基于RNA-Seq技術(shù)對(duì)黃果柑平、凸蒂性狀形成機(jī)理的初步探究
發(fā)布時(shí)間:2022-01-24 16:13
本試驗(yàn)以課題組前期調(diào)查的平蒂形(Flat Type, FT)和凸蒂形(Prominent Type,PT)黃果柑(Citrus cultivar cv. Huangguogan)為研究材料,為研究調(diào)控其果蒂性狀的內(nèi)在機(jī)理,試驗(yàn)首先通過(guò)常規(guī)的果實(shí)品質(zhì)分析方法,分析比較了兩種類型的黃果柑在成熟期時(shí)的果實(shí)品質(zhì)差異情況,緊接著從ISSR分子標(biāo)記手段研究?jī)烧呤欠裨谶z傳物質(zhì)上發(fā)生了改變,同時(shí)結(jié)合熒光定量PCR研究了調(diào)控細(xì)胞壁代謝的相關(guān)酶關(guān)鍵基因XET,分析了其生物學(xué)信息及在分別在平蒂形(FT)和凸蒂形(PT)黃果柑中的表達(dá)水平,分析它與該性狀的關(guān)系。最后結(jié)合RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的手段分析了FT和PT在兩個(gè)生長(zhǎng)發(fā)育階段差異基因的表達(dá)情況,研究結(jié)果表明:1.通過(guò)對(duì)比先鋒鄉(xiāng)和豐樂(lè)鄉(xiāng)當(dāng)?shù)爻墒炱跁r(shí)平蒂形(FT)與凸蒂形(PT)黃果柑果實(shí)品質(zhì),發(fā)現(xiàn)從總糖含量和糖酸比上,FT比PT均有優(yōu)勢(shì)。設(shè)計(jì)的引物無(wú)法用ISSR-PCR分子標(biāo)記方法將兩者區(qū)分開(kāi)來(lái),可能兩者并沒(méi)有遺傳物質(zhì)上的差異。2.通過(guò)改良的CTAB法提取黃果柑果皮總RNA,然后反轉(zhuǎn)錄為cDNA,并設(shè)計(jì)XET基因擴(kuò)增引物,克隆出黃果柑中的XET基因(Ci...
【文章來(lái)源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:54 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1不同果蒂形黃果巧差異比較??Fig?1?compariso打?of?two?type?huangguogan?which?have?difference?in?stalk?of?fruit??
黃果相??蒂類型黃果巧ISSR分析電泳檢測(cè)??W看出,選用的引物都擴(kuò)增出了條帶,并帶數(shù)均不同,說(shuō)明不同引物與DNA模板的結(jié)合類型的黃果世中擴(kuò)增出差異條帶。??__1.4500?bp??一兩—???5M?i>p
圖2黃果梢總DNA電泳國(guó)??Figure?2?Electrophoresis?of?To?化?1?RNA??注:1,2,3:平蒂形黃果巧??4,5,6:凸蒂形黃果相??2.2.3不同果蒂類型黃果巧ISSR分析電泳檢測(cè)??從圖3可W看出,選用的引物都擴(kuò)增出了條帶,并且不同引物在黃果巧中擴(kuò)的位點(diǎn)數(shù)和條帶數(shù)均不同,說(shuō)明不同引物與DNA模板的結(jié)合位點(diǎn)是不同的。但是8??條引物均沒(méi)有在兩種類型的黃果世中擴(kuò)增出差異條帶。??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]‘碭山酥梨’及其褐色果皮芽變PbXET基因克隆與表達(dá)分析[J]. 程召陽(yáng),孫虹麗,衡偉,賈兵,劉莉,葉振風(fēng),朱立武. 西北植物學(xué)報(bào). 2014(12)
[2]榨菜瘤狀莖膨大相關(guān)基因orf451的克隆及其表達(dá)分析[J]. 羅天寬,劉斌,吳海濤,徐謙,裘波音,鄒曉霞,李俊星,陳利萍. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2015(01)
[3]植物β-半乳糖苷酶[J]. 田愛(ài)梅,劉金龍,曹家樹(shù). 中國(guó)細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報(bào). 2014(05)
[4]ISSR標(biāo)記技術(shù)在湖南柑橘主要品種親緣關(guān)系研究中的應(yīng)用[J]. 黃綠紅,劉詠紅,李高陽(yáng),張菊華. 湖南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(17)
[5]白樺木聚糖內(nèi)糖基轉(zhuǎn)移酶XET基因序列及表達(dá)[J]. 張巖,王玉成,吳英杰,王超. 東北林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2011(10)
[6]植物細(xì)胞壁松弛因子[J]. 趙運(yùn)軍,李來(lái)庚. 植物生理學(xué)報(bào). 2011(10)
[7]果實(shí)軟化相關(guān)PG基因的進(jìn)化分析和基因組定位[J]. 魏瀟,劉威生,劉寧,章秋平,張玉萍,劉碩,劉有春. 園藝學(xué)報(bào). 2011(09)
[8]石棉縣黃果柑生物學(xué)特性調(diào)查與差異株系比較[J]. 汪志輝,劉世福,嚴(yán)巧巧,蔣凌萍. 北方園藝. 2011(14)
[9]中越金柑種質(zhì)資源的ISSR分析[J]. 黃桂香,郭麗英,張樹(shù)偉,何新華,周瑞陽(yáng),陳虎,楊春獎(jiǎng). 果樹(shù)學(xué)報(bào). 2011(04)
[10]非生物脅迫下植物細(xì)胞壁組分變化[J]. 裴惠娟,張滿效,安黎哲. 生態(tài)學(xué)雜志. 2011(06)
碩士論文
[1]黃果柑的親本及黃果柑與不知火的親緣關(guān)系探究[D]. 王雪飛.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[2]黃瓜苯丙烷類代謝關(guān)鍵酶活性及基因表達(dá)的研究[D]. 孟雪嬌.哈爾濱師范大學(xué) 2011
[3]黃果柑不同株系比較與提高果實(shí)品質(zhì)研究[D]. 馮秋平.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[4]大麗菊花瓣衰老相關(guān)蛋白質(zhì)組及XET基因的研究[D]. 闞雪芹.蘇州大學(xué) 2010
[5]雜柑的遺傳多樣性與親緣關(guān)系研究[D]. 張艷.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[6]臍橙果皮發(fā)育與裂果發(fā)生的解剖學(xué)研究[D]. 李蕾.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
本文編號(hào):3606888
【文章來(lái)源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:54 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1不同果蒂形黃果巧差異比較??Fig?1?compariso打?of?two?type?huangguogan?which?have?difference?in?stalk?of?fruit??
