斑玉蕈Hypsizygus marmoreus,俗稱真姬菇、海鮮菇,是我國工廠化栽培的重要食用菌之一,因味道鮮美、營養(yǎng)豐富廣受人們青睞。目前斑玉蕈生產(chǎn)存在周期長、成本高、效率低等問題。本研究利用高通量測序分析斑玉蕈不同生長發(fā)育階段細(xì)菌的群落結(jié)構(gòu)、消長規(guī)律,并從菌包中分離獲得優(yōu)勢細(xì)菌,分析該菌在斑玉蕈生長發(fā)育中的作用,為斑玉蕈生長發(fā)育機理研究縮短生產(chǎn)周期、提高生產(chǎn)效率奠定扎實基礎(chǔ)。主要的研究結(jié)果如下:1.斑玉蕈不同生長階段細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和多樣性分析斑玉蕈不同生長階段高通量測序結(jié)果表明,斑玉蕈平板菌絲及不同生長階段菌包內(nèi)部（空白菌包、半袋期、滿袋期、后熟期）5組樣品中共檢測出690個OTUs,隸屬于34個門、79個綱、127個目、228個科、417個屬。主要的優(yōu)勢菌門為厚壁菌門和變形菌門,優(yōu)勢菌屬為Rummeliibacillus屬、類芽孢桿菌屬和賴氨酸芽孢桿菌屬。在門水平上,厚壁菌門的細(xì)菌豐度隨著菌絲的生長呈現(xiàn)出明顯的下降趨勢,變形菌門細(xì)菌豐度則呈現(xiàn)出上升的趨勢,并在后熟期達到最大占比54.72%。在屬水平上,Rummeliibacillus屬、賴氨酸芽孢桿菌屬和芽孢桿菌屬的細(xì)菌豐度在滿袋... 

【文章來源】：福建農(nóng)林大學(xué)福建省

【文章頁數(shù)】：72 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

斑玉蕈樣品HMPM:平板菌絲；HMCK:空白菌包；HMBH:半袋期；HMBF:滿袋期；HMBm:后熟期

斑玉蕈不同生長階段細(xì)菌特性分析及功能研究13417個屬、289個種。不同樣品OTU數(shù)量分布如圖2-2所示。平板菌絲樣品中OTU數(shù)量最多，共有495個OTUs，顯著多于不同生長階段菌包樣品的OTU數(shù)量。半袋期、滿袋期和后熟期的OTU數(shù)量呈現(xiàn)上升趨勢，但樣品之間差異不顯著。圖2-2樣品中OTU數(shù)量分布圖Fig.2-2OTUdistributionsofthesamples注：不同小寫字母表示不同樣品分組之間差異顯著(P<0.05)Note:Differentlowercaselettersindicatedthattherewassignificantdifferenceamongthegroupsofdifferentsamples(P<0.05)3.2稀釋性曲線分析稀釋性曲線是用于驗證測序數(shù)據(jù)量是否足以反映樣品中的物種多樣性。如圖2-3所示，除了空白菌包樣品，其他4組樣品的稀釋曲線均呈先上升后趨向平緩的趨勢，說明這4組樣品取樣合理，能夠比較真實地反映樣品中細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)組成。空白菌包樣品的稀釋性曲線仍處于上升狀態(tài)，說明更多的數(shù)據(jù)量還會產(chǎn)生新的OTU，因此該樣品在反映真實OTU情況上可能存在一定的偏差，推測可能是由于空白菌包內(nèi)細(xì)菌含量較少，加上樣品總DNA提取過程中受栽培料基質(zhì)影響較大的原因，使得提取的DNA含量不能滿足一次測序需求。

第二章斑玉蕈不同生長時期細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和多樣性分析14圖2-397%相似水平下樣品的稀釋曲線Fig.2-3Rarefactioncurvesatthe97%similaritylevel3.3斑玉蕈平板菌絲及不同生長階段菌包內(nèi)細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)及變化在門分類水平上（圖2-4），5個樣品共檢測到34個細(xì)菌門，優(yōu)勢菌門依次是厚壁菌門Firmicutes（63.89%）、變形菌門Proteobacteria（30.63%）、擬桿菌門Bacteroidetes（2.61%）、放線菌門Actinobacteria（1.26%）、綠彎菌門Chloroflexi（0.40%）、酸桿菌門Acidobacteria（0.37%）、藍(lán)細(xì)菌門Cyanobacteria（0.35%）、綠彎菌門Chloroflexi（0.40%）、芽單胞菌門Gemmatimonadetes（0.08%）、疣微菌門Verrucomicrobia（0.16%）和梭桿菌門Fusobacteria（0.19%）。在這十個細(xì)菌門中，僅放線菌門和厚壁菌門屬于革蘭氏陽性細(xì)菌，其余菌門均屬于革蘭氏陰性細(xì)菌。厚壁菌門在半袋期、滿袋期和后熟期的細(xì)菌豐度占比分別為99.89%、95.53%、44.08%，隨著菌包內(nèi)菌絲的生長呈現(xiàn)下降趨勢。變形菌門在半袋期、滿袋期和后熟期的細(xì)菌豐度占比分別為0%、4.41%、54.72%，隨著菌包內(nèi)菌絲的生長呈現(xiàn)上升趨勢。厚壁菌門中，細(xì)菌主要集中在芽孢桿菌綱Bacilli（58.26%）。變形菌門中的細(xì)菌主要集中在γ-變形菌綱Gammaproteobacteria（26.73%）、α-變形菌綱Alphaproteobacteria（1.90%）、β-變形菌綱Betaproteobacteria（1.38%）和δ-變形菌綱Deltaproteobacteria（0.4%），其中γ-變形菌綱作為變形菌門中的主要優(yōu)勢菌綱，其主要集中于腸桿菌目Enterobacteriales（21.04%）。此外，對比不同樣品間門水平上的細(xì)菌群落分布，發(fā)現(xiàn)平板菌絲中的菌門種類多于不同生長階段


本文編號：3543021