菜心（Brassica campestris L.ssp.chinesis var.utilis Tsen et Lee）是起源于我國華南地區(qū)的一種重要經濟蔬菜。在盛夏高溫多雨的生長季節(jié),菜心易遭遇到不同程度的高溫脅迫,導致菜心提前大量死亡和產量失收。近年來,隨著現代農業(yè)技術的發(fā)展,改良菜心品種適應高溫生長環(huán)境成為了市場迫切的需要。目前菜心耐高溫的研究主要集中在農藝性狀和生理生化方面,鮮有菜心熱脅迫分子機制的報道。據此,本研究收集大量的菜心種質材料,于不同季節(jié)栽種,篩選可行性的耐熱指標,并把菜心種質材料按耐熱性進行分類�；诓煌蜔岵诵牟牧系霓D錄組測序數據,分析耐熱候選基因在不同耐熱菜心材料間的等位變異,篩選出可能導致耐熱性差異的候選SNPs,為菜心的耐熱性分類、耐熱基因的挖掘和分子機理提供理論基礎。研究主要結果如下:1.高溫夏季,連續(xù)兩年在寧夏栽種200個菜心種質材料,并對11個耐熱相關的農藝性狀進行測定,以廣州常溫秋冬季栽種的相同材料的農藝性狀作為對照,篩選出相對值變異系數較大（CV≥15%）的9個農藝性狀作為評價菜心耐熱強弱的主要指標。利用模糊隸屬函數值評價菜心的耐心性,11個指... 

【文章頁數】：105 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第一章 文獻綜述
    1.1 菜心耐熱指標的篩選和評價
        1.1.1 菜心耐熱農藝性狀指標的篩選和評價
        1.1.2 菜心耐熱的生理特性的篩選和評價
    1.2 菜心熱脅迫分子機制的研究
    1.3 基于RNA-seq技術的SNP標記研究
    1.4 蕓苔屬作物耐熱候選基因的發(fā)掘
    1.5 候選基因生物信息學分析
        1.5.1 候選基因的基本理化性質分析
        1.5.2 候選基因的變異分析
    1.6 本研究的目的意義及內容
        1.6.1 目的意義
        1.6.2 研究內容
第二章 菜心生長期耐熱指標的篩選及耐熱性評價
    2.1 材料與方法
        2.1.1 試驗材料
        2.1.2 試驗方法
        2.1.3 指標測定與方法
        2.1.4 菜心耐熱指標的篩選
        2.1.5 不同來源的菜心材料耐熱性評價
    2.2 結果與分析
        2.2.1 菜心耐熱性指標的篩選
        2.2.2 利用模糊隸屬函數綜合評價菜心材料的耐熱性
        2.2.3 利用主成分綜合評價值判斷菜心材料的耐熱性
        2.2.4 菜心種質材料的耐熱性聚類分析
    2.3 討論
        2.3.1 菜心耐熱指標的選擇
        2.3.2 菜心品種耐熱性綜合評價方法的建立
        2.3.3 菜心耐熱品種的比較
第三章 不同耐熱菜心材料轉錄組SNP位點的挖掘
    3.1 試驗材料及方法
        3.1.1 試驗材料
        3.1.2 轉錄組數據來源
        3.1.3 不同耐熱菜心材料轉錄組數據SNP的分析
        3.1.4 含SNP基因功能注釋分析
        3.1.5 耐熱候選基因SNP位點的特征
    3.2 結果與分析
        3.2.1 菜心熱脅迫轉錄組SNP檢測
        3.2.2 SNP位點在各個染色體上的分布
        3.2.3 含SNP基因的GO功能和KEGG通路分類
        3.2.4 耐熱候選基因的SNP挖掘特征
    3.3 討論
        3.3.1 菜心熱脅迫轉錄組SNPs特性
        3.3.2 菜心SNP位點在染色體的分布
        3.3.3 含SNP基因的GO功能和KEGG通路的比較
        3.3.4 候選基因的SNP、GO功能和KEGG通路的比較
第四章 兩個耐熱候選基因的序列分析
    4.1 實驗材料
    4.2 試驗方法
        4.2.1 引物設計
        4.2.2 目的片段的擴增
        4.2.3 目的片段的回收和純化
        4.2.4 T-載體連接與轉化
        4.2.5 轉化及測序
        4.2.6 序列分析
    4.3 結果與分析
        4.3.1 PP2C77和IDD7 基因的DNA序列特征
        4.3.2 PP2C77蛋白的結構特征及進化關系
        4.3.3 IDD7蛋白的結構特征及進化分析
        4.3.4 菜心 PP2C77 和 IDD7 蛋白的功能預測
    4.4 討論
        4.4.1 PP2C蛋白的比較
        4.4.2 IDD蛋白的比較
第五章 總結與展望
    5.1 .總結
        5.1.1 菜心耐熱性的指標篩選及種質材料分類
        5.1.2 菜心熱脅迫轉錄組 SNP 的檢測及分析
        5.1.3 耐熱候選基因純合 SNP 位點挖掘及 GO 和 KEGG 分析
        5.1.4 候選基因的克隆和功能預測
    5.2 展望
參考文獻
碩士研究生期間發(fā)表論文
致謝