黃果相??蒂類型黃果巧ISSR分析電泳檢測(cè)??W看出,選用的引物都擴(kuò)增出了條帶,并帶數(shù)均不同,說(shuō)明不同引物與DNA模板的結(jié)合類型的黃果世中擴(kuò)增出差異條帶。??__1.4500?bp??一兩—???5M?i>p
圖2黃果梢總DNA電泳國(guó)??Figure?2?Electrophoresis?of?To?化?1?RNA??注:1,2,3:平蒂形黃果巧??4,5,6:凸蒂形黃果相??2.2.3不同果蒂類型黃果巧ISSR分析電泳檢測(cè)??從圖3可W看出,選用的引物都擴(kuò)增出了條帶,并且不同引物在黃果巧中擴(kuò)的位點(diǎn)數(shù)和條帶數(shù)均不同,說(shuō)明不同引物與DNA模板的結(jié)合位點(diǎn)是不同的。但是8??條引物均沒(méi)有在兩種類型的黃果世中擴(kuò)增出差異條帶。??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]‘碭山酥梨’及其褐色果皮芽變PbXET基因克隆與表達(dá)分析[J]. 程召陽(yáng),孫虹麗,衡偉,賈兵,劉莉,葉振風(fēng),朱立武. 西北植物學(xué)報(bào). 2014(12)
[2]榨菜瘤狀莖膨大相關(guān)基因orf451的克隆及其表達(dá)分析[J]. 羅天寬,劉斌,吳海濤,徐謙,裘波音,鄒曉霞,李俊星,陳利萍. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2015(01)
[3]植物β-半乳糖苷酶[J]. 田愛(ài)梅,劉金龍,曹家樹(shù). 中國(guó)細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報(bào). 2014(05)
[4]ISSR標(biāo)記技術(shù)在湖南柑橘主要品種親緣關(guān)系研究中的應(yīng)用[J]. 黃綠紅,劉詠紅,李高陽(yáng),張菊華. 湖南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(17)
[5]白樺木聚糖內(nèi)糖基轉(zhuǎn)移酶XET基因序列及表達(dá)[J]. 張巖,王玉成,吳英杰,王超. 東北林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2011(10)
[6]植物細(xì)胞壁松弛因子[J]. 趙運(yùn)軍,李來(lái)庚. 植物生理學(xué)報(bào). 2011(10)
[7]果實(shí)軟化相關(guān)PG基因的進(jìn)化分析和基因組定位[J]. 魏瀟,劉威生,劉寧,章秋平,張玉萍,劉碩,劉有春. 園藝學(xué)報(bào). 2011(09)
[8]石棉縣黃果柑生物學(xué)特性調(diào)查與差異株系比較[J]. 汪志輝,劉世福,嚴(yán)巧巧,蔣凌萍. 北方園藝. 2011(14)
[9]中越金柑種質(zhì)資源的ISSR分析[J]. 黃桂香,郭麗英,張樹(shù)偉,何新華,周瑞陽(yáng),陳虎,楊春獎(jiǎng). 果樹(shù)學(xué)報(bào). 2011(04)
[10]非生物脅迫下植物細(xì)胞壁組分變化[J]. 裴惠娟,張滿效,安黎哲. 生態(tài)學(xué)雜志. 2011(06)
碩士論文
[1]黃果柑的親本及黃果柑與不知火的親緣關(guān)系探究[D]. 王雪飛.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[2]黃瓜苯丙烷類代謝關(guān)鍵酶活性及基因表達(dá)的研究[D]. 孟雪嬌.哈爾濱師范大學(xué) 2011
[3]黃果柑不同株系比較與提高果實(shí)品質(zhì)研究[D]. 馮秋平.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[4]大麗菊花瓣衰老相關(guān)蛋白質(zhì)組及XET基因的研究[D]. 闞雪芹.蘇州大學(xué) 2010
[5]雜柑的遺傳多樣性與親緣關(guān)系研究[D]. 張艷.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[6]臍橙果皮發(fā)育與裂果發(fā)生的解剖學(xué)研究[D]. 李蕾.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
本文編號(hào):3606888
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