基于SSR標記的香蕉品種指紋圖譜及ID構建
發(fā)布時間:2021-11-26 00:52
在熱帶和亞熱帶地區(qū),香蕉(Musa spp.)既是重要的經(jīng)濟作物也是重要的糧食作物,香蕉產(chǎn)業(yè)也是我國的農(nóng)業(yè)支柱產(chǎn)業(yè)之一。高效培育優(yōu)質、豐產(chǎn)和抗病性強的香蕉新品種是香蕉產(chǎn)業(yè)的關鍵所在。而利用分子標記輔助育種可以很大程度地提高育種效率。當前香蕉育種面臨的最大的問題是種質資源的遺傳背景不清,加上主栽品種單性結實、高度不育和復雜的基因組倍性水平等特點,導致育種親本選擇很困難。因此加快香蕉種質資源的鑒定是香蕉育種的基礎。本研究通過利用16個香蕉品種對前期獲得的SSR引物進一步篩選,根據(jù)SSR引物多態(tài)性、穩(wěn)定性、條帶的清晰度及特異性引物的潛力等共篩選出29對多態(tài)性較好SSR引物,再利用這29對引物對66個香蕉品種分別進行一代毛細管電泳和基于二代測序的SSR分析。將毛細管電泳結果進行數(shù)據(jù)處理和整合分析,對66個香蕉品種聚類,建立了42個香蕉品種的SSR指紋圖譜庫及ID。并對基于二代測序的SSR標記輔助鑒定進行了探究。主要結果如下:(1)利用16個香蕉品種,對前期已發(fā)表和初步篩選獲得的117對引物進行進一步篩選,選擇適用于香蕉SSR指紋圖譜庫建庫的SSR引物,共計29對SSR引物用于下一步的香蕉品種指...
【文章來源】:江西農(nóng)業(yè)大學江西省
【文章頁數(shù)】:64 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
RFLP實驗原理
圖 2.1 引物 B34 聚丙烯酰胺凝膠電泳圖Fig. 2.1 polyacrylamide gel electrophoresis of primer B34圖 2.2 引物 ITBB01 聚丙烯酰胺凝膠電泳圖Fig. 2.2 polyacrylamide gel electrophoresis of primer ITBB01注:圖 2.1 和圖 2.2 從左到右用于本實驗的香蕉品種為:巴西、桂蕉 1 號、桂蕉 6 號、南天黃、
第二章 基于聚丙烯酰胺凝膠電泳的 SSR 標記篩選后期的樣品檢測。如圖 2.1,B34 具有作為 Z9 的特異性引物的潛力。圖 2.2,ITBB01的條帶清晰,位點多,多態(tài)信息含量高,PIC=0.9278。表 2.3 為篩選出 29 對具有較好多態(tài)性的 SSR 引物的序列信息,重復單元等信息。圖 2.1 引物 B34 聚丙烯酰胺凝膠電泳圖Fig. 2.1 polyacrylamide gel electrophoresis of primer B34
【參考文獻】:
期刊論文
[1]“Gros Michel”香蕉胚性細胞懸浮系及遺傳轉化體系的建立[J]. 邵秀紅,吳少平,竇同心,鄧貴明,盛鷗,畢方鋮,胡春華,易干軍,楊喬松. 分子植物育種. 2019(03)
[2]香蕉黑條葉斑病的防治藥效試驗[J]. 郭濤,黃琦,韋寶義,李成林,王忠文. 廣西植保. 2018(03)
[3]植物品種SSR指紋分析專用軟件SSR Analyser的研發(fā)[J]. 王鳳格,李欣,楊揚,易紅梅,江彬,張憲晨,霍永學,朱麗,葛建镕,王蕊,任潔,王璐,田紅麗,趙久然. 中國農(nóng)業(yè)科學. 2018(12)
[4]適于二堿基重復類型SSR引物指紋分析的連續(xù)多峰算法[J]. 王鳳格,李欣,易紅梅,江彬,任潔,王璐,霍永學,王蕊,葛建镕,楊楊,趙久然. 農(nóng)業(yè)生物技術學報. 2018(06)
[5]利用4-香豆酸:CoA連接酶基因Mu4CL15提高香蕉植株的倒伏抗性[J]. 常勝合,孫威,許桂鶯,魏卿,李敬陽,舒海燕. 分子植物育種. 2017(12)
