不結(jié)球白菜（Brassica rapa ssp.chinensis）,原產(chǎn)中國,是長江流域及其以南地區(qū)大量種植,分布最廣,種類最多的蕓薹屬蔬菜作物之一。不結(jié)球白菜存在三個變種:普通不結(jié)球白菜,烏塌菜和菜薹,品種的多樣性使得不結(jié)球白菜存在多種不同的葉形。葉的形態(tài)影響不結(jié)球白菜對環(huán)境的適應(yīng)性及其商品價值,選擇性狀優(yōu)良,提供滿足市場需求的不結(jié)球白菜是生產(chǎn)實踐過程重要的環(huán)節(jié),但目前對不結(jié)球白菜葉發(fā)育機理的研究較少。本研究利用RNA-Seq技術(shù)分析了不結(jié)球白菜圓葉、裂葉近等基因系差異表達(dá)基因（DEGs）,發(fā)掘參與不結(jié)球白菜葉發(fā)育的候選基因;克隆了其中一個候選基因BrLOM2,分析了其時空表達(dá)特性及對激素的響應(yīng);通過轉(zhuǎn)基因技術(shù)探索了BrLOM2基因在葉發(fā)育過程的功能。主要得到以下結(jié)果:1.應(yīng)用RNA-Seq技術(shù)從mRNA水平發(fā)掘了圓葉不結(jié)球白菜、裂葉不結(jié)球白菜近等基因系的表達(dá)差異基因。圓葉、裂葉不結(jié)球白菜過濾掉低質(zhì)量reads后分別獲得54223970、54840708對高質(zhì)量reads,唯一比對到參考基因組的reads比例為70.42%和70.19%,說明RNA-Seq結(jié)果及所選參考序列可靠。裂... 

【文章來源】：西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：49 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

堿基組成情況和質(zhì)量分布

90H相對190B差異表達(dá)基因數(shù)及差異倍數(shù)統(tǒng)計

差異基因的Pathway分析


本文編號：3576025