番茄SYTA克隆表達及番茄SYTA互作蛋白篩選
發(fā)布時間:2022-10-11 14:38
在動物及擬南芥基因組中,突觸結合蛋白基因(synaptotagmin,SYT)是作為含有C2結構域的基因廣泛存在。目前已發(fā)現大量包含C2結構域的蛋白質,其中大多數參與細胞信號轉導或膜轉運。SYT都包含五個結構域:囊泡內N–端結構域,跨膜結構域,胞質中C2A,C2B,C–端結構域,其中C2A,C2B是行使功能的主要結構域。擬南芥基因組中含有6個SYT同源基因,分別命名為SYTA–F。已報道擬南芥SYTA在擬南芥鹽脅迫應答信號途徑中起著重要調節(jié)作用。近期研究表明擬南芥SYTA能與TMV的運動蛋白相互作用,在沉默SYTA的擬南芥中TMV運動蛋白的擴散受到抑制。番茄作為茄科植物的代表,是研究蔬菜中果實發(fā)育和成熟過裎的典型植物。本研究以2012年完成的番茄基因組測序為基礎,經比對有SYTA同源基因存在。為了明確番茄中SYTA的亞細胞定位及篩選預期互作的寄主蛋白,本研究以室內番茄幼苗為材料,克隆番茄SYTA同源基因,進行植物表達分析,并且在茄科植物煙草cDNA文庫中用酵母雙雜交篩選互作基因,測序比對,發(fā)現SYTA可與煙草鐵氧還蛋白I(ferredoxin I,Fd–I)在酵母細胞內直接互作。研究結...
【文章頁數】:77 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻綜述
1.動物SYTS功能研究進展
1.1 動物SYT相關亞型分類
1.2 Synaptotagmin基因家族結構域
1.3 SYT亞型亞細胞定位及組織分布
2. 擬南芥SYT研究進展
2.1 擬南芥中不同亞型分類
2.2 擬南芥SYTA功能研究
3. 酵母雙雜交研究進展
3.1 經典酵母雙雜交系統
3.2 其他酵母雙雜交系統
3.3 酵母雙雜交主要應用
第二章 引言
第三章 番茄SYTA的克隆、分析和表達
1.材料與方法
1.1 試驗時間與地點
1.2 試驗材料
1.3 試驗方法
2.番茄SYTA克隆結果與分析
2.1 番茄RNA提取
2.2 番茄SYTA RT-PCR
2.4 生物信息學分析
3.番茄SYTA構建至綠色熒光載體植物表達結果與分析
3.1 番茄SYTA亞克隆
3.2 重組植物表達載體pPZP–SYTA–GFP農桿菌轉化及SYTA–GFP融合蛋白表達
4.討論
第三章 番茄SYTA互作蛋白的篩選
1.試驗材料
2.構建誘餌表達載體PSTT91-SYTA
2.1 番茄SYTA與pSTT91雙酶切
2.2 重組載體連接
2.3 電泳檢測
2.4 質粒提取
2.5 番茄SYTA酵母雙雜交系統中自激活及毒性驗證
2.6 利用GAL-4 酵母雙雜交系統篩選煙草cDNA文庫
2.7 X-gal藍斑實驗分析篩選陽性克隆
2.8 酵母L40感受態(tài)細胞的制備
2.9 酵母雙雜交技術的操作步驟
3 結果與分析
3.1 酵母雙雜交誘餌表達載體pSTT91-SYTA的構建
3.2 番茄SYTA自激活驗證
3.3 誘餌酵母表達載體篩選煙草cDNA文庫
3.4 篩庫陽性克隆的測序分析
3.5 番茄SYTA與Fd I全長蛋白酵母雙雜交互作驗證
4.討論
第五章 結論與展望
1.結論
2.展望
參考文獻
附錄
致謝
在校期間發(fā)表論文及參加課題
【參考文獻】:
期刊論文
[1]普通煙草鐵氧還蛋白Ⅰ的原核表達、抗體制備及在ToMV侵染煙草體內表達分析[J]. 孫現超,李勇,周常勇,青玲. 中國農業(yè)科學. 2010(19)
[2]麻疹病毒絨猴細胞受體基因的克隆及功能鑒定[J]. 李凌云,劉鑫,張鵬,齊義鵬,程明. 科學通報. 2002(16)
碩士論文
[1]擬南芥synaptotagmin家族組織定位及非生物脅迫表達譜研究[D]. 田文鵬.蘭州大學 2011
本文編號:3690752
【文章頁數】:77 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻綜述
1.動物SYTS功能研究進展
1.1 動物SYT相關亞型分類
1.2 Synaptotagmin基因家族結構域
1.3 SYT亞型亞細胞定位及組織分布
2. 擬南芥SYT研究進展
2.1 擬南芥中不同亞型分類
2.2 擬南芥SYTA功能研究
3. 酵母雙雜交研究進展
3.1 經典酵母雙雜交系統
3.2 其他酵母雙雜交系統
3.3 酵母雙雜交主要應用
第二章 引言
第三章 番茄SYTA的克隆、分析和表達
1.材料與方法
1.1 試驗時間與地點
1.2 試驗材料
1.3 試驗方法
2.番茄SYTA克隆結果與分析
2.1 番茄RNA提取
2.2 番茄SYTA RT-PCR
2.4 生物信息學分析
3.番茄SYTA構建至綠色熒光載體植物表達結果與分析
3.1 番茄SYTA亞克隆
3.2 重組植物表達載體pPZP–SYTA–GFP農桿菌轉化及SYTA–GFP融合蛋白表達
4.討論
第三章 番茄SYTA互作蛋白的篩選
1.試驗材料
2.構建誘餌表達載體PSTT91-SYTA
2.1 番茄SYTA與pSTT91雙酶切
2.2 重組載體連接
2.3 電泳檢測
2.4 質粒提取
2.5 番茄SYTA酵母雙雜交系統中自激活及毒性驗證
2.6 利用GAL-4 酵母雙雜交系統篩選煙草cDNA文庫
2.7 X-gal藍斑實驗分析篩選陽性克隆
2.8 酵母L40感受態(tài)細胞的制備
2.9 酵母雙雜交技術的操作步驟
3 結果與分析
3.1 酵母雙雜交誘餌表達載體pSTT91-SYTA的構建
3.2 番茄SYTA自激活驗證
3.3 誘餌酵母表達載體篩選煙草cDNA文庫
3.4 篩庫陽性克隆的測序分析
3.5 番茄SYTA與Fd I全長蛋白酵母雙雜交互作驗證
4.討論
第五章 結論與展望
1.結論
2.展望
參考文獻
附錄
致謝
在校期間發(fā)表論文及參加課題
【參考文獻】:
期刊論文
[1]普通煙草鐵氧還蛋白Ⅰ的原核表達、抗體制備及在ToMV侵染煙草體內表達分析[J]. 孫現超,李勇,周常勇,青玲. 中國農業(yè)科學. 2010(19)
[2]麻疹病毒絨猴細胞受體基因的克隆及功能鑒定[J]. 李凌云,劉鑫,張鵬,齊義鵬,程明. 科學通報. 2002(16)
碩士論文
[1]擬南芥synaptotagmin家族組織定位及非生物脅迫表達譜研究[D]. 田文鵬.蘭州大學 2011
本文編號:3690752
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