[6]抗枯萎病香蕉新品種‘南天黃’選育[J]. 許林兵,張錫炎,李華平,陳彪,黃秉智,陳維信,馮巖,肖維強,周登博,甘東泉. 熱帶作物學報. 2017(06)
[7]中國香蕉生產(chǎn)布局的時空演變分析[J]. 顧天竹,周啟凡. 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2017(05)
[8]香蕉CRISPR/Cas9基因編輯技術體系的建立[J]. 胡春華,鄧貴明,孫曉玄,左存武,李春雨,鄺瑞彬,楊喬松,易干軍. 中國農(nóng)業(yè)科學. 2017(07)
[9]廣西香蕉種質資源的SSR分析[J]. 孫嘉曼,尹玲,張進忠,韋紹龍,李朝生,劉金成,盧江. 西南農(nóng)業(yè)學報. 2016(08)
[10]香蕉抗(耐)枯萎病新品種桂蕉9號的選育及其高產(chǎn)栽培技術[J]. 韋紹龍,黃素梅,韋莉萍,韋弟,李朝生,覃柳燕,田丹丹,張進忠,周維,龍盛風,楊柳. 南方農(nóng)業(yè)學報. 2016(04)
博士論文
[1]SSR分子標記開發(fā)和在香蕉種質資源遺傳分析中的應用[D]. 王靜毅.海南大學 2010
碩士論文
[1]應用SSR技術研究香蕉種質資源的遺傳多樣性[D]. 林丹鑾.江西農(nóng)業(yè)大學 2017
[2]香蕉種質資源基因組類型的分子標記及倍性鑒定[D]. 閆佼.江西農(nóng)業(yè)大學 2016
[3]棉花品種的SSR標記鑒定及身份證構建[D]. 張小娟.安徽農(nóng)業(yè)大學 2014
[4]芭蕉—中國園林藝術表現(xiàn)的國粹形態(tài)[D]. 丁杰.江西師范大學 2012
[5]香蕉(Musa spp.)種質資源的核型分析和變異的鑒定、篩選[D]. 勞世輝.西南大學 2011
[6]太湖地區(qū)水稻地方品種品質基因多樣性及部分淀粉品質性狀與SSR標記的關聯(lián)研究[D]. 崔小芬.揚州大學 2011
[7]EMS誘變南高叢越橘(Vaccinium L.)及抗旱變異體的篩選[D]. 張敏.西南大學 2011
[8]農(nóng)桿菌介導的巴西蕉橫切薄片遺傳轉化體系研究[D]. 黃通謀.海南大學 2010
[9]中國主要蕉類形態(tài)學與分子系統(tǒng)學研究[D]. 姜燕.西南農(nóng)業(yè)大學 2005
[10]基于SSR標記的玉米品種DNA指紋圖譜的構建[D]. 佘花娣.河北農(nóng)業(yè)大學 2004
本文編號:3519107
【文章來源】:江西農(nóng)業(yè)大學江西省
【文章頁數(shù)】:64 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
RFLP實驗原理
圖 2.1 引物 B34 聚丙烯酰胺凝膠電泳圖Fig. 2.1 polyacrylamide gel electrophoresis of primer B34圖 2.2 引物 ITBB01 聚丙烯酰胺凝膠電泳圖Fig. 2.2 polyacrylamide gel electrophoresis of primer ITBB01注:圖 2.1 和圖 2.2 從左到右用于本實驗的香蕉品種為:巴西、桂蕉 1 號、桂蕉 6 號、南天黃、
第二章 基于聚丙烯酰胺凝膠電泳的 SSR 標記篩選后期的樣品檢測。如圖 2.1,B34 具有作為 Z9 的特異性引物的潛力。圖 2.2,ITBB01的條帶清晰,位點多,多態(tài)信息含量高,PIC=0.9278。表 2.3 為篩選出 29 對具有較好多態(tài)性的 SSR 引物的序列信息,重復單元等信息。圖 2.1 引物 B34 聚丙烯酰胺凝膠電泳圖Fig. 2.1 polyacrylamide gel electrophoresis of primer B34
