫酸鹽測序驗證
    4.4 討論
5 榨菜與紫甘藍莖尖嫁接誘導的siRNA變化及其與DNA甲基化的關(guān)系
    5.1 引言
    5.2 材料與方法
        5.2.1 實驗材料
        5.2.2 實驗方法
    5.3 結(jié)果與分析
        5.3.1 總RNA的質(zhì)量
        5.3.2 small RNA測序數(shù)據(jù)質(zhì)量分析、注釋
        5.3.3 差異siRNA分析
        5.3.4 差異siRNAs與DMFs的比對分析
        5.3.5 24nt-siRNA引起uDMF9的甲基化變化
    5.4 討論
6 GS6與TTT雜交F_2表觀遺傳群體初步定位DNA甲基化的葉緣裂刻基因
    6.1 引言
    6.2 材料與方法
        6.2.1 實驗材料
        6.2.2 實驗方法
    6.3 結(jié)果與分析
        6.3.1 葉緣裂刻性狀的遺傳分析
        6.3.2 多態(tài)性MSAP引物的篩選
        6.3.3 葉緣裂刻分子標記初步定位
    6.4 討論
7 結(jié)論、創(chuàng)新點與后續(xù)展望
    7.1 結(jié)論
    7.2 創(chuàng)新點
    7.3 展望
參考文獻
發(fā)表論文情況


【參考文獻】:
期刊論文
[1]利用蕓薹屬植物嵌合體對組織與器官細胞層起源的研究[J]. 王燕,李俊星,陳利萍.  中國細胞生物學學報. 2011(08)
[2]離體條件下5-氮雜胞嘧啶核苷對菊花DNA甲基化和表型性狀的影響[J]. 王子成,聶麗娟,何艷霞.  園藝學報. 2009(12)
[3]嫁接對瓜菜生理影響的研究進展[J]. 施先鋒,彭金光,王宏太,童正富,曾紅霞,杜念華.  長江蔬菜. 2009(04)
[4]嫁接在植物育種中的應用研究進展[J]. 張新,秦志剛,菲力申,婁喜艷.  安徽農(nóng)業(yè)科學. 2008(15)
[5]嫁接雜交與果樹遺傳的特殊性[J]. 劉用生,李保印,李桂榮,周秀梅.  遺傳. 2004(05)
[6]嫁接導致的綠豆可遺傳性變異及其在綠豆育種中的應用(英文)[J]. 張丹華,孟昭璜,肖衛(wèi)民,王學臣,蘇都莫日根.  Acta Botanica Sinica. 2002(07)
[7]中國古今植物遠緣嫁接的理論和實踐意義[J]. 劉用生.  自然科學史研究. 2001(04)
[8]植物嫁接基礎(chǔ)理論研究(下)[J]. 楊世杰,盧善發(fā).  生物學通報. 1995(10)
[9]綠豆與甘薯嫁接的研究[J]. 孟昭璜,蘆翠喬.  華北農(nóng)學報. 1989(04)

博士論文
[1]榨菜與紫甘藍嫁接嵌合體后代葉形變異產(chǎn)生的分子機理及新種質(zhì)的創(chuàng)制[D]. 李俊星.浙江大學 2013
[2]榨菜與紫甘藍嫁接嵌合體誘導的可遺傳變異及其分子機理研究[D]. 王燕.浙江大學 2011

碩士論文
[1]全基因組DNA甲基化對甘藍型油菜春化作用的影響[D]. 高金燕.鄭州大學 2012
[2]離體條件下人工誘導菊花DNA甲基化變化[D]. 聶麗娟.河南大學 2008



本文編號:3722380

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