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葡萄果實(shí)顏色QTL精細(xì)定位及候選基因挖掘

發(fā)布時(shí)間:2022-02-16 16:09
  葡萄屬于葡萄科(Vitaceae)葡萄屬(Vitis L.),是世界上栽培最廣泛和經(jīng)濟(jì)價(jià)值最高的果樹之一。果實(shí)顏色是葡萄的重要經(jīng)濟(jì)性狀,主要由果皮花色苷含量和組分決定。MYBA1和MYBA2兩個(gè)轉(zhuǎn)錄因子對葡萄果實(shí)花色苷的生物合成具有重要的調(diào)控作用,其突變很好地解釋了葡萄黃綠色果實(shí)形成的機(jī)制。但是,對于紅色系葡萄,果實(shí)從粉紅色到紫黑色變異類型極為豐富,呈現(xiàn)典型的數(shù)量性狀特點(diǎn),現(xiàn)有研究難以完全解釋葡萄果實(shí)顏色變異的分子機(jī)制。為了更好地闡釋紅色系葡萄果實(shí)形成的分子機(jī)制,本研究以歐亞種(V.vinifera)‘紅地球’ב玫瑰香’雜交群體為材料,對其果實(shí)顏色進(jìn)行了系統(tǒng)評價(jià),分析了群體Vv MYBA1和Vv MYBA2基因型與果實(shí)顏色的關(guān)系,基于群體基因組重測序開發(fā)的SNP標(biāo)記構(gòu)建了高密度遺傳圖譜,并進(jìn)行了葡萄果實(shí)顏色QTL定位,結(jié)合轉(zhuǎn)錄組測序從QTL定位區(qū)間篩選到多個(gè)候選基因,并對個(gè)別候選基因進(jìn)行了初步功能驗(yàn)證。主要研究結(jié)果如下:1.雜交群體果實(shí)從黃綠色到紫黑色均有分布,有明顯的性狀分離,紅色系雜交后代果實(shí)顏色從淺到深呈正態(tài)分布。果皮中花色苷含量分離明顯,含量最低1.43mg/kg(FW),最... 

【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省211工程院校教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:137 頁