【參考文獻】:
期刊論文
[1]“Gros Michel”香蕉胚性細胞懸浮系及遺傳轉化體系的建立[J]. 邵秀紅,吳少平,竇同心,鄧貴明,盛鷗,畢方鋮,胡春華,易干軍,楊喬松. 分子植物育種. 2019(03)
[2]香蕉黑條葉斑病的防治藥效試驗[J]. 郭濤,黃琦,韋寶義,李成林,王忠文. 廣西植保. 2018(03)
[3]植物品種SSR指紋分析專用軟件SSR Analyser的研發(fā)[J]. 王鳳格,李欣,楊揚,易紅梅,江彬,張憲晨,霍永學,朱麗,葛建镕,王蕊,任潔,王璐,田紅麗,趙久然. 中國農(nóng)業(yè)科學. 2018(12)
[4]適于二堿基重復類型SSR引物指紋分析的連續(xù)多峰算法[J]. 王鳳格,李欣,易紅梅,江彬,任潔,王璐,霍永學,王蕊,葛建镕,楊楊,趙久然. 農(nóng)業(yè)生物技術學報. 2018(06)
[5]利用4-香豆酸:CoA連接酶基因Mu4CL15提高香蕉植株的倒伏抗性[J]. 常勝合,孫威,許桂鶯,魏卿,李敬陽,舒海燕. 分子植物育種. 2017(12)
[6]抗枯萎病香蕉新品種‘南天黃’選育[J]. 許林兵,張錫炎,李華平,陳彪,黃秉智,陳維信,馮巖,肖維強,周登博,甘東泉. 熱帶作物學報. 2017(06)
[7]中國香蕉生產(chǎn)布局的時空演變分析[J]. 顧天竹,周啟凡. 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2017(05)
[8]香蕉CRISPR/Cas9基因編輯技術體系的建立[J]. 胡春華,鄧貴明,孫曉玄,左存武,李春雨,鄺瑞彬,楊喬松,易干軍. 中國農(nóng)業(yè)科學. 2017(07)
[9]廣西香蕉種質資源的SSR分析[J]. 孫嘉曼,尹玲,張進忠,韋紹龍,李朝生,劉金成,盧江. 西南農(nóng)業(yè)學報. 2016(08)
[10]香蕉抗(耐)枯萎病新品種桂蕉9號的選育及其高產(chǎn)栽培技術[J]. 韋紹龍,黃素梅,韋莉萍,韋弟,李朝生,覃柳燕,田丹丹,張進忠,周維,龍盛風,楊柳. 南方農(nóng)業(yè)學報. 2016(04)
博士論文
[1]SSR分子標記開發(fā)和在香蕉種質資源遺傳分析中的應用[D]. 王靜毅.海南大學 2010
碩士論文
[1]應用SSR技術研究香蕉種質資源的遺傳多樣性[D]. 林丹鑾.江西農(nóng)業(yè)大學 2017
[2]香蕉種質資源基因組類型的分子標記及倍性鑒定[D]. 閆佼.江西農(nóng)業(yè)大學 2016
[3]棉花品種的SSR標記鑒定及身份證構建[D]. 張小娟.安徽農(nóng)業(yè)大學 2014
[4]芭蕉—中國園林藝術表現(xiàn)的國粹形態(tài)[D]. 丁杰.江西師范大學 2012
[5]香蕉(Musa spp.)種質資源的核型分析和變異的鑒定、篩選[D]. 勞世輝.西南大學 2011
[6]太湖地區(qū)水稻地方品種品質基因多樣性及部分淀粉品質性狀與SSR標記的關聯(lián)研究[D]. 崔小芬.揚州大學 2011
[7]EMS誘變南高叢越橘(Vaccinium L.)及抗旱變異體的篩選[D]. 張敏.西南大學 2011
[8]農(nóng)桿菌介導的巴西蕉橫切薄片遺傳轉化體系研究[D]. 黃通謀.海南大學 2010
[9]中國主要蕉類形態(tài)學與分子系統(tǒng)學研究[D]. 姜燕.西南農(nóng)業(yè)大學 2005
[10]基于SSR標記的玉米品種DNA指紋圖譜的構建[D]. 佘花娣.河北農(nóng)業(yè)大學 2004
本文編號:3519107
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