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基于表型性狀及SSR、SNP標(biāo)記的櫻桃番茄種質(zhì)資源遺傳多樣性分析

發(fā)布時(shí)間:2022-01-15 02:27
  由于番茄育種過(guò)程中櫻桃番茄優(yōu)良性狀的聚合及定向選擇,其遺傳背景越來(lái)越趨于狹窄,本研究首先利用Mi標(biāo)記,通過(guò)L16(45)正交試驗(yàn)設(shè)計(jì)對(duì)櫻桃番茄實(shí)用化PCR分子標(biāo)記擴(kuò)增反應(yīng)體系進(jìn)行優(yōu)化;以收集到的54份櫻桃番茄種質(zhì)資源為供試材料,利用上述優(yōu)化后的PCR體系與程序?qū)┰嚨?4份櫻桃番茄進(jìn)行抗病性分子鑒定,并分別對(duì)表型性狀中的15個(gè)數(shù)量性狀進(jìn)行遺傳變異分析及相關(guān)性分析,對(duì)遺傳變異比較豐富的18個(gè)性狀進(jìn)行主成分分析,在此基礎(chǔ)上開展54份櫻桃番茄種質(zhì)的綜合評(píng)價(jià)和聚類分析;利用北京市農(nóng)林科學(xué)院申請(qǐng)專利中的第一套SSR引物(24對(duì)),通過(guò)ABI 3500毛細(xì)管電泳儀對(duì)54份櫻桃番茄種質(zhì)資源進(jìn)行檢測(cè);利用374對(duì)SNP引物和KASP技術(shù)對(duì)54櫻桃番茄種質(zhì)資源進(jìn)行基因型檢測(cè);利用表型性狀結(jié)合SSR及SNP標(biāo)記對(duì)其進(jìn)行遺傳多樣性研究。研究結(jié)果表明:1.櫻桃番茄實(shí)用化PCR分子標(biāo)記PCR最佳反應(yīng)體系(20 μL)為引物0.5 μmol/L、Mg2+1.5mmol/L、dNTPs0.3mmol/L、DNA 480ng、聚合酶 1.OUTaq;最適退火溫度 56℃,最佳循環(huán)次數(shù)為33次;從中篩選出至少含有1種抗... 

【文章來(lái)源】:寧夏大學(xué)寧夏回族自治區(qū) 211工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】:89 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

基于表型性狀及SSR、SNP標(biāo)記的櫻桃番茄種質(zhì)資源遺傳多樣性分析


圖2-1番茄葉片DNA的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)??

電泳圖,分子標(biāo)記,正交試驗(yàn),反應(yīng)體系


J-2?000?bp??關(guān)l川隱:??圖2-1番茄葉片DNA的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)??Fig.2-1?The?electrophoretogram?of?DNA?samples?of?Tomato??2.2.2番茄抗病基因分子標(biāo)記PCR正交設(shè)計(jì)直觀分析??正交試驗(yàn)PCR產(chǎn)物電泳結(jié)果如圖2-2所示,并對(duì)4次重復(fù)實(shí)驗(yàn)分別進(jìn)行評(píng)分(表2-5)。假設(shè)各因素??間不存在交互作用,計(jì)算同一影響因素不同水平打分結(jié)果的均值和極差,由表2-6可知,各因素對(duì)PCR結(jié)??果的影響程度依次為:模板DNA>引物>dNTPs>Mg>>Taq酶,即模板DNA對(duì)番茄PCR反應(yīng)體系影響最大,??Taq酶對(duì)番茄PCR反應(yīng)體系影響最小。??1?1?2?2?3?3?4?4?5?5?6?6?7?7?8?8?9?9?10?10?11?11?12?12?M?13?13?14?14?15?15?16?16?M??■—2?000?bp??H—1?000?bp??D—750?bp??3—500?bp??■?■?^^3—250?bp??ioobp??圖2-2抗病基因分子標(biāo)記反應(yīng)體系正交試驗(yàn)16個(gè)處理的電泳結(jié)果??Fig.2-2?Electrophoretogram?of?Tomato?by?molecular?maker?of?resistance?gene?reaction?orthogonal?design???12-??

循環(huán)次數(shù),分子標(biāo)記,條帶


抗病檢測(cè)任務(wù)重,為了更高效、便捷的同時(shí)鑒定多種病害,將退火溫度固定為56°C。??2.2.6番茄抗病基因分子標(biāo)記PCR循環(huán)次數(shù)的選擇??如圖2-5所示,為了保證PCR擴(kuò)增效果更好,本實(shí)驗(yàn)對(duì)PCR循環(huán)次數(shù)進(jìn)行篩選,分別設(shè)置了?30次、??'?33次、36次、39次和41次循環(huán)共5個(gè)循環(huán)梯度,結(jié)果表明,5個(gè)循環(huán)梯度均可擴(kuò)增出較為清晰的目標(biāo)條??帶,但30次循環(huán)較其他循環(huán)次數(shù)來(lái)說(shuō),擴(kuò)增出的條帶較弱,33次、36次循環(huán)擴(kuò)增出的條帶較亮,39次、??40次循環(huán)擴(kuò)增出的條帶最亮,在不影響試驗(yàn)結(jié)果的前提下從節(jié)約時(shí)間考慮,番茄抗病基因分子標(biāo)記PCR??反應(yīng)循環(huán)次數(shù)為33次即可保證正常擴(kuò)增。??30?30?30?33?33?33?36?36?36?39?39?39?41?41?41?M??3-,?'?-???■—2?000?bp??1?000?bp??■—750?bp??<'■*?*?八,500?bp??250?bp??100?bp??圖2-5循環(huán)次數(shù)對(duì)抗病基因分子標(biāo)記的影響??Fig.2-5?Effects?of?different?different?cycle?times?on?resistance?gene?reaction?orthogonal?design??2.2.7最佳反應(yīng)體系的驗(yàn)證與抗病種質(zhì)篩選??用篩選出的最佳反應(yīng)體系(20?ML):?0.5?Pmol/L?引物、1.5mmol/L?Mg2_、0.3?mmol/L?dNTPs、1.0U?Taq??DNA聚合酶、480ngDNA;最適擴(kuò)增程序:95°C預(yù)變性5minl個(gè)循環(huán)

【參考文獻(xiàn)】:
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[10]基于SSR分子標(biāo)記的葡萄種質(zhì)資源遺傳多樣性分析及品種鑒定[D]. 張萌.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012



本文編號(hào):3589712

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