【學(xué)位級別】:博士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略詞表
第一章 前言
    1.1 課題的提出
    1.2 文獻(xiàn)綜述
        1.2.1 植物色素花色苷的種類和結(jié)構(gòu)
        1.2.2 葡萄果皮中的花色苷與果實(shí)顏色密切相關(guān)
        1.2.3 葡萄果實(shí)中花色苷的合成、修飾和轉(zhuǎn)運(yùn)
        1.2.4 花色苷合成的內(nèi)部分子調(diào)控機(jī)制
        1.2.5 激素對花色苷積累的影響
        1.2.6 外界環(huán)境因素對花色苷積累的影響
        1.2.7 QTL定位在葡萄上的發(fā)展與應(yīng)用
    1.3 本研究的目的和內(nèi)容
    1.4 創(chuàng)新點(diǎn)
第二章 紅地球和玫瑰香雜交群體果實(shí)顏色性狀評價(jià)
    2.1 引言
    2.2 材料與方法
        2.2.1 試驗(yàn)材料
        2.2.2 DNA提取及真假雜交鑒定
        2.2.3 親本及雜交后代果實(shí)著色情況調(diào)查
        2.2.4 果皮花色苷提取及檢測
        2.2.5 數(shù)據(jù)分析
    2.3 結(jié)果與分析
        2.3.1 雜交群體真假雜交鑒定
        2.3.2 雜交群體果實(shí)著色情況調(diào)查
        2.3.3 雜交群體果皮中花色苷組分和含量分析
        2.3.4 雜交群體果實(shí)顏色與果皮中花色苷的關(guān)系
    2.4 討論
    2.5 本章小結(jié)
第三章 雜交群體Vv MYBA基因型分析
    3.1 引言
    3.2 材料與方法
        3.2.1 植物材料
        3.2.2 基因組DNA提取
        3.2.3 Vv MYBA基因型分析
        3.2.4 數(shù)據(jù)分析
    3.3 結(jié)果與分析
        3.3.1 親本Vv MYBA基因型分析
        3.3.2 雜交后代Vv MYBA基因型分析
        3.3.3 雜交群體Vv MYBA基因型與果實(shí)顏色的關(guān)系
    3.4 討論
    3.5 本章小結(jié)
第四章 基于高密度遺傳圖譜進(jìn)行葡萄果實(shí)顏色QTL定位
    4.1 引言
    4.2 材料與方法
        4.2.1 植物材料
        4.2.2 基因組DNA提取、文庫構(gòu)建及測序
        4.2.3 測序數(shù)據(jù)的過濾及比對
        4.2.4 群體SNP的檢測與標(biāo)記的開發(fā)
        4.2.5 遺傳圖譜的構(gòu)建
        4.2.6 QTL定位
    4.3 結(jié)果與分析
        4.3.1 雜交群體基因組重測序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)
        4.3.2 序列比對及群體SNP標(biāo)記的開發(fā)
        4.3.3 高密度遺傳圖譜的構(gòu)建
        4.3.4 葡萄果實(shí)顏色性狀QTL定位分析
    4.4 討論
    4.5 本章小結(jié)
第五章 基于轉(zhuǎn)錄組測序進(jìn)行QTL區(qū)段候選基因的篩選
    5.1 引言
    5.2 材料與方法
        5.2.1 試驗(yàn)材料
        5.2.2 RNA提取、文庫構(gòu)建和轉(zhuǎn)錄組測序
        5.2.3 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
        5.2.4 q RT-PCR分析
        5.2.5 QTL區(qū)間基因的注釋和候選基因篩選
        5.2.6 載體構(gòu)建和煙草轉(zhuǎn)化
        5.2.7 煙草花瓣中總花色苷的提取和檢測
    5.3 結(jié)果與分析
        5.3.1 紅地球和玫瑰香轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)
        5.3.2 葡萄果實(shí)顏色QTL定位區(qū)段候選基因的篩選
        5.3.3 q RT-PCR驗(yàn)證轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的可靠性
        5.3.4 候選基因VvMYB86的初步功能驗(yàn)證
    5.4 討論
    5.5 本章小結(jié)
第六章 結(jié)論與展望
    6.1 全文結(jié)論
    6.2 主要創(chuàng)新性結(jié)論
    6.3 展望與研究延續(xù)
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]葡萄初級核心種質(zhì)資源MybA基因型分析[J]. 孫磊,焦健,樊秀彩,姜建福,張穎,劉崇懷.  植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2016(02)
[2]部分中國野生葡萄果皮花色苷組分分析[J]. 孫磊,樊秀彩,張穎,姜建福,孫海生,劉崇懷.  果樹學(xué)報(bào). 2015(06)
[3]不同葡萄品種的VvmybA1基因型及其特征性DNA片段的序列分析[J]. 慕茜,吳偉民,房經(jīng)貴,孫欣,上官凌飛,趙密珍.  園藝學(xué)報(bào). 2011(11)
[4]桑葉葡萄和刺葡萄果皮中酚類物質(zhì)的組成分析[J]. 張明霞,劉崇懷,張靜,樊秀彩.  食品科學(xué). 2011(14)
[5]色差計(jì)在辣椒果實(shí)色澤變化檢測中的應(yīng)用[J]. 王利群,戴雄澤.  辣椒雜志. 2009(03)
[6]花色苷的結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性與降解機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 孫建霞,張燕,胡小松,吳繼紅,廖小軍.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2009(03)
[7]番茄果實(shí)采后貯藏的顏色動力學(xué)研究[J]. 汪琳,應(yīng)鐵進(jìn).  食品科技. 2000(05)
[8]中國葡萄野生種花色素雙糖苷的研究[J]. 段長青,賀普超,康靖全.  西北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 1997(05)

博士論文
[1]中國葡萄屬(Vitis L.)植物分類與地理分布研究[D]. 劉崇懷.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012

碩士論文
[1]葡萄DNA指紋數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建及品種鑒定[D]. 李貝貝.河南科技大學(xué) 2017
[2]山葡萄果實(shí)與酒中酚類和香氣物質(zhì)的指紋圖譜研究[D]. 王秀君.東北林業(yè)大學(xué) 2008



本文編號:3628261

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