斑玉蕈Hypsizygus marmoreus,俗稱真姬菇、海鮮菇,是我國(guó)工廠化栽培的重要食用菌之一,因味道鮮美、營(yíng)養(yǎng)豐富廣受人們青睞。目前斑玉蕈生產(chǎn)存在周期長(zhǎng)、成本高、效率低等問(wèn)題。本研究利用高通量測(cè)序分析斑玉蕈不同生長(zhǎng)發(fā)育階段細(xì)菌的群落結(jié)構(gòu)、消長(zhǎng)規(guī)律,并從菌包中分離獲得優(yōu)勢(shì)細(xì)菌,分析該菌在斑玉蕈生長(zhǎng)發(fā)育中的作用,為斑玉蕈生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)理研究縮短生產(chǎn)周期、提高生產(chǎn)效率奠定扎實(shí)基礎(chǔ)。主要的研究結(jié)果如下:1.斑玉蕈不同生長(zhǎng)階段細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和多樣性分析斑玉蕈不同生長(zhǎng)階段高通量測(cè)序結(jié)果表明,斑玉蕈平板菌絲及不同生長(zhǎng)階段菌包內(nèi)部（空白菌包、半袋期、滿袋期、后熟期）5組樣品中共檢測(cè)出690個(gè)OTUs,隸屬于34個(gè)門(mén)、79個(gè)綱、127個(gè)目、228個(gè)科、417個(gè)屬。主要的優(yōu)勢(shì)菌門(mén)為厚壁菌門(mén)和變形菌門(mén),優(yōu)勢(shì)菌屬為Rummeliibacillus屬、類芽孢桿菌屬和賴氨酸芽孢桿菌屬。在門(mén)水平上,厚壁菌門(mén)的細(xì)菌豐度隨著菌絲的生長(zhǎng)呈現(xiàn)出明顯的下降趨勢(shì),變形菌門(mén)細(xì)菌豐度則呈現(xiàn)出上升的趨勢(shì),并在后熟期達(dá)到最大占比54.72%。在屬水平上,Rummeliibacillus屬、賴氨酸芽孢桿菌屬和芽孢桿菌屬的細(xì)菌豐度在滿袋... 

【文章來(lái)源】：福建農(nóng)林大學(xué)福建省

【文章頁(yè)數(shù)】：72 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

斑玉蕈樣品HMPM:平板菌絲；HMCK:空白菌包；HMBH:半袋期；HMBF:滿袋期；HMBm:后熟期

斑玉蕈不同生長(zhǎng)階段細(xì)菌特性分析及功能研究13417個(gè)屬、289個(gè)種。不同樣品OTU數(shù)量分布如圖2-2所示。平板菌絲樣品中OTU數(shù)量最多，共有495個(gè)OTUs，顯著多于不同生長(zhǎng)階段菌包樣品的OTU數(shù)量。半袋期、滿袋期和后熟期的OTU數(shù)量呈現(xiàn)上升趨勢(shì)，但樣品之間差異不顯著。圖2-2樣品中OTU數(shù)量分布圖Fig.2-2OTUdistributionsofthesamples注：不同小寫(xiě)字母表示不同樣品分組之間差異顯著(P<0.05)Note:Differentlowercaselettersindicatedthattherewassignificantdifferenceamongthegroupsofdifferentsamples(P<0.05)3.2稀釋性曲線分析稀釋性曲線是用于驗(yàn)證測(cè)序數(shù)據(jù)量是否足以反映樣品中的物種多樣性。如圖2-3所示，除了空白菌包樣品，其他4組樣品的稀釋曲線均呈先上升后趨向平緩的趨勢(shì)，說(shuō)明這4組樣品取樣合理，能夠比較真實(shí)地反映樣品中細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)組成。空白菌包樣品的稀釋性曲線仍處于上升狀態(tài)，說(shuō)明更多的數(shù)據(jù)量還會(huì)產(chǎn)生新的OTU，因此該樣品在反映真實(shí)OTU情況上可能存在一定的偏差，推測(cè)可能是由于空白菌包內(nèi)細(xì)菌含量較少，加上樣品總DNA提取過(guò)程中受栽培料基質(zhì)影響較大的原因，使得提取的DNA含量不能滿足一次測(cè)序需求。

第二章斑玉蕈不同生長(zhǎng)時(shí)期細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和多樣性分析14圖2-397%相似水平下樣品的稀釋曲線Fig.2-3Rarefactioncurvesatthe97%similaritylevel3.3斑玉蕈平板菌絲及不同生長(zhǎng)階段菌包內(nèi)細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)及變化在門(mén)分類水平上（圖2-4），5個(gè)樣品共檢測(cè)到34個(gè)細(xì)菌門(mén)，優(yōu)勢(shì)菌門(mén)依次是厚壁菌門(mén)Firmicutes（63.89%）、變形菌門(mén)Proteobacteria（30.63%）、擬桿菌門(mén)Bacteroidetes（2.61%）、放線菌門(mén)Actinobacteria（1.26%）、綠彎菌門(mén)Chloroflexi（0.40%）、酸桿菌門(mén)Acidobacteria（0.37%）、藍(lán)細(xì)菌門(mén)Cyanobacteria（0.35%）、綠彎菌門(mén)Chloroflexi（0.40%）、芽單胞菌門(mén)Gemmatimonadetes（0.08%）、疣微菌門(mén)Verrucomicrobia（0.16%）和梭桿菌門(mén)Fusobacteria（0.19%）。在這十個(gè)細(xì)菌門(mén)中，僅放線菌門(mén)和厚壁菌門(mén)屬于革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌，其余菌門(mén)均屬于革蘭氏陰性細(xì)菌。厚壁菌門(mén)在半袋期、滿袋期和后熟期的細(xì)菌豐度占比分別為99.89%、95.53%、44.08%，隨著菌包內(nèi)菌絲的生長(zhǎng)呈現(xiàn)下降趨勢(shì)。變形菌門(mén)在半袋期、滿袋期和后熟期的細(xì)菌豐度占比分別為0%、4.41%、54.72%，隨著菌包內(nèi)菌絲的生長(zhǎng)呈現(xiàn)上升趨勢(shì)。厚壁菌門(mén)中，細(xì)菌主要集中在芽孢桿菌綱Bacilli（58.26%）。變形菌門(mén)中的細(xì)菌主要集中在γ-變形菌綱Gammaproteobacteria（26.73%）、α-變形菌綱Alphaproteobacteria（1.90%）、β-變形菌綱Betaproteobacteria（1.38%）和δ-變形菌綱Deltaproteobacteria（0.4%），其中γ-變形菌綱作為變形菌門(mén)中的主要優(yōu)勢(shì)菌綱，其主要集中于腸桿菌目Enterobacteriales（21.04%）。此外，對(duì)比不同樣品間門(mén)水平上的細(xì)菌群落分布，發(fā)現(xiàn)平板菌絲中的菌門(mén)種類多于不同生長(zhǎng)階段


本文編號(hào)：3543021