【參考文獻】：
期刊論文
[1]不同菜心品種萌發(fā)期和苗期耐熱性分析及其鑒定指標篩選[J]. 龐強強,周曼,孫曉東,陳貽誦,蔡興來.  西北農業(yè)學報. 2020(02)
[2]菜心耐熱性評價及酶促抗氧化系統對高溫脅迫的響應[J]. 龐強強,周曼,孫曉東,張文,蔡興來.  浙江農業(yè)學報. 2020(01)
[3]黃麻（Corchorus capsularis L.）干旱脅迫轉錄組初步分析[J]. 金關榮,陳杰,安霞.  分子植物育種. 2020(23)
[4]紫花苜蓿β-1,3-葡聚糖酶基因同源克隆與序列變異分析[J]. 高建明,桂枝,盧樹昌.  西部林業(yè)科學. 2019(05)
[5]六種菜心氨基酸組成及營養(yǎng)價值評價[J]. 原遠,王春政,周賢玉,李光光,鄭巖松,戴修純,喬燕春,雷建軍,張華.  南方農業(yè)學報. 2019(10)
[6]熱脅迫下水仙花葉片的轉錄組分析[J]. 宋姣敏,徐小萍,陳裕坤,陳桂信,賴鐘雄.  熱帶作物學報. 2019(10)
[7]白菜PLD基因家族全基因組鑒定及對高溫脅迫的響應[J]. 張藝思,劉高峰,劉路平,侯喜林.  西北植物學報. 2019(08)
[8]寧夏地區(qū)菜心早春栽培品種比較試驗[J]. 李旭霞,王轉莉.  安徽農學通報. 2019(14)
[9]菊葉香藜轉錄組單核苷酸多態(tài)性（SNP）信息挖掘及功能注釋分析[J]. 付蘇宏,雷鳴,張勇群,施靜,郝豆豆.  西南農業(yè)學報. 2019(04)
[10]綜合評價比較菜心及其近緣亞種蔬菜氨基酸營養(yǎng)價值[J]. 原遠,周賢玉,李光光,鄭巖松,江定,任海龍,雷建軍,張華.  食品與發(fā)酵工業(yè). 2019(14)

博士論文
[1]大豆苗期干旱和高溫脅迫應答機制研究及關鍵轉錄因子的篩選[D]. 王利彬.東北農業(yè)大學 2018
[2]甜橙bHLH家族轉錄因子發(fā)掘及CsbHLH18抗寒功能鑒定與作用機制解析[D]. 耿晶晶.華中農業(yè)大學 2018
[3]NAC家族轉錄因子OsNAC2介導赤霉素信號通路參與調控水稻株高和開花時間[D]. 陳旭.復旦大學 2013
[4]不結球白菜抗逆相關轉錄因子的克隆及耐熱耐寒相關蛋白的功能鑒定[D]. 朱波.南京農業(yè)大學 2008

碩士論文
[1]高溫脅迫下玉米葉片的轉錄組和蛋白質組分析[D]. 許小芳.河南農業(yè)大學 2019
[2]玉米響應高溫脅迫的轉錄組測序及關鍵調控基因的鑒定與分析[D]. 蔣玲玉.安徽師范大學 2019
[3]水稻耐熱脅迫基因的挖掘及其表達分析[D]. 王少波.福建農林大學 2019
[4]水稻PP2C基因在耐汞性中的功能分析[D]. 孔珍珍.浙江師范大學 2019
[5]小麥栽培種與野生種的轉錄組組裝及差異基因分析[D]. 李南南.山東農業(yè)大學 2018
[6]芍藥種子休眠與萌發(fā)相關基因PlPP2C的克隆及遺傳轉化[D]. 麻永磊.沈陽農業(yè)大學 2018
[7]水稻葉片衰老相關蛋白磷酸酶編碼基因OsSAPP3功能分析[D]. 崔勝男.沈陽農業(yè)大學 2018
[8]高溫脅迫下黃瓜基因的表達變化[D]. 盧俊成.揚州大學 2018
[9]小麥親緣物種二穗短柄草熱脅迫下轉錄組分析和MYB基因家族分析[D]. 陳守坤.西北農林科技大學 2018
[10]GhDRPP1轉基因棉花抗旱性及其相關的生理遺傳分析[D]. 魏寧.華中師范大學 2018



本文編號：3705442