不定根誘導(dǎo)是蘋(píng)果砧木無(wú)性繁殖的關(guān)鍵環(huán)節(jié),內(nèi)部因素和外部環(huán)境的變化均對(duì)不定根誘導(dǎo)有重要的調(diào)控作用。目前,有關(guān)不定根發(fā)育的研究多集中于基因的轉(zhuǎn)錄水平,其它層次的研究較為薄弱。本研究以蘋(píng)果矮化砧木‘T337’為材料,利用i TRAQ（Isobaric tag for a relative and absolute quantitation）和SMRT（Single molecule real time sequencing）測(cè)序技術(shù),探究不定根發(fā)生過(guò)程中的蛋白水平變化和復(fù)雜的可變剪切現(xiàn)象,對(duì)于豐富不定根發(fā)生的分子機(jī)制具有重要意義。主要結(jié)果如下:1.建立了‘T337’組培苗不定根發(fā)生誘導(dǎo)期的蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù),分析了外源吲哚-3-丁酸（IBA）處理后‘T337’的形態(tài)和激素水平的差異,明確了參與不定根產(chǎn)生的差異蛋白和信號(hào)通路。（1）外源（IBA）處理誘導(dǎo)了‘T337’組培苗不定根的產(chǎn)生,生根率和根長(zhǎng)顯著增加,生長(zhǎng)素（IAA）,脫落酸（ABA）和油菜素內(nèi)酯（BR）的含量前期增加,后期降低,赤霉素（GA）,玉米素（ZR）和茉莉酸甲酯（JA）則相反。（2）利用i TRAQ蛋白組學(xué)技術(shù),在不定根發(fā)生的誘... 

【文章頁(yè)數(shù)】：71 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 不定根的形成過(guò)程
    1.2 不定根發(fā)育的研究進(jìn)展
        1.2.1 激素參與不定根形成
        1.2.2 外界環(huán)境刺激影響不定根形成
    1.3 可變剪切
        1.3.1 可變剪切的發(fā)現(xiàn)
        1.3.2 可變剪切的特點(diǎn)
        1.3.3 可變剪切的研究進(jìn)展
    1.4 研究的目的和意義
第二章 不定根發(fā)生誘導(dǎo)期的蛋白質(zhì)組學(xué)研究
    2.1 材料和方法
        2.1.1 試驗(yàn)材料與采樣
        2.1.2 內(nèi)源激素的測(cè)定
        2.1.3 蛋白質(zhì)的提取
        2.1.4 iTRAQ標(biāo)記和質(zhì)譜分析
        2.1.6 蛋白質(zhì)的鑒定和差異表達(dá)分析
        2.1.7 基因功能富集(GO)和基因通路富集(KEGG)
        2.1.8 Real-Time PCR
    2.2 結(jié)果與分析
        2.2.1 外源施加IBA促進(jìn)不定根的形成
        2.2.2 蘋(píng)果砧木‘T337’不定根發(fā)生過(guò)程中內(nèi)源激素的變化
        2.2.3 ‘T337’不定根發(fā)生誘導(dǎo)期蛋白質(zhì)的鑒定和差異表達(dá)分析
        2.2.4 蛋白質(zhì)GO和 KEGG富集分析
        2.2.5 RT-qPCR驗(yàn)證
    2.3 討論
        2.3.1 IBA通過(guò)調(diào)節(jié)內(nèi)源激素的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)誘導(dǎo)不定根
        2.3.2 IBA通過(guò)調(diào)節(jié)碳水化合物代謝和能量產(chǎn)生誘導(dǎo)不定根
        2.3.3 IBA通過(guò)調(diào)節(jié)活性氧(ROS)和一氧化氮(NO)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)誘導(dǎo)不定根
        2.3.4 IBA通過(guò)調(diào)節(jié)微管、細(xì)胞壁狀態(tài)誘導(dǎo)不定根
        2.3.5 IBA通過(guò)蛋白質(zhì)體內(nèi)平衡誘導(dǎo)不定根
第三章 不定根發(fā)生相關(guān)基因的可變剪切鑒定分析
    3.1 材料和方法
        3.1.1 試驗(yàn)材料與方法
        3.1.2 文庫(kù)構(gòu)建和Pac Bio測(cè)序
        3.1.3 全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析流程
        3.1.4 二代轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
        3.1.5 可變剪切分析
        3.1.6 基因功能富集(GO)和基因通路富集(KEGG)
    3.2 結(jié)果與分析
        3.2.1 原始數(shù)據(jù)處理及全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本分析
        3.2.2 不定根發(fā)育過(guò)程的轉(zhuǎn)錄組分析
        3.2.3 不定根發(fā)育過(guò)程的可變剪切事件鑒定與分析
        3.2.4 不定根發(fā)育過(guò)程的差異可變剪切事件鑒定與分析
        3.2.5 差異剪切基因的GO富集分析
        3.2.6 參與不定根發(fā)生的可變剪切基因鑒定與分析
    3.3 討論
        3.3.1 利用SMRT測(cè)序技術(shù)分析轉(zhuǎn)錄組的必要性
        3.3.2 可變剪切事件參與蘋(píng)果砧木不定根‘T337’的發(fā)生
第四章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]植物不定根發(fā)生機(jī)理的研究進(jìn)展[J]. 張煥欣,董春娟,李福凱,王紅飛,尚慶茂.  西北植物學(xué)報(bào). 2017(07)



本文編號(hào)：3705297