基于rDNA-ITS序列的甘肅甘南野生羊肚菌遺傳多樣性分析
發(fā)布時(shí)間:2022-01-17 15:43
通過對采自甘肅甘南藏區(qū)的16株野生羊肚菌菌株進(jìn)行分子生物學(xué)分析,對rDNA基因內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS)片段進(jìn)行PCR擴(kuò)增并測序,測序結(jié)果在GenBank中進(jìn)行BLAST比對,鑒定得知,16株供試羊肚菌共歸納為5種,分別為黑脈羊肚菌(Morchella angusticeps)、羊肚菌(Morchella esculenta)、高羊肚菌(Morchella elata)、粗腿羊肚菌(Morchella crapssipes)和尖頂羊肚菌(Morchella conica)。根據(jù)采用最大簡約法(MP)和鄰接法(NJ)構(gòu)建的分子進(jìn)化樹得知,2種分子進(jìn)化樹拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)相似,并且Bootstrap驗(yàn)證顯示,系統(tǒng)發(fā)育樹各分支都有很高的支持率,說明其系統(tǒng)關(guān)系有很高的可信度。結(jié)果可為該地區(qū)羊肚菌(Morchella spp.)的系統(tǒng)分類提供較為準(zhǔn)確的分子性狀依據(jù)。
【文章來源】:江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(17)
【文章頁數(shù)】:4 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 供試菌株
1.2 主要試劑
1.3 總DNA提取
1.4 PCR擴(kuò)增
1.4.1 PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系
1.4.2 PCR擴(kuò)增程序
1.5 ITS片段測序
2 結(jié)果與分析
2.1 PCR擴(kuò)增結(jié)果
2.2 ITS序列測序及BLAST比對分析
2.3 基于ITS序列系統(tǒng)樹的構(gòu)建
3 結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]滇西北地區(qū)羊肚菌的分子鑒定及ITS序列分析[J]. 劉文叢,劉穎,郭相,劉弟,馬明,李宗菊,馬紹賓. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(03)
[2]幾種食用菌子實(shí)體總DNA提取方法的比較研究[J]. 白永宏,陳國梁,閆冬,張向前. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(19)
[3]基于ITS序列分析對秦嶺冷水溝羊肚菌的鑒定[J]. 戴璐,李峻志,李安利,祁鵬,丁仕剛. 中國食用菌. 2010(06)
[4]DNA C-值與被子植物入侵性關(guān)系的數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析——以中國境內(nèi)有分布的539種被子植物為例[J]. 郭水良,陳國奇,毛俐慧. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2008(08)
[5]云南羊肚菌rDNA的ITS序列與親緣關(guān)系分析[J]. 沈洪,陳明杰,趙永昌,潘迎捷. 食用菌學(xué)報(bào). 2007(02)
[6]羊肚菌研究綜述[J]. 謝占玲,謝占青. 青海大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2007(02)
[7]核糖體rDNAITS序列在真菌學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 匡治州,許楊. 生命的化學(xué). 2004(02)
[8]甘南野生羊肚菌生態(tài)研究初報(bào)[J]. 羅植柚. 中國食用菌. 1986(01)
[9]甘南藏族自治州羊肚菌調(diào)查[J]. 顧龍?jiān)? 食用菌科技. 1984(01)
碩士論文
[1]羊肚菌培養(yǎng)條件優(yōu)化及其多糖生物活性的研究[D]. 周麗偉.安徽大學(xué) 2007
本文編號:3594997
【文章來源】:江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(17)
【文章頁數(shù)】:4 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 供試菌株
1.2 主要試劑
1.3 總DNA提取
1.4 PCR擴(kuò)增
1.4.1 PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系
1.4.2 PCR擴(kuò)增程序
1.5 ITS片段測序
2 結(jié)果與分析
2.1 PCR擴(kuò)增結(jié)果
2.2 ITS序列測序及BLAST比對分析
2.3 基于ITS序列系統(tǒng)樹的構(gòu)建
3 結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]滇西北地區(qū)羊肚菌的分子鑒定及ITS序列分析[J]. 劉文叢,劉穎,郭相,劉弟,馬明,李宗菊,馬紹賓. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(03)
[2]幾種食用菌子實(shí)體總DNA提取方法的比較研究[J]. 白永宏,陳國梁,閆冬,張向前. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(19)
[3]基于ITS序列分析對秦嶺冷水溝羊肚菌的鑒定[J]. 戴璐,李峻志,李安利,祁鵬,丁仕剛. 中國食用菌. 2010(06)
[4]DNA C-值與被子植物入侵性關(guān)系的數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析——以中國境內(nèi)有分布的539種被子植物為例[J]. 郭水良,陳國奇,毛俐慧. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2008(08)
[5]云南羊肚菌rDNA的ITS序列與親緣關(guān)系分析[J]. 沈洪,陳明杰,趙永昌,潘迎捷. 食用菌學(xué)報(bào). 2007(02)
[6]羊肚菌研究綜述[J]. 謝占玲,謝占青. 青海大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2007(02)
[7]核糖體rDNAITS序列在真菌學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 匡治州,許楊. 生命的化學(xué). 2004(02)
[8]甘南野生羊肚菌生態(tài)研究初報(bào)[J]. 羅植柚. 中國食用菌. 1986(01)
[9]甘南藏族自治州羊肚菌調(diào)查[J]. 顧龍?jiān)? 食用菌科技. 1984(01)
碩士論文
[1]羊肚菌培養(yǎng)條件優(yōu)化及其多糖生物活性的研究[D]. 周麗偉.安徽大學(xué) 2007
本文編號:3594997
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